conda.Rmd

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title: "Introducción a Conda"
author: "Otoniel Maya - ATG<br>02 de agosto de 2022"
output:
  xaringan::moon_reader:
    css: ["css/cdsb2022.css"]
    self_contained: true
    nature:
      ratio: '16:9'
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```{r xaringanExtra-clipboard, echo=FALSE}
xaringanExtra::use_clipboard()
```

# El camino de la serpiente para usuarios de R

.pull-center[<br>
```{r, echo=FALSE, out.width='80%', fig.align='center'}
knitr::include_graphics("img/snake_way.png")
```
]
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# ¿Qué es Conda?

.pull-center[<br>
```{r, echo=FALSE, out.width='40%', fig.align='center'}
knitr::include_graphics("img/conda.png")
```
]

Conda es un gestor de paquetes, funciona para *casi todos* los lenguajes interpretados y para *algunos* que requieren compilación.

Originalmente orientado a usuarios Python .
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# Parece chiste pero es anécdota

La Maldición de Perl: *There Is More Than One Way To Do It*

.pull-center[
```{r, echo=FALSE, out.width='45%', fig.align='center'}
knitr::include_graphics("img/python_environment.png")
```
]

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# ¿Cómo conseguir Python?

* **Oficialmente**: instalador de la [Python Software Foundation](python.org). 
    - Windows, Linux y macOS.
    
* **Distro**: gestor de paquetes en Linux. 
    - DPKG, RPM, Pacman, Zypper, DNF. 
    
* **Homebrew**: usando el gestor de paquetes llamado Homebrew. 
    - Principalmente macOS, funciona en Linux.
    
* **Continuum**: Anaconda/Miniconda. Windows, Linux y macOS.

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# Pythontitlán

**-titlán**: del náhuatl *tlantli*. Sufijo locativo que designa lo que se encuentra alrededor.
 
.pull-center[<br>
```{r, echo=FALSE, out.width='100%', fig.align='center'}
knitr::include_graphics("img/pythontitlan.png")
```
]

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# ¿Por qué Conda?

- Es fácil de usar
- Es multiplataforma
- Funciona con recetas YAML
- Canales: Bioconda, r
- Se lleva bien con Python
- Maneja **entornos**
 
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# Entornos virtuales

Es una ubicación del PATH, aislada del sistema, que previene conflictos de versiones.

.pull-center[<br>
```{r, echo=FALSE, out.width='35%', fig.align='center'}
knitr::include_graphics("img/global_vs_env.png")
```
]

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.pull-left[<br><br><br><br><br><br><br>
.center[
# ¡Gracias! 
]
]

.pull-right[<br>
```{r, echo=FALSE, out.width='80%', fig.align='center'}
knitr::include_graphics("img/xolo.png")
```

]