-
Notifications
You must be signed in to change notification settings - Fork 3
/
v1.0_issues.bed
443 lines (443 loc) · 27.3 KB
/
v1.0_issues.bed
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
343
344
345
346
347
348
349
350
351
352
353
354
355
356
357
358
359
360
361
362
363
364
365
366
367
368
369
370
371
372
373
374
375
376
377
378
379
380
381
382
383
384
385
386
387
388
389
390
391
392
393
394
395
396
397
398
399
400
401
402
403
404
405
406
407
408
409
410
411
412
413
414
415
416
417
418
419
420
421
422
423
424
425
426
427
428
429
430
431
432
433
434
435
436
437
438
439
440
441
442
443
chr1 94 159 Error_Kmer 100 . 94 159 0,0,0
chr1 855206 864829 Low_Qual 100 . 855206 864829 204,0,0
chr1 859590 859614 Error_Kmer 100 . 859590 859614 0,0,0
chr1 859703 859737 Error_Kmer 100 . 859703 859737 0,0,0
chr1 859785 859819 Error_Kmer 100 . 859785 859819 0,0,0
chr1 859867 859919 Error_Kmer 100 . 859867 859919 0,0,0
chr1 860168 860232 Error_Kmer 100 . 860168 860232 0,0,0
chr1 861034 861067 Error_Kmer 100 . 861034 861067 0,0,0
chr1 861069 861090 Error_Kmer 100 . 861069 861090 0,0,0
chr1 24541741 24546491 Low 100 . 24541741 24546491 204,0,0
chr1 31691184 31691213 Error_Kmer 100 . 31691184 31691213 0,0,0
chr1 40071274 40071303 Error_Kmer 100 . 40071274 40071303 0,0,0
chr1 98144607 98144637 Error_Kmer 100 . 98144607 98144637 0,0,0
chr1 103696606 103701345 Low 100 . 103696606 103701345 204,0,0
chr1 137919935 137922215 Low 100 . 137919935 137922215 204,0,0
chr1 161788652 161788685 Error_Kmer 100 . 161788652 161788685 0,0,0
chr1 164288249 164288279 Error_Kmer 100 . 164288249 164288279 0,0,0
chr1 170808003 170808024 Error_Kmer 100 . 170808003 170808024 0,0,0
chr1 176297673 176297698 Error_Kmer 100 . 176297673 176297698 0,0,0
chr1 179589802 179589830 Error_Kmer 100 . 179589802 179589830 0,0,0
chr1 193561778 193561804 Error_Kmer 100 . 193561778 193561804 0,0,0
chr1 209667155 209667183 Error_Kmer 100 . 209667155 209667183 0,0,0
chr1 242937723 242937744 Error_Kmer 100 . 242937723 242937744 0,0,0
chr10 4 44 Error_Kmer 100 . 4 44 0,0,0
chr10 109 145 Error_Kmer 100 . 109 145 0,0,0
chr10 7461516 7461537 Error_Kmer 100 . 7461516 7461537 0,0,0
chr10 10289067 10289096 Error_Kmer 100 . 10289067 10289096 0,0,0
chr10 19474075 19474097 Error_Kmer 100 . 19474075 19474097 0,0,0
chr10 55292558 55292583 Error_Kmer 100 . 55292558 55292583 0,0,0
chr10 81323597 81323639 Error_Kmer 100 . 81323597 81323639 0,0,0
chr10 85916074 85916102 Error_Kmer 100 . 85916074 85916102 0,0,0
chr10 98128436 98135476 Low_Qual 100 . 98128436 98135476 204,0,0
chr10 98134221 98134243 Error_Kmer 100 . 98134221 98134243 0,0,0
chr10 98367070 98367098 Error_Kmer 100 . 98367070 98367098 0,0,0
chr10 112126883 112134329 Low_Qual 100 . 112126883 112134329 204,0,0
