-
Notifications
You must be signed in to change notification settings - Fork 2
/
index.qmd
217 lines (152 loc) · 12 KB
/
index.qmd
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
---
title: Title of the project
author:
- name: First author
orcid: 0000-xxxx-xxxx-xxxx
corresponding: true
email: prenom.nom@inrae.fr
roles:
- Investigation
- Project administration
- Software
- Visualization
affiliations:
- INRAE
- name: Second Author
orcid: 0000-xxxx-xxxx-xxxx
corresponding: false
roles: []
affiliations:
- INRAE
keywords:
- Quarto
- INRAE
abstract: |
Sed ut perspiciatis unde omnis iste natus error sit voluptatem accusantium doloremque laudantium, totam rem aperiam, eaque ipsa quae ab illo
plain-language-summary: |
Sed ut perspiciatis unde omnis iste natus error sit voluptatem accusantium doloremque laudantium, totam rem aperiam, eaque ipsa quae ab illo
key-points:
- Sed ut perspiciatis unde omnis iste natus error sit voluptatem accusantium doloremque laudantium, totam rem aperiam, eaque ipsa quae ab illo
- Sed ut perspiciatis unde omnis iste natus error sit voluptatem accusantium doloremque laudantium, totam rem aperiam, eaque ipsa quae ab illo
date: last-modified
---
## A really awesome part 1
### Second level header
Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipiscing elit. Nunc suscipit dolor est, non accumsan urna maximus id. Quisque sit amet posuere ex, vel porttitor velit. Praesent tellus lectus, pulvinar non luctus non, faucibus id diam.
Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipiscing elit.
<center>
[I'm a centered button](){.btn .btn-primary role="button" align="center"}
</center>
### Another second level header
::: {.callout-tip}
Look at the pills down there !
:::
::: {.panel-tabset .nav-pills}
## Scatterplot
```{r}
library(InraeThemes)
library(ggplot2)
library(palmerpenguins)
library(extrafont)
# Load the fonts
extrafont::loadfonts(quiet = TRUE)
ggplot(penguins, aes(x = flipper_length_mm, y = body_mass_g, color = species)) +
geom_point(size = 3, alpha = 0.7) +
labs(
title = "Relation entre la longueur des nageoires et la masse corporelle",
subtitle = "Données des pingouins par espèce",
x = "Longueur des nageoires (mm)",
y = "Masse corporelle (g)"
) +
theme_inrae() +
scale_color_inrae()
```
## Boxplot
```{r}
ggplot(penguins, aes(x = species, y = body_mass_g, fill = species)) +
geom_boxplot(alpha = 0.7) +
labs(
title = "Masse corporelle des différentes espèces de pingouins",
x = "Espèce",
y = "Masse corporelle (g)"
) +
theme_inrae() +
scale_fill_inrae()
```
## Histogram
```{r}
ggplot(penguins, aes(x = bill_length_mm, fill = species)) +
geom_histogram(binwidth = 2, position = "stack", color = "white") +
labs(
title = "Distribution de la longueur du bec des pingouins",
x = "Longueur du bec (mm)",
y = "Fréquence"
) +
theme_inrae() +
scale_fill_inrae()
```
:::
Phasellus gravida metus at finibus congue. Cras placerat vehicula feugiat. Maecenas pharetra tincidunt leo vel interdum. Nunc id rhoncus lorem, blandit consequat lacus. Morbi eu ex ac dui bibendum congue. Nam vel leo ullamcorper, rhoncus orci non, feugiat mi. Quisque eget bibendum risus. Cras mollis varius enim eu aliquet. Vivamus ac risus varius, maximus arcu nec, posuere nisi. Integer neque tellus, sagittis eu nisi id, porttitor luctus mi. Vestibulum scelerisque quis nisl ut pharetra.
- element 1
- element 2
- element 3
Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipiscing elit. Nunc suscipit dolor est, non accumsan urna maximus id. Quisque sit amet posuere ex, vel porttitor velit. Praesent tellus lectus, pulvinar non luctus non, faucibus id diam. Ut condimentum, ante nec lobortis hendrerit, eros nunc gravida ante, id sodales ligula elit ut odio. Vestibulum imperdiet arcu quis massa facilisis, et sollicitudin urna porttitor. Praesent laoreet velit ac sagittis efficitur. Sed sit amet porttitor ipsum. Aliquam magna leo, efficitur vel laoreet ut, gravida ut ligula.
