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Asking for a solution #6

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zxzbuaa opened this issue Mar 28, 2020 · 6 comments
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Asking for a solution #6

zxzbuaa opened this issue Mar 28, 2020 · 6 comments

Comments

@zxzbuaa
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zxzbuaa commented Mar 28, 2020

Hello! My name is Zhang and I have an experiment need this code, but I can't run it. I haven't got the data from the aapm because they told me they have many applications to handle. So I find some public CT pictures from NIHCC, but the code still show me errors. Such as 'ValueError: num_samples should be a positive integer value, but got num_samples=0'. My experiment' s deadline is coming soon so I wondered if you guys can help me to solve this.
And I'll be verygrateful if someone can send me the data and pictures from aapm! My address is: zxz1609@buaa.edu.cn.
Thank you!

@stefenmax
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首先,领了数据的都签了协议,不能随便传。第二,用了这个数据依然会有你提到的问题所以不是数据的问题,加油改代码吧

@zxzbuaa
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zxzbuaa commented Apr 10, 2020

首先,领了数据的都签了协议,不能随便传。第二,用了这个数据依然会有你提到的问题所以不是数据的问题,加油改代码吧

好的,那可以告知一下数据格式么?我这边有着不同的一些像png和jpg的ct图片以及从医院索要到的一些诸如dicom这种格式的文件,只是不知道怎么搭配~谢谢

@stefenmax
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这个代码用的是dicom格式,他是先把dicom变成numpy然后处理的,我觉得png或jpg肯定不行,丢失太多细节了。还有关于那个num_sample=0的问题 我刚解决了,放在第一个issue里了 你可以看一下

@zxzbuaa
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zxzbuaa commented Apr 12, 2020

这个代码用的是dicom格式,他是先把dicom变成numpy然后处理的,我觉得png或jpg肯定不行,丢失太多细节了。还有关于那个num_sample=0的问题 我刚解决了,放在第一个issue里了 你可以看一下

我找到了你说的test_patient,代码中是test_patient='L506',所以我在*\WGAN_VGG-master\data1\AAPM-Mayo-CT-Challenge中的压缩包下的full和quarter文件夹下都放了一个叫L506的dicom文件,压缩包名字也改成了L506,但是还是显示相同的错误,请问这是什么原因呢?

@stefenmax
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这个代码用的是dicom格式,他是先把dicom变成numpy然后处理的,我觉得png或jpg肯定不行,丢失太多细节了。还有关于那个num_sample=0的问题 我刚解决了,放在第一个issue里了 你可以看一下

我找到了你说的test_patient,代码中是test_patient='L506',所以我在*\WGAN_VGG-master\data1\AAPM-Mayo-CT-Challenge中的压缩包下的full和quarter文件夹下都放了一个叫L506的dicom文件,压缩包名字也改成了L506,但是还是显示相同的错误,请问这是什么原因呢?

prep文件运行了么 能出来numpy数据了?

@zxzbuaa
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zxzbuaa commented Apr 12, 2020

这个代码用的是dicom格式,他是先把dicom变成numpy然后处理的,我觉得png或jpg肯定不行,丢失太多细节了。还有关于那个num_sample=0的问题 我刚解决了,放在第一个issue里了 你可以看一下

我找到了你说的test_patient,代码中是test_patient='L506',所以我在*\WGAN_VGG-master\data1\AAPM-Mayo-CT-Challenge中的压缩包下的full和quarter文件夹下都放了一个叫L506的dicom文件,压缩包名字也改成了L506,但是还是显示相同的错误,请问这是什么原因呢?

prep文件运行了么 能出来numpy数据了?

是的,先运行prep再运行main,上面说到了我试出来的文件路径,如果不能转给我数据的话可不可以描述一下我们的数据包/路径之间的区别呢?

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