chr10 112128874 112128908 Error_Kmer 100 . 112128874 112128908 0,0,0
chr10 112129020 112129043 Error_Kmer 100 . 112129020 112129043 0,0,0
chr10 112129322 112129354 Error_Kmer 100 . 112129322 112129354 0,0,0
chr10 112129402 112129432 Error_Kmer 100 . 112129402 112129432 0,0,0
chr10 112129438 112129466 Error_Kmer 100 . 112129438 112129466 0,0,0
chr10 112132961 112132982 Error_Kmer 100 . 112132961 112132982 0,0,0
chr10 112133070 112133091 Error_Kmer 100 . 112133070 112133091 0,0,0
chr10 112133230 112133266 Error_Kmer 100 . 112133230 112133266 0,0,0
chr10 112133269 112133319 Error_Kmer 100 . 112133269 112133319 0,0,0
chr10 112133337 112133359 Error_Kmer 100 . 112133337 112133359 0,0,0
chr10 112133382 112133443 Error_Kmer 100 . 112133382 112133443 0,0,0
chr10 112133453 112133475 Error_Kmer 100 . 112133453 112133475 0,0,0
chr10 112133563 112133603 Error_Kmer 100 . 112133563 112133603 0,0,0
chr10 112133620 112133641 Error_Kmer 100 . 112133620 112133641 0,0,0
chr10 129374283 129374306 Error_Kmer 100 . 129374283 129374306 0,0,0
chr10 129375507 129375528 Error_Kmer 100 . 129375507 129375528 0,0,0
chr10 129375914 129375942 Error_Kmer 100 . 129375914 129375942 0,0,0
chr10 129376024 129376081 Error_Kmer 100 . 129376024 129376081 0,0,0
chr10 129377797 129377821 Error_Kmer 100 . 129377797 129377821 0,0,0
chr10 134671720 134692729 Low_Qual 100 . 134671720 134692729 204,0,0
chr10 134682000 134682028 Error_Kmer 100 . 134682000 134682028 0,0,0
chr10 134683581 134683619 Error_Kmer 100 . 134683581 134683619 0,0,0
chr10 134683704 134683726 Error_Kmer 100 . 134683704 134683726 0,0,0
chr10 134683776 134683803 Error_Kmer 100 . 134683776 134683803 0,0,0
chr10 134684004 134684042 Error_Kmer 100 . 134684004 134684042 0,0,0
chr10 134686260 134686289 Error_Kmer 100 . 134686260 134686289 0,0,0
chr10 134686945 134686974 Error_Kmer 100 . 134686945 134686974 0,0,0
chr10 134688026 134688052 Error_Kmer 100 . 134688026 134688052 0,0,0
chr10 134688930 134688969 Error_Kmer 100 . 134688930 134688969 0,0,0
chr10 134689609 134689649 Error_Kmer 100 . 134689609 134689649 0,0,0
chr11 68 152 Error_Kmer 100 . 68 152 0,0,0
chr11 7268974 7269003 Error_Kmer 100 . 7268974 7269003 0,0,0
chr11 8255225 8260766 Low_Qual 100 . 8255225 8260766 204,0,0
chr11 8257986 8258024 Error_Kmer 100 . 8257986 8258024 0,0,0
chr11 47701641 47701673 Error_Kmer 100 . 47701641 47701673 0,0,0
chr11 54243485 54285164 Low 100 . 54243485 54285164 204,0,0
chr11 54335315 54344716 Low_Qual 100 . 54335315 54344716 204,0,0
chr11 54337535 54337556 Error_Kmer 100 . 54337535 54337556 0,0,0
chr11 54341555 54341581 Error_Kmer 100 . 54341555 54341581 0,0,0
chr11 54342605 54342631 Error_Kmer 100 . 54342605 54342631 0,0,0
chr11 74007192 74007218 Error_Kmer 100 . 74007192 74007218 0,0,0