> ### Blockquote title
>
> Phasellus gravida metus at finibus congue. Cras placerat vehicula feugiat. Maecenas pharetra tincidunt leo vel interdum. Nunc id rhoncus lorem, blandit consequat lacus. Morbi eu ex ac dui bibendum congue. Nam vel leo ullamcorper, rhoncus orci non, feugiat mi. Quisque eget bibendum risus. Cras mollis varius enim eu aliquet. Vivamus ac risus varius, maximus arcu nec, posuere nisi. Integer neque tellus, sagittis eu nisi id, porttitor luctus mi. Vestibulum scelerisque quis nisl ut pharetra.
Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipiscing elit. Nunc suscipit dolor est, non accumsan urna maximus id. Quisque sit amet posuere ex, vel porttitor velit.
### Still another one
Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipiscing elit. Nunc suscipit dolor est, non accumsan urna maximus id. Quisque sit amet posuere ex, vel porttitor velit. Praesent tellus lectus, pulvinar non luctus non, faucibus id diam. Ut condimentum, ante nec lobortis hendrerit, eros nunc gravida ante, id sodales ligula elit ut odio. Vestibulum imperdiet arcu quis massa facilisis, et sollicitudin urna porttitor. Praesent laoreet velit ac sagittis efficitur. Sed sit amet porttitor ipsum. Aliquam magna leo, efficitur vel laoreet ut, gravida ut ligula.
```{r}
#| echo: true
ggplot(penguins, aes(x = bill_length_mm, fill = species)) +
geom_histogram(binwidth = 2, position = "stack", color = "white") +
labs(
title = "Distribution de la longueur du bec des pingouins",
x = "Longueur du bec (mm)",
y = "Fréquence"
) +
theme_inrae() +
scale_fill_inrae()
```
Phasellus gravida metus at finibus congue. Cras placerat vehicula feugiat. Maecenas pharetra tincidunt leo vel interdum. Nunc id rhoncus lorem, blandit consequat lacus. Morbi eu ex ac dui bibendum congue. Nam vel leo ullamcorper, rhoncus orci non, feugiat mi. Quisque eget bibendum risus. Cras mollis varius enim eu aliquet. Vivamus ac risus varius, maximus arcu nec, posuere nisi. Integer neque tellus, sagittis eu nisi id, porttitor luctus mi. Vestibulum scelerisque quis nisl ut pharetra.
Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipiscing elit. Nunc suscipit dolor est, non accumsan urna maximus id. Quisque sit amet posuere ex, vel porttitor velit. Praesent tellus lectus, pulvinar non luctus non, faucibus id diam. Ut condimentum, ante nec lobortis hendrerit, eros nunc gravida ante, id sodales ligula elit ut odio. Vestibulum imperdiet arcu quis massa facilisis, et sollicitudin urna porttitor. Praesent laoreet velit ac sagittis efficitur. Sed sit amet porttitor ipsum. Aliquam magna leo, efficitur vel laoreet ut, gravida ut ligula.
#### Level 4
Phasellus gravida metus at finibus congue. Cras placerat vehicula feugiat. Maecenas pharetra tincidunt leo vel interdum. Nunc id rhoncus lorem, blandit consequat lacus. Morbi eu ex ac dui bibendum congue. Nam vel leo ullamcorper, rhoncus orci non, feugiat mi. Quisque eget bibendum risus. Cras mollis varius enim eu aliquet. Vivamus ac risus varius, maximus arcu nec, posuere nisi. Integer neque tellus, sagittis eu nisi id, porttitor luctus mi. Vestibulum scelerisque quis nisl ut pharetra.
## And now part 2
Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipiscing elit. Nunc suscipit dolor est, non accumsan urna maximus id. Quisque sit amet posuere ex, vel porttitor velit. Praesent tellus lectus, pulvinar non luctus non, faucibus id diam. Ut condimentum, ante nec lobortis hendrerit, eros nunc gravida ante, id sodales ligula elit ut odio. Vestibulum imperdiet arcu quis massa facilisis, et sollicitudin urna porttitor. Praesent laoreet velit ac sagittis efficitur. Sed sit amet porttitor ipsum. Aliquam magna leo, efficitur vel laoreet ut, gravida ut ligula.
1. element
2. element
3. element
### Second level - once again
#### Level 4 which really is awesome
Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipiscing elit. Nunc suscipit dolor est, non accumsan urna maximus id. Quisque sit amet posuere ex, vel porttitor velit. Praesent tellus lectus, pulvinar non luctus non, faucibus id diam. Ut condimentum, ante nec lobortis hendrerit, eros nunc gravida ante, id sodales ligula elit ut odio. Vestibulum imperdiet arcu quis massa facilisis, et sollicitudin urna porttitor. Praesent laoreet velit ac sagittis efficitur. Sed sit amet porttitor ipsum. Aliquam magna leo, efficitur vel laoreet ut, gravida ut ligula.
