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calculo_movilidad_por_departamento.qmd
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calculo_movilidad_por_departamento.qmd
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title: "Cálculo de movilidad por departamento de la provincia"
lang: es
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**Input inicial**
- Imagenes rasters `.tif` de cambio porcentual semanal y prepandemia para
locación, dia y horario reportado generadas en 'Creacion de rasters'.
**Objetivo**
- Obtener un dataset con los valores promedio de movilidad ciudadana tanto para
cambio porcentual semanal como prepandemia, en cada locación y momento en el
que haya disponible una imagen raster.
- Nueva variable que promedie los valores de cambio porcentual semanal como
prepandemia para mañana y tarde, ya que se asume que deberían ser similares.
---
```{r setup, echo = FALSE, message=FALSE, warning=FALSE}
library(sf)
library(plotly)
library(tidyverse)
library(terra)
```
## 1. Guardo información de los rasters en un dataset
Genero una base de datos con los polígonos de los departamentos de provincia
de Buenos Aires y la ubicación de los archivos en el sistema.
```{r}
# Leo todos los archivos de la carpeta con rasters de ejemplo
all_files <- list.files("data/inicial/")
# Datos reales
# all_files <- list.files("../geocovid/data/rasters/")
# Filtro los archivos que terminan con '.tif'
base_raster <- all_files[grep(".tif$",
basename(all_files))] |>
tibble::as_tibble() |>
tidyr::separate(value,
into = c('locacion',
'tipo_de_raster',
'fecha',
'hora'),
sep = '_',
remove = FALSE) |>
dplyr::mutate(fecha = as.Date(fecha),
hora = as.numeric(str_sub(hora, end= -4))) |>
dplyr::mutate(momento = dplyr::case_when(hora == 0 ~ "noche",
hora == 8 ~ "mañana",
hora == 16 ~ "tarde"))
# formato de fecha
formatted_date <- format("2020-05-10", format = "%Y-%m-%d")
bsas <- sf::st_read("data/procesada/bsas_caba_simple.gpkg")
base_raster_baires <- base_raster |>
dplyr::filter(locacion == 'baires') |> #elimina valores de amba que coinciden
dplyr::cross_join(bsas) |>
dplyr::mutate(file = paste0('data/inicial/', value)) |>
# datos reales
# dplyr::mutate(file = paste0('../geocovid/data/rasters/', value)) |>
sf::st_as_sf()
```
## 2. Promedio de valores de movilidad ciudadana por departamento de Bs. As.
- Esto lo realizamos tanto para los rasters de 0 am (noche), 8 am (mañana) y
tarde (4 pm).
- Se crea una variable, `px_mean_dianoche`, que promedia los valores de
mañana (8 am) y tarde (4 pm).
```{r}
px_baires <- c()
for(i in 1:nrow(base_raster_baires)){
# cada fila corresponde a un partido diferente
poli <- sf::st_as_sf(base_raster_baires[i, c('partido','geom')]) |>
st_transform(3857)
# si bien el raster va a ser el mismo en muchos casos
raster <- terra::rast(base_raster_baires$file[i])
crs(raster) <- "epsg:3857"
int_data2 <- terra::extract( raster,
sf::st_as_sf(poli),
fun = mean,
na.rm = TRUE)
px_data <- data.frame(base_raster_baires[i,],
'px_mean' = int_data2[[2]]
)
px_baires <- rbind(px_data, px_baires)
}
px_baires_w <- px_baires |>
select(fecha, locacion, tipo_de_raster,
momento, hora, partido, px_mean, geom) |>
pivot_wider(
names_from = c(momento, hora),
values_from = px_mean) |> # esto habria que
mutate(px_mean_dianoche = ((mañana_8 + tarde_16)/2))
px_baires_w
```
Las variables `px_mean_dianoche` y `noche_0` se convierten en categóricas.
```{r}
px_bsas <- px_baires_w |>
# dplyr::filter(fecha == '2020-05-06',
# tipo_de_raster == 'pc'
# ) |>
dplyr::mutate(criterio = case_when(px_mean_dianoche > 40 ~ "mas de 40",
40 > px_mean_dianoche &
px_mean_dianoche > 30 ~ "40 - 30",
30 > px_mean_dianoche &
px_mean_dianoche > 20 ~ "30 - 20",
20 > px_mean_dianoche &
px_mean_dianoche > 10 ~ "20 - 10",
10 > px_mean_dianoche &
px_mean_dianoche > 1 ~ "10 - 1",
1 > px_mean_dianoche &
px_mean_dianoche> -1 ~ "sin cambios",
-1 > px_mean_dianoche&
px_mean_dianoche > -10 ~ "-1 - -10",
-10 > px_mean_dianoche&
px_mean_dianoche > -20 ~ "-10 - -20",
-20 > px_mean_dianoche&
px_mean_dianoche > -30 ~ "-20 - -30",
-30 > px_mean_dianoche&
px_mean_dianoche > -40 ~ "-30 - -40",
-40 > px_mean_dianoche ~ "menor a -40"),
criterio_noche = case_when(noche_0 > 40 ~ "mas de 40",
40 > noche_0 &
noche_0 > 30 ~ "40 - 30",
30 > noche_0 &
noche_0 > 20 ~ "30 - 20",
20 > noche_0 &
noche_0 > 10 ~ "20 - 10",
10 > noche_0 &
noche_0 > 1 ~ "10 - 1",
1 > noche_0 &
noche_0> -1 ~ "sin cambios",
-1 > noche_0 &
noche_0 > -10 ~ "-1 - -10",
-10 > noche_0 &
noche_0 > -20 ~ "-10 - -20",
-20 > noche_0 &
noche_0 > -30 ~ "-20 - -30",
-30 > noche_0 &
noche_0 > -40 ~ "-30 - -40",
-40 > noche_0 ~ "menor a -40")) |>
dplyr::mutate(criterio = fct_relevel(criterio, c("mas de 40",
"40 - 30",
"30 - 20",
"20 - 10","10 - 1",
"sin cambios",
"-1 - -10",
"-10 - -20",
"-20 - -30",
"-30 - -40",
"menor a -40")),
criterio_noche = fct_relevel(criterio_noche,
c("mas de 40",
"40 - 30",
"30 - 20",
"20 - 10",
"10 - 1",
"sin cambios",
"-1 - -10",
"-10 - -20",
"-20 - -30",
"-30 - -40",
"menor a -40"))) |>
st_as_sf()
#write_sf(px_bsas, "data/procesada/px_baires_demo_app.gpkg")
```
## 3. Mapa de provincia de Buenos Aires
```{r warning=FALSE}
# escala de color por categoria
colors <- c("mas de 40"="#67001F",
"40 - 30"="#B2182B",
"30 - 20"="#D6604D",
"20 - 10"="#F4A582",
"10 - 1"="#FDDBC7",
"sin cambios"="#F7F7F7",
"-1 - -10" ="#D1E5F0",
"-10 - -20"="#92C5DE",
"-20 - -30"="#4393C3",
"-30 - -40"="#2166AC",
"menor a -40"="#053061")
plotly::plot_ly() |>
plotly::add_sf(stroke = I("#95B2C6"),
data = px_bsas,
split = ~criterio,
name = ~criterio,
color = ~criterio,
colors = colors,
stroke = I("transparent"),
hoveron = "fills",
hoverinfo = 'name',
legendgroup = 'criterio',
legendgrouptitle = list(text = 'Promedio % de cambio',
font = list(size = 15,
family = "Work Sans",
color = "black"))
)
```