chr11 78637474 78637496 Error_Kmer 100 . 78637474 78637496 0,0,0
chr11 80089940 80089969 Error_Kmer 100 . 80089940 80089969 0,0,0
chr11 101940151 101940173 Error_Kmer 100 . 101940151 101940173 0,0,0
chr11 110054555 110054577 Error_Kmer 100 . 110054555 110054577 0,0,0
chr11 133873344 133875463 Low_Qual 100 . 133873344 133875463 204,0,0
chr11 133875361 133875384 Error_Kmer 100 . 133875361 133875384 0,0,0
chr11 133875396 133875424 Error_Kmer 100 . 133875396 133875424 0,0,0
chr11 135127440 135127464 Error_Kmer 100 . 135127440 135127464 0,0,0
chr12 41012686 41012716 Error_Kmer 100 . 41012686 41012716 0,0,0
chr12 63962530 63962554 Error_Kmer 100 . 63962530 63962554 0,0,0
chr12 66695006 66695036 Error_Kmer 100 . 66695006 66695036 0,0,0
chr12 73677141 73677167 Error_Kmer 100 . 73677141 73677167 0,0,0
chr12 84063414 84063442 Error_Kmer 100 . 84063414 84063442 0,0,0
chr12 86976020 86976052 Error_Kmer 100 . 86976020 86976052 0,0,0
chr12 126838745 126844418 Low_Qual 100 . 126838745 126844418 204,0,0
chr12 126839614 126839640 Error_Kmer 100 . 126839614 126839640 0,0,0
chr12 133004261 133015032 Low_Qual 100 . 133004261 133015032 204,0,0
chr12 133005247 133005288 Error_Kmer 100 . 133005247 133005288 0,0,0
chr12 133005305 133005326 Error_Kmer 100 . 133005305 133005326 0,0,0
chr12 133005504 133005542 Error_Kmer 100 . 133005504 133005542 0,0,0
chr12 133005560 133005581 Error_Kmer 100 . 133005560 133005581 0,0,0
chr12 133005632 133005660 Error_Kmer 100 . 133005632 133005660 0,0,0
chr12 133005823 133005844 Error_Kmer 100 . 133005823 133005844 0,0,0
chr12 133006197 133006225 Error_Kmer 100 . 133006197 133006225 0,0,0
chr12 133006553 133006574 Error_Kmer 100 . 133006553 133006574 0,0,0
chr12 133006595 133006618 Error_Kmer 100 . 133006595 133006618 0,0,0
chr12 133006957 133006987 Error_Kmer 100 . 133006957 133006987 0,0,0
chr12 133007184 133007205 Error_Kmer 100 . 133007184 133007205 0,0,0
chr12 133007337 133007358 Error_Kmer 100 . 133007337 133007358 0,0,0
chr12 133007462 133007502 Error_Kmer 100 . 133007462 133007502 0,0,0
chr12 133007524 133007545 Error_Kmer 100 . 133007524 133007545 0,0,0
chr12 133007909 133007934 Error_Kmer 100 . 133007909 133007934 0,0,0
chr12 133008015 133008044 Error_Kmer 100 . 133008015 133008044 0,0,0
chr12 133008476 133008499 Error_Kmer 100 . 133008476 133008499 0,0,0
chr12 133008900 133008921 Error_Kmer 100 . 133008900 133008921 0,0,0
chr12 133009096 133009117 Error_Kmer 100 . 133009096 133009117 0,0,0
chr12 133009135 133009156 Error_Kmer 100 . 133009135 133009156 0,0,0
chr12 133009270 133009291 Error_Kmer 100 . 133009270 133009291 0,0,0
chr12 133009744 133009765 Error_Kmer 100 . 133009744 133009765 0,0,0
chr12 133009982 133010021 Error_Kmer 100 . 133009982 133010021 0,0,0