#### Level 4, again !
Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipiscing elit. Nunc suscipit dolor est, non accumsan urna maximus id. Quisque sit amet posuere ex, vel porttitor velit. Praesent tellus lectus, pulvinar non luctus non, faucibus id diam. Ut condimentum, ante nec lobortis hendrerit, eros nunc gravida ante, id sodales ligula elit ut odio. Vestibulum imperdiet arcu quis massa facilisis, et sollicitudin urna porttitor. Praesent laoreet velit ac sagittis efficitur. Sed sit amet porttitor ipsum. Aliquam magna leo, efficitur vel laoreet ut, gravida ut ligula.
:::third-page
## Header 2, once again
### Second level, haven't I mentioned it before ?
#### Level 4, oops
Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipiscing elit. Nunc suscipit dolor est, non accumsan urna maximus id. Quisque sit amet posuere ex, vel porttitor velit. Praesent tellus lectus, pulvinar non luctus non, faucibus id diam. Ut condimentum, ante nec lobortis hendrerit, eros nunc gravida ante, id sodales ligula elit ut odio. Vestibulum imperdiet arcu quis massa facilisis, et sollicitudin urna porttitor. Praesent laoreet velit ac sagittis efficitur. Sed sit amet porttitor ipsum. Aliquam magna leo, efficitur vel laoreet ut, gravida ut ligula.
#### Level 4, again ???
Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipiscing elit. Nunc suscipit dolor est, non accumsan urna maximus id. Quisque sit amet posuere ex, vel porttitor velit. Praesent tellus lectus, pulvinar non luctus non, faucibus id diam. Ut condimentum, ante nec lobortis hendrerit, eros nunc gravida ante, id sodales ligula elit ut odio. Vestibulum imperdiet arcu quis massa facilisis, et sollicitudin urna porttitor. Praesent laoreet velit ac sagittis efficitur. Sed sit amet porttitor ipsum. Aliquam magna leo, efficitur vel laoreet ut, gravida ut ligula.
### Second level again and again
#### Level 4, seems like there is some identical headers here
Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipiscing elit. Nunc suscipit dolor est, non accumsan urna maximus id. Quisque sit amet posuere ex, vel porttitor velit. Praesent tellus lectus, pulvinar non luctus non, faucibus id diam. Ut condimentum, ante nec lobortis hendrerit, eros nunc gravida ante, id sodales ligula elit ut odio. Vestibulum imperdiet arcu quis massa facilisis, et sollicitudin urna porttitor. Praesent laoreet velit ac sagittis efficitur. Sed sit amet porttitor ipsum. Aliquam magna leo, efficitur vel laoreet ut, gravida ut ligula.
:::
## Some more text because I don't know what to write
Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipiscing elit. Nunc suscipit dolor est, non accumsan urna maximus id. Quisque sit amet posuere ex, vel porttitor velit. Praesent tellus lectus, pulvinar non luctus non, faucibus id diam. Ut condimentum, ante nec lobortis hendrerit, eros nunc gravida ante, id sodales ligula elit ut odio. Vestibulum imperdiet arcu quis massa facilisis, et sollicitudin urna porttitor. Praesent laoreet velit ac sagittis efficitur. Sed sit amet porttitor ipsum. Aliquam magna leo, efficitur vel laoreet ut, gravida ut ligula.
### Second level again and again and again
#### Level 4, the nicest on Earth
Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipiscing elit. Nunc suscipit dolor est, non accumsan urna maximus id. Quisque sit amet posuere ex, vel porttitor velit. Praesent tellus lectus, pulvinar non luctus non, faucibus id diam. Ut condimentum, ante nec lobortis hendrerit, eros nunc gravida ante, id sodales ligula elit ut odio. Vestibulum imperdiet arcu quis massa facilisis, et sollicitudin urna porttitor. Praesent laoreet velit ac sagittis efficitur. Sed sit amet porttitor ipsum. Aliquam magna leo, efficitur vel laoreet ut, gravida ut ligula.
```{r}
ggplot(penguins, aes(x = flipper_length_mm, fill = species)) +
geom_density(alpha = 0.6) +
labs(
title = "Distribution de la longueur des nageoires par espèce",
x = "Longueur des nageoires (mm)",
y = "Densité"
) +
theme_inrae() +
scale_fill_inrae()
```