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Deploy Testing enviroment

Dependencias:

  • Docker version 25.0.1
  • git version 2.39.3
  • Usuario pertencente ao grupo ton(15010)
  • Acesso ao lustre
  • Acesso ao banco de dados desdb4 - prod_gavo
  • Acesso a um banco de dados especifico para o portal.
  • Chave ssh criada no home do usuario.
  • Acesso ao slurm para execução do pipeline de predição.

Estes passos foram usados no deploy do ambiente: http://tno-dev.linea.org.br

Considerando:

  • Maquina srvnode06
  • Usuario app.tno (31670:15010)
  • Instalação feita no path: /lustre/t1/scratch/users/app.tno/tno_dev
  • Chave ssh previamente criada em: /lustre/t1/scratch/users/app.tno/.ssh/id_rsa

Criação das pastas e arquivos de configuração do ambiente

Clone do repositório para uma pasta temporaria tno_temp, Criação das pastas e arquivos de configuração, remoção dos arquivos usados na instalação.

git clone https://github.com/linea-it/tno.git tno_temp \
&& cp -r tno_temp/compose/testing tno_dev \
&& cp tno_temp/predict_occultation/environment.py3.yml tno_dev \
&& mkdir -p tno_dev tno_dev/logs tno_dev/data tno_dev/data/rabbitmq \
&& chmod -R g+w tno_dev \
&& cd tno_dev \
&& mv env-template .env \
&& mv docker-compose-template.yml docker-compose.yml \
&& mv local_settings-template.py local_settings.py \
&& mv nginx_proxy-template.conf nginx_proxy.conf

Daqui em diante todos os comandos estão considerando que a pasta atual é tno_dev.

Instalação do Miniconda

Este miniconda é usado pelo pipeline predict_occultation e é especifico para este ambiente.

IMPORTANTE No momento a instalação do miniconda está falhando quando executada direto da srvnode06. O workaround é executar os proximos comandos a partir da maquina srvnode04. mas usando o mesmo usuario app.tno e o mesmo diretório. Pode ser necessário alterar o path onde o miniconda sera instalado. basta editar o script e fazer a alteração de acordo com o path.

miniconda_path="/lustre/t1/scratch/users/app.tno/<PROJ_DIR>/miniconda"

Dentro da pasta existe um script install_miniconda.sh esse script baixa e instala o miniconda no path configurado na variavel miniconda_path. Execute os comandos a seguir para criar o enviroment py3

./install_miniconda.sh \
&& source miniconda/bin/activate \
&& conda env create -f environment.py3.yml \
&& conda deactivate \
&& cd .. && rm -rf tno_temp tno_dev/environment.py3.yml tno_dev/install_miniconda.sh && cd tno_dev

Configuração das Variaveis de ambiente

Os arquivos de configuração .env e local_settings já estão preenchidos com valores compativeis com o ambiente de testing. Mas é necessário alterar/preencher as variaveis relacionadas a segurança e acessos.

vim .env

No momento deste documento as variaveis a serem editadas são:

  • DJANGO_SECRET_KEY
  • RABBITMQ_DEFAULT_PASS
  • DB_ADMIN_URI
  • DB_CATALOG_URI

Alterar o arquivo de configuração do Django de acordo com a necessidade.

vim local_settings.py

IMPORTANTE! Editar o arquivo docker-compose.yml e conferir os pontos de montagem principalmente o serviço predict_occultation que precisa de uma chave ssh no home do usuario app.tno.

Para preencher a variavel de ambiente .env/DJANGO_SECRET_KEY é necessário executar um comando dentro do container de backend para gerar uma chave aleatória.

docker compose run -it --rm backend python -c "import secrets; print(secrets.token_urlsafe())"

Copie a saida do comando e prencha a variavel DJANGO_SECRET_KEY.

Setup Backend

Crie um usuario administrativo para o Django.

docker compose run -it --rm backend python manage.py createsuperuser

Crie os indexes Q3C para as tabelas que utilizam index espacial.

docker compose run -it --rm backend python manage.py create_q3c_index

Load Initial Data (LeapSecond, BspPlanetary, Stelar Catalog)

docker compose run -it --rm backend python manage.py loaddata initial_data.yaml

Load Initial Asteroids Data

docker compose run -it --rm backend python manage.py update_asteroid_table

A criação da tabela de asteorids demora alguns minutos.

Workaround:

A criação da tabela de asteroid depende de 2 arquivos baixados de serviços externos pode ser que ao executar o comando de algum erro caso esses arquivos estejam indisponiveis. Para corrigir isso utilize os arquivos de sample deixados no home do usuario app.tno e execute o comando com a opcao --local.

cp /lustre/t1/scratch/users/app.tno/data_sample/ssoBFT-latest.ecsv.bz2 data/asteroid_table/ \
&& cp /lustre/t1/scratch/users/app.tno/data_sample/mpcorb_extended.json.gz data/asteroid_table/ \
&& docker compose run -it --rm backend python manage.py update_asteroid_table --local

Procedimento de Start e Stop do ambiente

Para ligar todo o ambiente:

docker compose up -d

Para desligar todo o ambiente:

docker compose stop

Reiniciar o ambiente

docker compose stop && docker compose up -d

Procedimento de Update de versão

As imagens docker são geradas automaticamente pelo github actions e estão disponiveis no docker.io https://hub.docker.com/repository/docker/linea/tno/tags?page=1&ordering=last_updated

Exemplo para atualizar as imagens da versão f19ff50 para 4bcaebe

Editar o arquivo .env e alterar a variavel com docker tag desejada.

Antes

# tno_dev/.env
TNO_IMAGE_TAG=f19ff50
...

Depois

# tno_dev/.env
TNO_IMAGE_TAG=4bcaebe
...

Após alterar a imagem basta fazer um pull das novas docker images e restartar os serviços.

docker compose pull && docker compose stop && docker compose up -d