title : R, avoin data ja toistettavat analyysit subtitle : Geoinformatiikan tutkimuspäivät 2013 author : Joona Lehtomäki job : Louhos license : by-sa github : user : louhos repo : gtpLouhos framework : io2012 # {io2012, html5slides, shower, dzslides, ...} highlighter : highlight.js # {highlight.js, prettify, highlight} hitheme : tomorrow # widgets : [bootstrap] # {mathjax, quiz, bootstrap} mode : selfcontained # {standalone, draft}
--- &vcenter
- Helsingin yliopisto, biotieteiden laitos, Conservation Biology Informatics Group
- Suomen ympäristökeskus, luontoympäristökeskus
- Louhos-yhteisö
--- #louhos-intro ¬itle bg:black
<iframe src="http://louhos.github.io/">O-ou, ei onnistu...</iframe>--- bg:url(assets/img/louhos_admins.png) bg-repeat:no-repeat bg-position:center
--- #gradu-workflow bg:url(assets/img/gradu_workflow.png)
--- #problem
**Tutkimuksessa**
Kuilu julkaisun ja toistettavuuden välillä
Päätöksenteossa
Onko päätöksenteko palautettavissa aineistoon ja tutkimuksiin?
--- #R-intro1 bg:url(assets/img/R_command_line.png) bg-repeat:no-repeat bg-position:center
--- #R-intro2 &vcenter
- Avoimen lähdekoodin ohjelmointikieli ja tilastollisen laskennan ympäristö
- Komentorivipohjainen ja vuorovaikutteinen
- Grafiikkaominaisuudet
- Laaja käyttäjä- ja kehittäjäyhteisö
- Rakenteeltaan modulaarinen ja laajennettavissa
--- #R-intro3 &vcenter
Liikenne sähköpostilistoilla (listerv)
Lähde: r4stats.com
--- #r-ecosystem bg:url(assets/img/ecosystem.jpg) bg-repeat:no-repeat bg-position:center
Photo by premus on Flickr, CC-BY
--- #R-intro5 &vcenter
6275
Lähde: r4stats.com
R-pakettien lukumäärä 19.3.2013
--- #r-ecosystem2 &vcenter
--- #markdown
<iframe src="http://markable.in/editor/">O-ou, ei onnistu...</iframe>--- #r-ecosystem2 bg:black
<iframe src="http://sorvivalas.com:8787/ ">O-ou, ei onnistu...</iframe>--- #r-ecosystem3 &vcenter
Lähde: Markus Kainu--- #xkcd &vcenter
Lähde: XKCD 1168
--- #sorvi-intro &vcenter
- Datan saatavuus joustavat datan haku- ja putsausrutiinit
- Läpinäkyvyys ja toistettavuus kaikki vaiheet yhdessä koodissa
- Uusia tutkimusvälineitä sovelluksia täydentämään
- Vuorovaikutteisuus nopea datan seulonta ja visualisointi
- Lokalisoitu kotimaisiin tarpeisiin
http://louhos.github.io/sorvi/
--- #datawiki-intro &vcenter
- Datakatalogi mukana n. 20 kotimaista tietolähdettä
- Käyttöesimerkit toistettavat esimerkit sorvilla
- Kehittäjäyhteisön tuki kaikki voivat osallistua
http://louhos.github.io/datawiki
--- #kuntajako-1 &vcenter
Lähde: Louhos-blogi
--- #kuntajako-2 bg:url(assets/img/datawiki_kuntajako.png) bg-repeat:no-repeat bg-position:center
--- #hsy-pks-1 &vcenter
--- #kuntajako-2 bg:url(assets/img/datawiki_hsy.png) bg-repeat:no-repeat bg-position:center
--- #summary &vcenter
Toistettavuus ja läpinäkyvyys
paranee kun avaamme ja jaamme
dataa
koodin
osaamista
--- #kuntajako-2 bg:url(assets/img/kiitos.png) bg-repeat:no-repeat bg-position:center