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CUB818 Vorlesung Genetik und Genomforschung

Genetics

CUB818 Vorlesung Genetik und Genomforschung

Wintersemester 2015/2016

CUB818 Vorlesung Genetik und Genomforschung (Peter N. Robinson) Zeit: Di 08:00-10:00 (Erster Termin: 13.10.2015) "ct" Ort: SR 025/026/A6 Seminarraum (Arnimallee 6)

Übungen CUB819 Übungen zu Genetik (Peter N. Robinson) Zeit: Do 10:00-12:00 (Erster Termin: 23.10.2015) Ort: SR 007/008/A6 Seminarraum (Arnimallee 6)

Die Bioinformatik bedient sich der Informatik, Mathematik, Statistik und EDV, um biologische Daten zu sammeln, organisieren und analysieren. Die biologischen Daten kommen von vielen Bereichen der Wissenschaft, Medizin und Industrie, hierbei spielt jedoch die Genetik eine besondere Rolle. Das Ziel dieser Vorlesungsreihe ist es, Studierenden der Bioinformatik die Grundlagen der Genetik und der Humangenetik zu vermitteln, ohne die ein Verständnis von bioinformatischen Algorithmen und Analysen genetischer Daten nicht möglich ist. Das primäre Ziel dieser Vorlesungsreihe ist nicht die Vermittlung von Algorithmen, jedoch sollen Verknüpfungspunkte zwischen der Genetik und der (Bio)informatik aufgezeigt werden, um auf entsprechende Lehrveranstaltungen in späteren Semstern vorzubereiten. Einfache matlab-Skripten werden zur Verdeutlichung einiger Themen in den Übungen besprochen werden.

Klausur

Am Donnerstag, den 4. Februar 2015 Zeit: 10:00 - 12:00 Ort: Große Hörsaal in der Physik (Raum 0.3.12, Arnimallee 14)

Material

Übungsblatt für Donnerstag den 10. Dezember 2015=Übungsblatt 4 (neu!)

Übungsblätter

• Übung 1.
• Übung 2.
• Übung 3.
• Übung 4.
• Übung 5.
• Übung: RNA.
• Nussinov-Algorithmus (Ergänzung zur Übung vom 17.12.15): Nussinov-Algorithmus.
• Übung: miRNA.
• Übung: Exom.

Vorlesungsfolien

• Vorlesung 0: Evolution.
• Vorlesung 1: Chromosomen.
• Vorlesung 2: Das Genome.
• Vorlesung 3: Aufbau des humanen Genoms.
• Vorlesung 4: Vererbungsmuster und Einführung in die Populationsgenetik.
• Vorlesung 5: Das Hardy-Weinberg Gesetz.
• Vorlesung 6: Kopplungsungleichgewicht (LD).
• Vorlesung 7: Genetische Kartierung und lod-Score-Analyse.
• Vorlesung 8: Polygene Krankheiten und Assoziationsanalyse.
• Vorlesung 9: RNA.
• Vorlesung 10: miRNA.
• Vorlesung 11: Mutationen.
• Vorlesung 12: Transkription.
• Vorlesung 13: NGS und Exomsequenzierung.