Для запуска проекта необходимо нечто большее, чем просто скачать исходники из репозитория.
Во первых, кроме находящейся в проекте библиотеки SQLite-JDBC вам понадобится JavaFX SDK 11 (OpenJFX). К проекту надо подключить все библиотеки из папки lib этого SDK.
Во вторых, вам необходимо указать корректные VM options: --module-path "ПУТЬ_ДО_JAVAFX_SDK\javafx-sdk-11.0.1\lib" --add-modules=javafx.controls,javafx.fxml,javafx.web