diff --git a/freyja/_cli.py b/freyja/_cli.py index 22b2db54..9e59af62 100644 --- a/freyja/_cli.py +++ b/freyja/_cli.py @@ -224,15 +224,16 @@ def update(outdir, noncl, buildlocal): os.path.join(locDir, 'usher_barcodes.feather')) dictMuts = {} - for lin in df.index: - muts = sorted([df.columns[m0] for m0, v in enumerate(df.loc[lin]) - if v > 0], key=sortFun) + for lin in df_barcodes.index: + muts = sorted([df_barcodes.columns[m0] + for m0, v in enumerate(df_barcodes.loc[lin]) + if v > 0], key=sortFun) dictMuts[lin] = muts import json jpath = os.path.join(locDir, "lineage_mutations.json") with open(jpath, "w") as outfile: - json.dump(dictMuts, outfile) + json.dump(dictMuts, outfile, indent=4) # delete files generated along the way that aren't needed anymore print('Cleaning up') @@ -310,7 +311,7 @@ def barcode_build(pb, outdir, noncl): import json jpath = os.path.join(locDir, "lineage_mutations.json") with open(jpath, "w") as outfile: - json.dump(dictMuts, outfile) + json.dump(dictMuts, 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"C6312A", + "C13730T", + "C19524T", + "C23929T", + "C28311T" + ], + "B.4.1": [ + "C884T", + "G1397A", + "C4234T", + "G8653T", + "T16272G", + "C17141A", + "T28688C", + "G29742T" + ], + "B.4.8": [ + "G1397A", + "C4784T", + "T17139A", + "T21087C", + "A23403G", + "G25726T", + "A26059G", + "T28297C", + "T28688C", + "C28932T", + "G29742T" + ], + "B.1.103": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "C25665T", + "G28325T" + ], + "B.1.535": [ + "C241T", + "C3037T", + "A9301G", + "A9409G", + "C14408T", + "A23403G" + ], + "B.1.227": [ + "C241T", + "C3037T", + "T8063G", + "C14408T", + "A23403G", + "G26158T" + ], + "B.1.203": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "C15613T", + "G16065A", + "A23403G", + "G26143A" + ], + "B.1.137": [ + "C241T", + "C3037T", + "G3518T", + "C13536T", + "C14408T", + "A23403G" + ], + "B.1.220": [ + "C241T", + "C3037T", + "T10561C", + "C14408T", + "C15324T", + "A23403G" + ], + "B.1.387": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "C15324T", + "A15860G", + "A23403G" + ], + "B.1.211": [ + "C241T", + "A618G", + "C3037T", + "C14408T", + "C15324T", + "A23403G" + ], + "B.1.83": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "C15324T", + "A23403G", + "A28765G" + ], + "B.1.178": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "C15324T", + "A23403G", + "G28202A" + ], + "B.1.529": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "C15324T", + "A23403G", + "T23599G", + "C24319T", + "C27155T" + ], + "B.1.147": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "C15324T", + "A23403G", + "C25433T" + ], + "B.1.213": [ + "C241T", + "C3037T", + "A7031G", + "G13617T", + "C14408T", + "C15324T", + "A23403G" + ], + "B.1.6": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "C15277T", + "C15324T", + "A23403G" + ], + "B.1.212": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "C15324T", + "C16428T", + "A23403G" + ], + "B.1.208": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "C15324T", + "C16762T", + "A23403G" + ], + "B.1.151": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "C15324T", + "C18904T", + "A23403G", + "G25606T" + ], 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"A23403G", + "G25429T" + ], + "B.1.559": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "G17278T", + "A23403G", + "G25429T" + ], + "B.1.391": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "C16289T", + "A23403G", + "G25429T" + ], + "B.1.104": [ + "C241T", + "C3037T", + "C13730T", + "C14408T", + "A23403G", + "G25429T" + ], + "B.1.248": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "G25429T", + "A28841G" + ], + "B.1.251": [ + "C241T", + "G1141T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "G25429T" + ], + "B.1.250": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "G25429T", + "C28045T" + ], + "B.1.252": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "G25429T", + "G29474T" + ], + "B.1.254": [ + "C241T", + "C3037T", + "A10874G", + "C14408T", + "A23403G", + "G25429T", + "T26677C" + ], + "B.1.110": [ + "C241T", + "C3037T", + "C8389T", + "C14408T", + "A23403G", + "G25563T" + ], + "B.1.382": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "C16830T", + "G21718T", + "A23403G", + "C28869T" + ], + "B.1.547": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "G15202T", + "T22288A", + "A23403G" + ], + "B.1.182": [ + "C241T", + "C3037T", + "T6294C", + "C14408T", + "A20268G", + "A23403G" + ], + "B.1.180": [ + "C241T", + "C3037T", + "T9697C", + "C14408T", + "A20268G", + "A23403G" + ], + "B.1.157": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "T17126C", + "A20268G", + "A23403G" + ], + "B.1.192": [ + "C241T", + "C3037T", + "C11833T", + "C14408T", + "A20268G", + "A23403G" + ], + "B.1.420": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "A20268G", + "A23403G", + "T23443C" + ], + "B.1.181": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "A20268G", + "A23403G", + "C29370G" + ], + "B.1.223": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "G15438T", + "A20268G", + "A23403G" + ], + "B.1.225": [ + "C241T", + "C3037T", + "C12915T", + "C14408T", + "A20268G", + "A23403G" + ], + "B.1.609": [ + "C241T", + "C3037T", + "C4582T", + "C14408T", + "A20268G", + "A23403G" + ], + "B.1.381": [ + "C241T", + "C355T", + "C3037T", + "C4093T", + "C14408T", + "A20268G", + "A23403G" + ], + "A.17": [ + "C8782T", + "A18399G", + "C25549T", + "G25740T", + "G25947T", + "T28144C", + "C29095T" + ], + "A.7": [ + "C2143T", + "C8782T", + "G22468T", + "T28144C", + "G28326T", + "G28878A", + "G29742A" + ], + "A.9": [ + "C7945T", + "C8782T", + "G22468T", + "T28144C", + "G28878A", + "G29742A" + ], + "A.21": [ + "C8782T", + "C10138T", + "G11417T", + "G23402A", + "G25687T", + "T28144C", + "G28878A", + "G29742A" + ], + "B.6.4": [ + "C6310A", + "C6312A", + "C12400T", + "C13730T", + "C19524T", + "C23929T", + "C28311T" + ], + "B.4.4": [ + "A1079C", + "G1397A", + "C9319T", + "C19862T", + "T27384C", + "T28688C", + "G29742T" + ], + "B.4.7": [ + "C884T", + "G1397A", + "G8653T", + "A19073G", + "G27915T", + "T28688C", + "C29077T", + "G29742T" + ], + "B.1.219": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "C15324T", + "C16193T", + "A22404T", + "A23403G" + ], + "B.1.146": [ + "C241T", + "C3037T", + "C10833T", + "C14408T", + "C15324T", + "A23403G", + "G28747T", + "G28917T", + "G29543T" + ], + "B.1.214": [ + "C241T", + "C3037T", + "A4457G", + "C5907T", + "C12312T", + "C14408T", + "C15324T", + "A23403G", + "C28887T" + ], + "B.1.96": [ + "C241T", + "C3037T", + "G11596T", + "C14408T", + "G20568A", + "A23403G", + "A26530G" + ], + "B.1.552": [ + "C241T", + "C3037T", + "C4540T", + "G4904T", + "G5206T", + "C14408T", + "A23403G", + "C24138T", + "C25350T" + ], + "B.1.131": [ + "C241T", + "A1610G", + "C3037T", + "C9344T", + "C13335T", + "C14408T", + "A23403G", + "C28887T" + ], + "B.1.393": [ + "C241T", + "C3037T", + "A5040G", + "C14408T", + "A23403G", + "G29477T", + "C29774T" + ], + "B.1.113": [ + "C241T", + "C2836T", + "C3037T", + "C14408T", + "C18568T", + "A23403G", + "C29750T" + ], + "B.1.206": [ + "C241T", + "G2282A", + "C3037T", + "T9742C", + "C14408T", + "C17639T", + "A23403G" + ], + "B.1.126": [ + "C241T", + "T3011C", + "C3037T", + "C14408T", + "G22205T", + "A23403G", + "T28853G" + ], + "B.1.77": [ + "C241T", + "C3037T", + "G3338T", + "C3511T", + "C14408T", + "A22301G", + "A23403G", + "G29508A" + ], + "B.1.249": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "G21538T", + "G22332A", + "A23403G", + "G25429T" + ], + "B.1.110.3": [ + "C241T", + "C3037T", + "C8389T", + "C14408T", + "A23403G", + "G25563T", + "G27915A" + ], + "B.1.110.2": [ + "C241T", + "C3037T", + "C8389T", + "C14408T", + "A23403G", + "C23453T", + "G25563T" + ], + "B.1.483": [ + "C241T", + "C2416T", + "C3037T", + "C14408T", + "T15366C", + "A23403G", + "G25563T" + ], + "B.1.479": [ + "C241T", + "C2416T", + "C3037T", + "G10631T", + "C14408T", + "A23403G", + "G25563T" + ], + "B.1.37": [ + "C241T", + "C2416T", + "C3037T", + "C10712T", + "C14408T", + "A23403G", + "G25563T" + ], + "B.1.13": [ + "C241T", + "C2416T", + "C3037T", + "C14408T", + "G20578T", + "A23403G", + "G25563T" + ], + "B.1.274": [ + "C241T", + "A716G", + "C2416T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "G25563T" + ], + "B.1.277": [ + "C241T", + "C2416T", + "C3037T", + "C14408T", + "C19884T", + "A23403G", + "G25563T" + ], + "B.1.270": [ + "C241T", + "C2416T", + "C2919T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "G25563T" + ], + "B.1.273": [ + "C241T", + "C2416T", + "C3037T", + "C13458T", + "C14408T", + "A23403G", + "G25563T" + ], + "B.1.112": [ + "C241T", + "C3037T", + "A6512C", + "C14408T", + "C18877T", + "A23403G", + "G25563T" + ], + "B.1.163": [ + "C241T", + "C3037T", + "G10793T", + "C14408T", + "C18877T", + "A23403G", + "G25563T" + ], + "B.1.439": [ + "C241T", + "T1918C", + "C3037T", + "C14408T", + "C18877T", + "A23403G", + "G25563T" + ], + "B.1.161": [ + "C241T", + "C3037T", + "C11563T", + "C14408T", + "C18877T", + "A23403G", + "G25563T" + ], + "B.1.245": [ + "C241T", + "A1096G", + "C3037T", + "C14408T", + "C18877T", + "A23403G", + "G25563T" + ], + "B.1.442": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "C18877T", + "A23403G", + "G25563T", + "G28086T" + ], + "B.1.436": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "C18877T", + "A23403G", + "G25563T", + "C28890T", + "T29710A" + ], + "B.1.124": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "C16376T", + "C18877T", + "A23403G", + "G25563T" + ], + "B.1.473": [ + "C241T", + "C3037T", + "C4543T", + "C14408T", + "C18877T", + "A23403G", + "G25563T" + ], + "B.1.111": [ + "C241T", + "C3037T", + "C10507T", + "C14408T", + "C18877T", + "A23403G", + "G25563T" + ], + "B.1.164": [ + "C241T", + "A1202G", + "C3037T", + "C14408T", + "C18877T", + "A23403G", + "G25563T" + ], + "B.1.170": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "C18877T", + "A23403G", + "G25563T", + "C28977T" + ], + "B.1.162": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "T15354C", + "C18877T", + "A23403G", + "G25563T" + ], + "B.1.22": [ + "C241T", + "C1594T", + "C3037T", + "C11109T", + "C14408T", + "A23403G", + "G25563T" + ], + "B.1.543": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "C21846A", + "A23403G", + "G25913A", + "C26447T", + "T26460C" + ], + "B.1.639": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "T22020C", + "C22995A", + "G23012A", + "A23403G", + "C24138A", + "G24368T", + "T27919C", + "A28271G", + "A28742G" + ], + "B.1.1": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.267": [ + "C241T", + "C1059T", + "C3037T", + "A8252G", + "C14408T", + "A23403G", + "G25563T" + ], + "B.1.315": [ + "C241T", + "C1059T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "A24129G", + "G25563T" + ], + "B.1.115": [ + "C241T", + "C1059T", + "C3037T", + "G7295T", + "C14408T", + "A23403G", + "G25563T" + ], + "B.1.167": [ + "C241T", + "C1059T", + "C3037T", + "C5312T", + "C14408T", + "A23403G", + "G25563T" + ], + "B.1.323": [ + "C241T", + "C1059T", + "C3037T", + "T9070C", + "C14408T", + "A23403G", + "G25563T" + ], + "B.1.294": [ + "C241T", + "C1059T", + "C3037T", + "C14408T", + "A19899T", + "A21464G", + "A23403G", + "G25563T" + ], + "B.1.564": [ + "C241T", + "C1059T", + "C3037T", + "C14408T", + "C16260T", + "A23403G", + "G25563T" + ], + "B.1.38": [ + "C241T", + "C1059T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "G25523T", + "G25563T", + "T27869C" + ], + "B.1.413": [ + "C241T", + "C1059T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "G25563T", + "C26625T" + ], + "B.1.360": [ + "C241T", + "C1059T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "G25563T", + "C27847T" + ], + "B.1.576": [ + "C241T", + "C335T", + "C1059T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "G25563T" + ], + "B.1.264": [ + "C241T", + "C1059T", + "C3037T", + "C11919T", + "C14408T", + "A23403G", + "G25563T" + ], + "B.1.321": [ + "C241T", + "C1059T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "G25563T", + "G29291A" + ], + "B.1.350": [ + "C241T", + "C1059T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "G25217T", + "G25563T" + ], + "B.1.166": [ + "C241T", + "C1059T", + "C1887T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "G25563T" + ], + "B.1.319": [ + "C241T", + "C1059T", + "C3037T", + "C10851T", + "C14408T", + "A23403G", + "G25563T" + ], + "B.1.487": [ + "C241T", + "C1059T", + "C1734T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "G25563T" + ], + "B.1.513": [ + "C241T", + "C1059T", + 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"C3037T", + "C14408T", + "A20268G", + "A23403G", + "C28833T" + ], + "B.1.416.1": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "A20268G", + "A23403G", + "C25731T", + "C28833T" + ], + "B.1.418": [ + "C241T", + "C3037T", + "C6472T", + "C7815T", + "C14408T", + "A20268G", + "A23403G" + ], + "B.1.233": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "A20268G", + "A23403G", + "C28854T", + "C29274A" + ], + "B.1.229": [ + "C241T", + "C3037T", + "G7798T", + "C14408T", + "A20268G", + "A23403G", + "C28854T" + ], + "B.1.556": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "C18060A", + "A20268G", + "A23403G", + "C28854T", + "G29374T" + ], + "B.1.237": [ + "C241T", + "G2164C", + "C3037T", + "C14408T", + "A20268G", + "A23403G", + "C28854T" + ], + "B.1.232": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "A20268G", + "A23403G", + "G27987T", + "C28854T" + ], + "B.1.243": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "A20268G", + "A23403G", + "T24076C", + "C28854T" + ], + "B.1.239": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "G16741A", + "A20268G", + "A23403G", + "C28854T" + ], + "B.1.397": [ + "C241T", + "G1135T", + "C3037T", + "C14408T", + "A20268G", + "A23403G", + "C28854T" + ], + "B.1.400": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "G19969A", + "A20268G", + "A23403G", + "C28854T" + ], + "B.1.238": [ + "C241T", + "C3037T", + "C8683T", + "C14408T", + "A20268G", + "A23403G", + "C28854T" + ], + "B.1.558": [ + "C241T", + "C1288T", + "C3037T", + "C14408T", + "A20268G", + "A23403G", + "C28854T" + ], + "B.1.399": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "A20268G", + "A23403G", + "C28854T", + "C28887T" + ], + "B.1.401": [ + "G208T", + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "A20268G", + "A23403G", + "C28854T" + ], + "B.1.241": [ + "C241T", + "C3037T", + "C11575T", + "C14408T", + "A20268G", + "A23403G", + "C28854T" + ], + "B.1.415": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "G15732T", + "T19143C", + "A20268G", + "A23403G" + ], + "A.6": [ + "A895G", + "C2942T", + "G4390T", + "C8782T", + "C9598T", + "G20134T", + "G24047A", + "T28144C" 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"G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.192": [ + "C241T", + "C673T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.34": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "G16853T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.135": [ + "C241T", + "C3037T", + "C10376T", + "C14408T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.28": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "G25088T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.277": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C", + "C29095T" + ], + "B.1.1.254": [ + "C241T", + "C1427T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.166": [ + "C241T", + "C3037T", + "C11653T", + "C14408T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.274": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "G25912T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.180": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "T22843C", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.253": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "T19893C", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.372": [ + "C241T", + "C3037T", + "G10097A", + "C14408T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.447": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C", + "G29395A" + ], + "B.1.1.43": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "G26615T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.122": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "C21621T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.164": [ + "C241T", + "G2164A", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.200": [ + "C241T", + "C3037T", + "G3896T", + "C14408T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.137": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "C18713T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.198": [ + "C241T", + "C3037T", + "C3261T", + "C14408T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.173": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "G20931A", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.134": [ + "C241T", + "C3037T", + "C6582T", + "C14408T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.59": [ + "C241T", + "C2638T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.367": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "C19011T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.118": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "C23481T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.148": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "C20474T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.12": [ + "C241T", + "C3037T", + "T3163C", + "C14408T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.168": [ + "C241T", + "C3037T", + "C3177T", + "C14408T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.26": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "G16813A", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.485": [ + "C241T", + "C745T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.25": [ + "C241T", + "A1163T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.378": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C", + "C29284T" + ], + "B.1.1.440": [ + "C241T", + "C3037T", + "T6304G", + "C14408T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.438": [ + "C241T", + "G1421A", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.169": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "T18231C", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.463": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "A22759G", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.402": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "C16163T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.174": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "G28378T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.185": [ + "C241T", + "C3037T", + "C7095T", + "C14408T", + "A16179G", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.99": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "C28005T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.129": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "G27415T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.462": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "G23311T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.57": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "C20234T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.121": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "C27538T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.515": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "G19825T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.117": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "C23625T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.127": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "T17694C", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.10": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "C19170T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.448": [ + "C241T", + "C3037T", + "T12503C", + "C14408T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.398": [ + "C241T", + "C3037T", + "C5806T", + "C14408T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.376": [ + "C241T", + "C3037T", + "G11596T", + "C14408T", + "A23403G", + "G28881A", + 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"G28883C" + ], + "B.1.1.208": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "C19140T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.61": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "G18898T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.231": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "A25505C", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.107": [ + "C241T", + "C3037T", + "C3486A", + "C14408T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.89": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "G27281T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.533": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "G25563T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.101": [ + "C241T", + "C3037T", + "G8371T", + "C14408T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.87": [ + "C241T", + "C3037T", + "C3686T", + "T10567C", + "C14408T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.13": [ + "C241T", + "C3037T", + "G4207T", + "C14408T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.194": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "G24781T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.342": [ + "C241T", + "C1059T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "G25563T", + "A25864G", + "G25922T", + "C26010T", + "C28887T" + ], + "B.1.359": [ + "C241T", + "C1059T", + "C3037T", + "C11916T", + "C14408T", + "A23403G", + "G25563T", + "G28376T" + ], + "B.1.493": [ + "C241T", + "C1059T", + "C3037T", + "C11916T", + "C14408T", + "A23403G", + "G25563T", + "G26020T" + ], + "B.1.495": [ + "C241T", + "C1059T", + "C3037T", + "C11916T", + "C14408T", + "A23403G", + "G25563T", + "G28027T", + "G29742T" + ], + "B.1.604": [ + "C241T", + "C1059T", + "C3037T", + "C11916T", + "C14408T", + "A21245G", + "A23403G", + "G25563T", + "C28767T", + "G28917T" + ], + "B.1.518": [ + "C241T", + "C1059T", + "C3037T", + "C14408T", + "T21294A", + "G21295A", + "G21296A", + "A23403G", + "G25563T" + ], + "B.1.437": [ + "C241T", + "C1059T", + "G1298A", + "C3037T", + "G12694A", + "C14408T", + "A23403G", + "G25563T" + ], + "B.1.318": [ + "C241T", + "C1059T", + "C2536T", + "C3037T", + "C10376T", + "C14408T", + "C14931T", + "A23403G", + "C24082T", + "G25563T", + "C27005T", + "A28880G" + ], + "B.1.369": [ + "C241T", + "C1059T", + "C3037T", + "C14408T", + "C16260T", + "A23403G", + "G25563T", + "C28821A" + ], + "B.1.287": [ + "C241T", + "C1059T", + "C3037T", + "C14408T", + "C20555T", + "C21772T", + "A23403G", + "G25563T" + ], + "B.1.515": [ + "C241T", + "C1059T", + "C3037T", + "C14408T", + "T20049C", + "C21627A", + "A23403G", + "C23655T", + "G25563T" + ], + "B.1.366": [ + "C241T", + "C1059T", + "C3037T", + "T8041C", + "C14408T", + "G22225T", + "A23403G", + "G25563T" + ], + "B.1.117": [ + "C241T", + "C1059T", + "C1968T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "G25563T", + "G29705T" + ], + "B.1.452": [ + "C241T", + "C1059T", + "C3037T", + "C3602T", + "C14408T", + "C16762T", + "A23403G", + "G25563T" + ], + "B.1.350.1": [ + "C241T", + "T484C", + "C1059T", + "C3037T", + "A14199T", + "C14408T", + "A23403G", + "G23593T", + "T24529C", + "G25217T", + "G25563T", + "C29119T" + ], + "B.1.357": [ + "C241T", + "C1059T", + "C1514T", + "C3037T", + "C8078T", + "C14408T", + "A23403G", + "G25563T", + "A28870T" + ], + "B.1.168": [ + "C241T", + "C1059T", + "C3037T", + "C14408T", + "G18213T", + "A18818G", + "A23403G", + "G25563T" + ], + "B.1.451": [ + "C241T", + "C1059T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "G25563T", + "C25658T", + "G29179T" + ], + "B.1.334": [ + "C241T", + "C1059T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "G25563T", + "A28841G", + "C29421T" + ], + "B.1.489": [ + "C241T", + "C1059T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "G24368T", + "C24621T", + "G25563T" + ], + "B.1.432": [ + "C241T", + "C1059T", + "C3037T", + "C14408T", + "G15452T", + "G17151T", + "A23403G", + "G25563T" + ], + "B.1.310": [ + "C241T", + "C1059T", + "C3037T", + "C14408T", + "A20755C", + "A23403G", + "G25563T", + "G25784T" + ], + "B.1.586": [ + "C241T", + "C379A", + "C1059T", + "C3037T", + "C14407T", + "C14408T", + "A23403G", + "G25563T" + ], + "B.1.424": [ + "C241T", + "C1059T", + "G1980A", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "G25563T", + "C27964T" + ], + "B.1.450": [ + "C241T", + "C1059T", + "C3037T", + "C14408T", + "G17808T", + "A23403G", + "G25563T", + "C27964T" + ], + "B.1.301": [ + "C241T", + "C1059T", + "C3037T", + "A7870G", + "C14408T", + "A23403G", + "G25563T", + "C27964T" + ], + "B.1.595": [ + "C241T", + "C1059T", + "C3037T", + "C10319T", + "C14408T", + "A23403G", + "G25563T", + "C27964T" + ], + "B.1.265": [ + "C241T", + "C1059T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "G25563T", + "C27964T", + "C28833T" + ], + "B.1.336": [ + "C241T", + "C1059T", + "C3037T", + "C9967T", + "C14408T", + "A23403G", + "G25563T", + "C27964T" + ], + "B.1.370": [ + "C241T", + "C1059T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "C24378T", + "G25563T", + "C27964T" + ], + "B.1.284": [ + "C241T", + "C1059T", + "C3037T", + "C3045T", + "C14408T", + "A23403G", + "G25563T", + "C27964T" + ], + "B.1.116": [ + "C241T", + "C1059T", + "C3037T", + "C3737T", + "C14408T", + "A23403G", + "G25563T", + "C28854T" + ], + "B.1.306": [ + "C241T", + "C1059T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "G25563T", + "C25777T", + "C29614T" + ], + "B.1.39": [ + "C241T", + "C1059T", + "C3037T", + "T8788C", + "C14408T", + "A23403G", + "G25563T", + "G26951A" + ], + "B.1.349": [ + "C241T", + "C1059T", + "C3037T", + "C14408T", + "C18555T", + "A23403G", + "G25563T", + "C28892T" + ], + "B.1.293": [ + "C241T", + "C1059T", + "C3037T", + "C14408T", + "G15906T", + "C20759T", + "A23403G", + "G25563T" + ], + "B.1.607": [ + "C241T", + "C1059T", + "C3037T", + "C14408T", + "C16260T", + "A23403G", + "G24368T", + "G25563T" + ], + "B.1.490": [ + "C241T", + "C1059T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "G24368T", + "G25563T", + "C28453T" + ], + "B.1.372": [ + "C241T", + "C1059T", 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"C14408T", + "C20233T", + "A23403G", + "G25563T" + ], + "B.1.256": [ + "C241T", + "C3037T", + "C3411T", + "C3885T", + "C14408T", + "C17104T", + "A20268G", + "A23403G", + "G29734C" + ], + "B.1.231": [ + "C241T", + "C841T", + "C1714T", + "C3037T", + "C8092T", + "C14408T", + "A20268G", + "A23403G", + "C28854T" + ], + "B.1.408": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "A20268G", + "A23403G", + "C28854T", + "C29200T", + "C29451T" + ], + "B.1.417": [ + "C241T", + "C3037T", + "T5422C", + "C7051T", + "G7743T", + "C12880T", + "C14408T", + "A20268G", + "A23403G", + "C28854T" + ], + "B.1.240": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "C18486T", + "A20268G", + "T22162C", + "A23403G", + "C28854T" + ], + "B.1.242": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "A16734G", + "A20268G", + "A23403G", + "G24794T", + "C28854T" + ], + "B.1.551": [ + "C241T", + "C3037T", + "C3738T", + "C14408T", + "A20268G", + "A23403G", + "C23604G", + "C28854T" + ], + "B.1.235": [ + "C241T", + "C3037T", + "T5507A", + "C14408T", + "C18788T", + "G19648T", + "A20268G", + "T21158C", + "A23403G", + "C28854T" + ], + "B.1.236": [ + "C241T", + "C3037T", + "G11842A", + "A12759G", + "C14408T", + "G18292T", + "A20268G", + "A23403G", + "C28854T" + ], + "B.1.635": [ + "C241T", + "C3037T", + "A3904T", + "A11430G", + "C14408T", + "A16534G", + "A20268G", + "C21618T", + "C21707T", + "C22338G", + "T22912G", + "G22992A", + "A23403G", + "C26681T", + "G26709A", + "A28273T", + "G28514T", + "G28917T" + ], + "A.2.4": [ + "C8782T", + "T9477A", + "C12815T", + "C14805T", + "G25979T", + "T28144C", + "C28657T", + "C28863T" + ], + "A.19": [ + "A361G", + "C8782T", + "A12820G", + "G22468T", + "A23403G", + "T28144C", + "G28878A", + "G29742A" + ], + "A.4": [ + "C8782T", + "G16381A", + "T17877C", + "C20316T", + "G25500T", + "T28144C", + "G28878A", + "G29742A" + ], + "B.1.214.1": [ + "C241T", + "A481G", + "C3037T", + "A4457G", + "C5144T", + "C5907T", + "C12312T", + "C14408T", + "C15324T", + "C17304G", + "C17999T", + "A23403G", + "C28887T" + ], + "B.1.97": [ + "C241T", + "A2775G", + "C3037T", + "G4255T", + "C13568T", + "C14408T", + "A20355G", + "A23403G", + "A26530G" + ], + "B.1.530": [ + "C241T", + "C3037T", + "A3291G", + "C11050T", + "C14408T", + "G16935T", + "A19339G", + "A23403G", + "C23604A", + "C28887T", + "T29471C" + ], + "B.1.463": [ + "C241T", + "C3037T", + "C3096T", + "C14408T", + "C18877T", + "C22713T", + "A23403G", + "C23996T", + "G25526T", + "G25563T", + "C26735T", + "G28703T" + ], + "B.1.469": [ + "C241T", + "C3037T", + "A12075G", + "C14408T", + "C18877T", + "A23403G", + "G25563T", + "C26735T", + "C28866T" + ], + "B.1.456": [ + "C241T", + "C1102T", + "C3037T", + "G4124A", + "C14408T", + "C18877T", + "A23403G", + "G25563T", + "C26735T", + "C28854T" + ], + "B.1.36": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "C18877T", + "C22444T", + "A23403G", + "G25563T", + "C26735T", + "C28854T" + ], + "B.1.475": [ + "C241T", + "C2416T", + "C3037T", + "G8371T", + "C11020T", + "C14408T", + "A23403G", + "C25416T", + "G25563T", + "G28851T" + ], + "B.1.480": [ + "C241T", + "C875T", + "C2416T", + "C3037T", + "A10904G", + "C14408T", + "A23403G", + "G25249T", + "G25563T", + "C28854T" + ], + "B.1.9": [ + "C241T", + "C2113T", + "C3037T", + "C7765T", + "C14408T", + "C17690T", + "C18877T", + "A23403G", + "G25563T" + ], + "B.1.1.297": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "A20742C", + "A23403G", + "T27922C", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.404": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "G20548T", + "A23403G", + "G26211T", + "C26534T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.154": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "C16101T", + "A18616G", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.158": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "C18086T", + "T19839C", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.3": [ + "C241T", + "C3037T", + "G10262A", + "C14408T", + "T19839C", + "C22995T", + "A23403G", + "A27669G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.75": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "T19839C", + "A23403G", + "C24099T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.5": [ + "C241T", + "C3037T", + "A11839G", + "C14408T", + "T19839C", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.222": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "T19839C", + "A23403G", + "A23756G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.317": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "T19839C", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C", + "C28905T" + ], + "B.1.1.220": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "T19839C", + "A23403G", + "C26681T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.110": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "G16968A", + "T19839C", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.518": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "A16725G", + "T19839C", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.163": [ + "C241T", + "C3037T", + "G11029A", + "C14408T", + "C21772T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C", + "C29518T" + ], + "B.1.1.265": [ + "C241T", + "C3037T", + "C11005A", + "C14408T", + "A23403G", + "A28624T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.119": [ + "C241T", + "C3037T", + "C9967T", + "A10323G", + "C14408T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.480": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "A25335T", + "C26894T", + "C27643T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.8": [ + "C241T", + "C3037T", + "C6573T", + "C14408T", + "A23403G", + "C25528T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.423": [ + "C241T", + "C3037T", + "C12374T", + "C14408T", + "A23403G", + "C24863T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.17": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "A25958G", + "C27046T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.257": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "C20031A", + "A23403G", + "C27046T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.323": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "C27046T", + "C28344A", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.458": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "A21137G", + "A23403G", + "G28373T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.63": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "C21597T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C", + "C29144T" + ], + "B.1.1.45": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "A14791T", + "C17410T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.14": [ + "C241T", + "C1101T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "A25798G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.304": [ + "C241T", + "C936T", + "C3037T", + "G3259T", + "C14408T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.426": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "G16336A", + "C18555T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.424": [ + "C241T", + "C1780T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "C26681T", + "C27434T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.130": [ + "C241T", + "G1743A", + "C3037T", + "C3486T", + "T9205C", + "C14408T", + "A23403G", + "G25471T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.382": [ + "C241T", + "C3037T", + "G6368A", + "C14408T", + "G16853T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.160": [ + "C241T", + "C3037T", + "C10376T", + "C14408T", + "A23403G", + "C26208T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.261": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "C26447T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C", + "C28887T" + ], + "B.1.1.507": [ + "C241T", + "G1042A", + "C1427T", + "C3037T", + "C12253T", + "C14408T", + "G19656A", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.15": [ + "C241T", + "C1973T", + "C3037T", + "C3261T", + "C5621T", + "G9479T", + "C14408T", + "A20288C", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.55": [ + "C241T", + "A2526C", + "C3037T", + "C10440T", + "C14408T", + "A23403G", + "T25316C", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.186": [ + "C241T", + "C3037T", + "C4113T", + "C14408T", + "G21974C", + "C23191T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.82": [ + "C241T", + "C3037T", + "C6406T", + "C14408T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C", + "G29777T" + ], + "B.1.1.270": [ + "C241T", + "A1630C", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "C27679T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.191": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "G23868T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C", + "G29294A" + ], + "B.1.1.421": [ + "C241T", + "C874T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "G23868T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C", + "C29215T" + ], + "B.1.1.56": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "C22675T", + "A23403G", + "G23868T", + "G24794T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.204": [ + "C241T", + "C3037T", + "T3873C", + "A8072G", + "C14408T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.386": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "G25644T", + "G25753T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.115": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "G26918T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C", + "T29464C" + ], + "B.1.1.41": [ + "C241T", + "C3037T", + "C6312A", + "A10948G", + "C14408T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.157": [ + "C241T", + "C3037T", + "C6145T", + "G11272A", + "C14408T", + "C17678T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.328": [ + "C241T", + "C3037T", + "G7223A", + "G10360A", + "C14408T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.329": [ + "C241T", + "C3037T", + "A10323G", + "G10360A", + "C14408T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.37": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "C21637T", + "A23403G", + "A28169G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.310": [ + "C241T", + "C3037T", + "A6900G", + "C14408T", + "A23403G", + "G25617T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.308": [ + "C241T", + "G1590T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "G25617T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.309": [ + "C241T", + "C835T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "G25617T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.356": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "C19011T", + "C21057T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.300": [ + "C241T", + "C3037T", + "G10265A", + "T13794G", + "C14408T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.514": [ + "C241T", + "C3037T", + "G10265A", + "C14408T", + "G14430T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.301": [ + "C241T", + "C3037T", + "G10265A", + "C14408T", + "A19650G", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.513": [ + "C241T", + "T1303C", + "C3037T", + "G10265A", + "C14408T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.299": [ + "C241T", + "C3037T", + "G10265A", + "C14408T", + "A23207G", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.27": [ + "C241T", + "C3037T", + "G10265A", + "C14408T", + "C16293T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.116": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "G18803T", + "A22606G", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.67": [ + "C241T", + "C3037T", + "G11447A", + "C14408T", + "C21648T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.387": [ + "C241T", + "C593T", + "C3037T", + "C11824T", + "C14408T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "D.3": [ + "C241T", + "A1163T", + "C3037T", + "C7600T", + "G7798T", + "C14408T", + "A23403G", + "T23548C", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.218": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "C19488T", + "A23403G", + "C28500T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C", + "G29254A" + ], + "B.1.1.40": [ + "C241T", + "C3037T", + "C3811T", + "C14396T", + "C14408T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.315": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "C26060T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C", + "C29466T", + "A29771G" + ], + "B.1.1.396": [ + "C241T", + "C3037T", + "C10747T", + "C14408T", + "T22020C", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.141": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "T22020C", + "A23403G", + "G26056T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.452": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "G15906A", + "T22020C", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.280": [ + "C241T", + "T1543A", + "C3037T", + "T4369C", + "C14408T", + "T22020C", + "A23403G", + "C27911T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.560": [ + "C241T", + "C3037T", + "C8917T", + "G9389A", + "C14408T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.453": [ + "C241T", + "C3037T", + "C12439T", + "C14408T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C", + "G28907T" + ], + "B.1.1.132": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "G21255C", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C", + "G28960T" + ], + "B.1.1.346": [ + "C241T", + "C1684T", + "G2086T", + "C3037T", + "G6847T", + "C14408T", + "C15857T", + "C20544T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.416": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "C16386T", + "C20762T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.266": [ + "C241T", + "C3037T", + "G5554T", + "C14408T", + "A23403G", + "C24034T", + "G28321T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.357": [ + "C241T", + "G2173A", + "C3037T", + "C3702T", + "C14408T", + "A23403G", + "C26060T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.152": [ + "C241T", + "C3037T", + "G11243A", + "C12525T", + "C14408T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.58": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "C20233T", + "C22210T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.325": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "C21057T", + "A23403G", + "C27059T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.380": [ + "C241T", + "A2015G", + "C3037T", + "C9541T", + "C14408T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.109": [ + "C241T", + "C3037T", + "T10513C", + "C14408T", + "A23403G", + "T27851C", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C", + "C29541T", + "C29739T" + ], + "B.1.1.362": [ + "C241T", + "A2375C", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "T23878C", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.449": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "A22101G", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C", + "G29402T", + "C29421T" + ], + "B.1.1.395": [ + "C241T", + "A2854G", + "C3037T", + "G5716T", + "C8772T", + "C14408T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.244": [ + "C241T", + "C3037T", + "C12412T", + "T14313C", + "C14408T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.111": [ + "C241T", + "C3037T", + "G5950T", + "C14408T", + "A21137G", + "A23403G", + "T27447C", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C", + "T29661C" + ], + "B.1.1.177": [ + "C241T", + "C3037T", + "C13168T", + "C14408T", + "C16163T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.359": [ + "C241T", + "C2146T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "A28305G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.263": [ + "C241T", + "C3037T", + "G5924A", + "C14408T", + "T21775G", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.399": [ + "C241T", + "G840A", + "C3037T", + "C14408T", + "C17939T", + "C18744T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.391": [ + "C241T", + "C3037T", + "T7171C", + "C14408T", + "A23403G", + "C27002T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.436": [ + "C241T", + "C3037T", + "T4011C", + "G4261A", + "C14408T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.350": [ + "C241T", + "C3037T", + "T13575C", + "G13576T", + "C14408T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.401": [ + "C241T", + "C3037T", + "C7119T", + "C14408T", + "A23403G", + "G25677T", + "A26019C", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.444": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "C18501T", + "A23403G", + "C23625T", + "G28178T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.442": [ + "C241T", + "C3037T", + "C13432T", + "C14408T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C", + "C29409T" + ], + "B.1.1.407": [ + "C241T", + "C3037T", + "A5040G", + "C14408T", + "T20028C", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.84": [ + "C241T", + "C3037T", + "C5974T", + "C14408T", + "A23403G", + "C23520T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.461": [ + "C241T", + "G440A", + "C3037T", + "C14408T", + "C19290T", + "G20208T", + "A23403G", + "A23586G", + "G24197T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C", + "A29209G" + ], + "B.1.1.172": [ + "C241T", + "C3037T", + "T4711C", + "A6709G", + "C14408T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.175": [ + "C241T", + "C1288T", + "C2048T", + "C3037T", + "C13255T", + "C14408T", + "A22193T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.381": [ + "C241T", + "C3037T", + "C6701T", + "C14408T", + "C18138T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.203": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "C23854T", + "G25972A", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.312": [ + "C241T", + "C2455T", + "C3037T", + "C14408T", + "C14625T", + "C19018T", + "A23403G", + "A24432T", + "A28081G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.91": [ + "C241T", + "C3037T", + "C3784T", + "T12142C", + "C14408T", + "A23403G", + "C24023T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.88": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "G26792T", + "C26892T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.441": [ + "C241T", + "G625T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "G28817T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.364": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "T21976C", + "A23403G", + "G28233T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.155": [ + "C241T", + "G922T", + "C3037T", + "C6541T", + "C14408T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.516": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "T15117C", + "C15579T", + "G19816T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.435": [ + "C241T", + "A1558G", + "C3037T", + "C10228T", + "C14408T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C", + "A28886G", + "G28913A" + ], + "B.1.1.72": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "C23802T", + "T26320C", + "C26936T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.213": [ + "C241T", + "C313T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "C27128T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.114": [ + "C241T", + "C313T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "G26849T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.113": [ + "C241T", + "C313T", + "C3037T", + "A11348G", + "C14408T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.285": [ + "C241T", + "C313T", + "C823T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.162": [ + "C241T", + "C313T", + "C3037T", + "C3602T", + "C14408T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.282": [ + "C241T", + "C313T", + "C3037T", + "A10323G", + "C14408T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.210": [ + "C241T", + "C313T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "G26526T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.48": [ + "C241T", + "C313T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "G26730A", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.283": [ + "C241T", + "C313T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "G25563C", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.430": [ + "C241T", + "C313T", + "C3037T", + "G4148T", + "C14408T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.181": [ + "C241T", + "C313T", + "C3037T", + "C14408T", + "C14724T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.305": [ + "C241T", + "C313T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "G28396A", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.482": [ + "C241T", + "C313T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "C26895T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.144": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "T20286C", + "A23403G", + "C25207T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.412": [ + "C241T", + "C3037T", + "G11447A", + "C14408T", + "C22675T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.361": [ + "C241T", + "C3037T", + "A6825G", + "C14408T", + "C17118T", + "T20526C", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C", + "C29530T" + ], + "B.1.1.275": [ + "C241T", + "C3037T", + "G3230A", + "C14408T", + "A23403G", + "T24076A", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.379": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "C17491T", + "G21624T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.360": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "G21624T", + "A23403G", + "G25598T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.237": [ + "C241T", + "C3037T", + "T3049C", + "C14408T", + "G21624T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.365": [ + "C241T", + "C3037T", + "A4926C", + "C14408T", + "G21624T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.279": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "G18859T", + "G21624T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.30": [ + "C241T", + "C1593T", + "C3037T", + "C14408T", + "G21624T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.53": [ + "C241T", + "C3037T", + "G9890T", + "C14408T", + "A20318G", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.216": [ + "C241T", + "C3037T", + "C5884T", + "C14408T", + "A23403G", + "C26060T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.339": [ + "C241T", + "C3037T", + "C7851T", + "C14408T", + "A23403G", + "A24170G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.271": [ + "C241T", + "C3037T", + "C3373A", + "C14408T", + "C19862T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.267": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "C14786T", + "A20952G", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C", + "C28991A" + ], + "B.1.1.190": [ + "C241T", + "C3037T", + 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"C3037T", + "A5264G", + "C11916T", + "C14408T", + "C16457T", + "A23403G", + "G25563T" + ], + "B.1.494": [ + "C241T", + "C1059T", + "C3037T", + "C11916T", + "C13252T", + "C14408T", + "A23403G", + "C23604T", + "G25563T" + ], + "B.1.298": [ + "C241T", + "C1059T", + "C3037T", + "G5012T", + "C14408T", + "C19488T", + "A23403G", + "G25563T", + "T28843G" + ], + "B.1.305": [ + "C241T", + "C1059T", + "C3037T", + "T6905G", + "C13994T", + "C14408T", + "G21724T", + "A23403G", + "G25563T" + ], + "B.1.573": [ + "C241T", + "C1059T", + "C3037T", + "A6616G", + "C14408T", + "T17241C", + "A23403G", + "G25563T", + "C29364T", + "C29762T" + ], + "B.1.304": [ + "C241T", + "C1059T", + "C3037T", + "C5310T", + "C12294T", + "C14408T", + "A23403G", + "C25511T", + "G25563T" + ], + "B.1.264.1": [ + "C92T", + "C241T", + "C1059T", + "C3037T", + "C11396T", + "C11919T", + "C14408T", + "A23403G", + "C25517T", + "G25563T", + "C28893A" + ], + "B.1.120": [ + "C241T", + "C829T", + "C1059T", + "C3037T", + "C14408T", + 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"A23403G", + "G29734C" + ], + "B.1.189": [ + "C241T", + "C3037T", + "C4582T", + "G6404T", + "C14408T", + "A20268G", + "A23403G", + "T25123C", + "G28378T" + ], + "B.1.234": [ + "C241T", + "G2258A", + "C3037T", + "A6441G", + "C8140T", + "C14408T", + "A20268G", + "A23403G", + "C28854T" + ], + "B.1.407": [ + "C241T", + "C832T", + "C2252A", + "C3037T", + "G11243T", + "C14408T", + "T18723C", + "A20268G", + "A23403G", + "G25720T", + "C27532T", + "C28854T", + "C29085T" + ], + "B.1.403": [ + "C241T", + "C3037T", + "C4596A", + "C14408T", + "G19086T", + "A20268G", + "A20649T", + "A23403G", + "C28854T" + ], + "B.1.243.1": [ + "C241T", + "C3037T", + "C4321T", + "C14408T", + "C17999T", + "G19962T", + "A20268G", + "T22200G", + "G23012A", + "A23403G", + "T24076C", + "C26873T", + "G27065A", + "C28603T", + "C28854T" + ], + "B.1.402": [ + "C241T", + "C3037T", + "C4633T", + "C14408T", + "T14643C", + "A20268G", + "C22482T", + "A23403G", + "C28854T" + ], + "B.1.610": [ + "C241T", + "C3037T", + "T5507A", + 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"C17690T", + "C18877T", + "A22438T", + "A23403G", + "G25563T" + ], + "B.1.9.4": [ + "C241T", + "C346T", + "C2113T", + "C3037T", + "C7765T", + "C14408T", + "C17690T", + "C18877T", + "A23403G", + "G25563T", + "A28959G" + ], + "B.1.9.5": [ + "C241T", + "C3037T", + "C7765T", + "C14408T", + "C17690T", + "C18877T", + "A23403G", + "G25563T" + ], + "B.1.9.3": [ + "C241T", + "C2113T", + "C3037T", + "C7765T", + "C14408T", + "C15928T", + "C17690T", + "C18877T", + "A23403G", + "G25563T" + ], + "B.1.1.324": [ + "C241T", + "C3037T", + "A5899G", + "C14408T", + "A23403G", + "C27509T", + "A28877T", + "G28878C", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.221": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "T19839C", + "C21646T", + "A23403G", + "C26846T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.74": [ + "C241T", + "C3037T", + "G3242A", + "G8120C", + "C14408T", + "T19839C", + "C21646T", + "A23403G", + "A24205T", + "G28083T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.289": [ + "C241T", + "C3037T", + "G11801A", + "C14408T", + "T19839C", + "A23403G", + "G25552T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.459": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "C16971T", + "T19839C", + "A23403G", + "C24099T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.352": [ + "C241T", + "C3037T", + "A5311G", + "C14408T", + "C19017T", + "T19839C", + "A23403G", + "G25954A", + "G28068T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C", + "C29642T" + ], + "B.1.1.464": [ + "C241T", + "C3037T", + "C12025T", + "C14408T", + "T19839C", + "A23403G", + "C23707T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.77": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "T19839C", + "A23403G", + "G27993A", + "G28209T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.521": [ + "C241T", + "C3037T", + "C4927T", + "C9693T", + "C14408T", + "C18744T", + "T19839C", + "A23403G", + "C23422T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.355": [ + "C241T", + "C3037T", + "A10323G", + "C14408T", + "A23403G", + "T27869C", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C", + "C29167T" + ], + "B.1.1.348": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "C25521T", + "G25913A", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C", + "C29370T" + ], + "B.1.1.273": [ + "C241T", + "C3037T", + "A7064G", + "C14408T", + "C22675T", + "A23403G", + "C25521T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.326": [ + "C241T", + "C3037T", + "G4354A", + "C6573T", + "C14408T", + "A23403G", + "C25528T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.389": [ + "C241T", + "C3037T", + "C5884T", + "G8572T", + "C10340T", + "G10360A", + "C14408T", + "A23403G", + "C24912T", + "C28706T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C", + "C29144T" + ], + "B.1.1.456": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "C18788T", + "A20387G", + "G22022C", + "A23403G", + "C26681T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.38": [ + "C241T", + "C1059T", + "C3037T", + "C9438T", + "C14408T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C", + "G29777T" + ], + "B.1.1.145": [ + "C241T", + "C3037T", + "C3170T", + "C6336T", + "C14408T", + "A23403G", + "C27673T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.29": [ + "C241T", + "C2232T", + "C3037T", + "C14408T", + "C14877T", + "C19185T", + "A23403G", + "C24034T", + "T28382C", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.128": [ + "C241T", + "C3037T", + "C6781T", + "C11916T", + "C14408T", + "C19185T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.392": [ + "C241T", + "C3037T", + "G6710T", + "C10376T", + "T13339C", + "C14408T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.165": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "G25563T", + "A27932G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C", + "G29705T" + ], + "K.1": [ + "C241T", + "T2058A", + "A2869G", + "C3037T", + "C12115T", + "C14408T", + "C21306T", + "A23403G", + "C25276A", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C", + "C29095T" + ], + "B.1.1.241": [ + "C241T", + 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"G28883C" + ], + "B.1.1.371": [ + "C241T", + "C3037T", + "C13862T", + "C14120T", + "C14408T", + "T16456C", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "AN.1": [ + "C241T", + "C3037T", + "G3896T", + "C6701T", + "C12116T", + "C14352T", + "C14408T", + "G17334T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.123": [ + "C241T", + "C2706T", + "C3037T", + "T7357C", + "C14408T", + "A23403G", + "G23868T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C", + "C29625T" + ], + "B.1.1.133": [ + "C241T", + "C3037T", + "C4965T", + "A8072G", + "C14408T", + "A16011G", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.97": [ + "C241T", + "G569A", + "C3037T", + "C5482T", + "C14408T", + "G17944T", + "C18747T", + "A22182G", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.256": [ + "C241T", + "A2641G", + "C3037T", + "C3622T", + "C14408T", + "A23403G", + "C25844T", + "C28087T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.451": [ + "C241T", + 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"C241T", + "C3037T", + "C11620T", + "C14408T", + "C16386T", + "C22388T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.217": [ + "C241T", + "C3037T", + "A3569G", + "A6211G", + "A8659G", + "C14408T", + "C19488T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.62": [ + "C241T", + "C3037T", + "T7012A", + "C14408T", + "C19402T", + "A23403G", + "G28326T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.178": [ + "C241T", + "C3037T", + "T4149C", + "C12525T", + "C14408T", + "A23403G", + "G25599T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.342": [ + "C241T", + "C1627T", + "C2044T", + "C3037T", + "C3737T", + "C14408T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.506": [ + "C241T", + "C3037T", + "T5773C", + "C14408T", + "C17518T", + "C19718T", + "A23403G", + "C28770T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.201": [ + "C241T", + "T1094C", + "C3037T", + "C8917T", + "C14408T", + "C18129T", + "A23403G", + "G28881A", 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"B.1.1.383": [ + "C241T", + "C1387T", + "C3037T", + "T7012A", + "C14408T", + "C18464T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.209": [ + "C241T", + "C313T", + "C3037T", + "G4510A", + "C14408T", + "G19480A", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.50": [ + "C241T", + "C313T", + "C3037T", + "G4510A", + "C14408T", + "G15438T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.47": [ + "C241T", + "C313T", + "C3037T", + "C9286T", + "C14408T", + "C19763T", + "A23403G", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.226": [ + "C241T", + "C313T", + "C3037T", + "C14408T", + "C14676T", + "A23403G", + "G25647T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.49": [ + "C241T", + "C313T", + "C3037T", + "C14408T", + "G22627A", + "A23403G", + "G28628T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.139": [ + "C241T", + "C313T", + "C3037T", + "C14408T", + "A23403G", + "T27645A", + "G27666A", + "G28881A", + "G28882A", + 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"A23403G", + "G25563T", + "G29540A" + ], + "B.1.508": [ + "C241T", + "C1059T", + "C3037T", + "C11916T", + "C14408T", + "C18998T", + "C19145T", + "A23403G", + "G25563T", + "G29540A" + ], + "B.1.504": [ + "C241T", + "C1059T", + "C3037T", + "C11916T", + "C14408T", + "C18998T", + "A23403G", + "G25563T", + "G26217T", + "G29540A" + ], + "B.1.503": [ + "C241T", + "C1059T", + "C3037T", + "C11916T", + "C14408T", + "C18998T", + "A23403G", + "G25563T", + "G25947C", + "G29540A" + ], + "B.1.499": [ + "C241T", + "C1059T", + "C3037T", + "C11916T", + "C14408T", + "C18998T", + "A23403G", + "G25563T", + "C28863T", + "G29540A" + ], + "B.1.506": [ + "C241T", + "C1059T", + "C3037T", + "C10188T", + "C11916T", + "C14408T", + "C18570T", + "C18998T", + "A23403G", + "G25563T", + "G29540A" + ], + "B.1.611": [ + "C241T", + "C1059T", + "C3037T", + "T10077A", + "C11916T", + "C14408T", + "C18998T", + "C19017T", + "A23403G", + "G25563T", + "A28654G", + "G29540A" + ], + "B.1.505": [ + "C66A", + "C241T", + "C1059T", + 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"G27790A", + "C29421T", + "C29750T" + ], + "B.1.578": [ + "C241T", + "C1059T", + "C3037T", + "C5183T", + "C14408T", + "C21302T", + "C21304A", + "G21305A", + "A23403G", + "G25563T" + ], + "B.1.641": [ + "C241T", + "C1059T", + "C1282T", + "C1513T", + "C2388T", + "T2489C", + "C3037T", + "C4113T", + "C4206T", + "C4540T", + "C5284T", + "G6894T", + "C7029T", + "C7093T", + "C7267T", + "C7764T", + "C9073T", + "C9430T", + "C9532T", + "C9598T", + "C9611T", + "C9679T", + "C9711T", + "C9712T", + "C9724T", + "C9745T", + "C10183T", + "C10279T", + "A10323G", + "T10423C", + "C12073T", + "C12076T", + "C12213T", + "C12596T", + "C12756T", + "C12786T", + "G13459A", + "A14041G", + "C14322T", + "C14408T", + "G14557T", + "C15738T", + "G15921T", + "A16266G", + "C16329T", + "A17199G", + "G17278T", + "G18546T", + "C18646T", + "G19891T", + "C20283T", + "A21203G", + "C21707T", + "C21727T", + "C21846T", + "T23020G", + "A23064C", + "T23398C", + "A23403G", + "T24028C", + "G25563T", + "T26047G", + "C26313T", + 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"B.1.1.288": [ + "C241T", + "C1392T", + "C3037T", + "C10377T", + "C14408T", + "G15181T", + "C18744T", + "T19839C", + "A23403G", + "C25626T", + "C26022T", + "C27002T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C", + "G29402T" + ], + "B.1.1.446": [ + "C241T", + "C3037T", + "C14408T", + "G19009T", + "A23403G", + "T25191C", + "C25836T", + "A25980G", + "G28027C", + "G28221T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "L.4": [ + "C241T", + "C3037T", + "C6861T", + "C14408T", + "A19108G", + "C19170T", + "G19254T", + "G19509A", + "A23403G", + "G24872C", + "G25354T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C" + ], + "B.1.1.405": [ + "C241T", + "C1567T", + "C2997T", + "C3037T", + "G4960T", + "C6395T", + "G11272C", + "C11514T", + "C14408T", + "C15738T", + "C16536T", + "G20679A", + "C21590T", + "A23403G", + "G28079T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C", + "G29651T" + ], + "B.1.1.341": [ + "C241T", + "T1309C", + "C3037T", + "C4565A", + "T8134C", + "C14408T", + "G20238T", + "G20931T", + "G22094A", + 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"B.1.177.20": [ + "C241T", + "T445C", + "C3037T", + "C6286T", + "C10626T", + "C14408T", + "G21255C", + "C22227T", + "G23311C", + "A23403G", + "C26801G", + "C28932T", + "G29645T" + ], + "B.1.177.10": [ + "C241T", + "T445C", + "C3037T", + "C6286T", + "C14408T", + "G21255C", + "C22227T", + "G22346T", + "A23403G", + "C26801G", + "G28321A", + "C28932T", + "G29645T" + ], + "B.1.177.32": [ + "C241T", + "T445C", + "C3037T", + "C5700T", + "C6286T", + "C11152T", + "C14408T", + "G21255C", + "C22227T", + "A23403G", + "C26801G", + "C28932T", + "G29645T" + ], + "B.1.177.45": [ + "C241T", + "T445C", + "C3037T", + "T6023C", + "C6286T", + "C14408T", + "G19999T", + "G21255C", + "C22227T", + "A23403G", + "C26801G", + "C28932T", + "G29645T" + ], + "B.1.177.70": [ + "C241T", + "T445C", + "A2994G", + "C3037T", + "C6286T", + "C8664T", + "C14408T", + "C15738T", + "G21255C", + "C22227T", + "A23403G", + "C26801G", + "C28932T", + "G29645T" + ], + "B.1.177.71": [ + "C241T", + "T445C", + "C3037T", + "C6286T", + 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