chr12 133010067 133010096 Error_Kmer 100 . 133010067 133010096 0,0,0
chr12 133010201 133010229 Error_Kmer 100 . 133010201 133010229 0,0,0
chr12 133010439 133010477 Error_Kmer 100 . 133010439 133010477 0,0,0
chr12 133010710 133010747 Error_Kmer 100 . 133010710 133010747 0,0,0
chr12 133010892 133010913 Error_Kmer 100 . 133010892 133010913 0,0,0
chr12 133011003 133011025 Error_Kmer 100 . 133011003 133011025 0,0,0
chr12 133011079 133011100 Error_Kmer 100 . 133011079 133011100 0,0,0
chr12 133011662 133011687 Error_Kmer 100 . 133011662 133011687 0,0,0
chr12 133324585 133324669 Error_Kmer 100 . 133324585 133324669 0,0,0
chr12 133324670 133324731 Error_Kmer 100 . 133324670 133324731 0,0,0
chr12 133324734 133324781 Error_Kmer 100 . 133324734 133324781 0,0,0
chr13 70 101 Error_Kmer 100 . 70 101 0,0,0
chr13 185 208 Error_Kmer 100 . 185 208 0,0,0
chr13 2279803 2280481 Low 100 . 2279803 2280481 204,0,0
chr13 48022001 48022022 Error_Kmer 100 . 48022001 48022022 0,0,0
chr13 81360634 81360664 Error_Kmer 100 . 81360634 81360664 0,0,0
chr13 114238955 114238993 Error_Kmer 100 . 114238955 114238993 0,0,0
chr14 33 69 Error_Kmer 100 . 33 69 0,0,0
chr14 92 120 Error_Kmer 100 . 92 120 0,0,0
chr14 121 156 Error_Kmer 100 . 121 156 0,0,0
chr14 16891628 16891653 Error_Kmer 100 . 16891628 16891653 0,0,0
chr14 23570547 23570568 Error_Kmer 100 . 23570547 23570568 0,0,0
chr14 26616480 26616510 Error_Kmer 100 . 26616480 26616510 0,0,0
chr14 30821854 30821885 Error_Kmer 100 . 30821854 30821885 0,0,0
chr14 45850534 45850556 Error_Kmer 100 . 45850534 45850556 0,0,0
chr14 61704395 61704418 Error_Kmer 100 . 61704395 61704418 0,0,0
chr14 76863146 76863173 Error_Kmer 100 . 76863146 76863173 0,0,0
chr14 81258959 81258984 Error_Kmer 100 . 81258959 81258984 0,0,0
chr14 82215231 82215261 Error_Kmer 100 . 82215231 82215261 0,0,0
chr14 101219108 101219137 Error_Kmer 100 . 101219108 101219137 0,0,0
chr15 5 49 Error_Kmer 100 . 5 49 0,0,0
chr15 500937 543033 Low_Qual 100 . 500937 543033 204,0,0
chr15 504732 504769 Error_Kmer 100 . 504732 504769 0,0,0
chr15 505020 505055 Error_Kmer 100 . 505020 505055 0,0,0
chr15 505201 505234 Error_Kmer 100 . 505201 505234 0,0,0
chr15 508822 508846 Error_Kmer 100 . 508822 508846 0,0,0
chr15 521742 521773 Error_Kmer 100 . 521742 521773 0,0,0
chr15 17921064 17927074 Low 100 . 17921064 17927074 204,0,0
chr15 24961066 24961094 Error_Kmer 100 . 24961066 24961094 0,0,0
chr15 35569501 35569531 Error_Kmer 100 . 35569501 35569531 0,0,0
chr15 36007535 36007562 Error_Kmer 100 . 36007535 36007562 0,0,0
chr15 51510982 51511010 Error_Kmer 100 . 51510982 51511010 0,0,0
chr15 54978215 54978239 Error_Kmer 100 . 54978215 54978239 0,0,0
chr15 73349094 73349123 Error_Kmer 100 . 73349094 73349123 0,0,0
chr15 75481039 75488516 Low_Qual 100 . 75481039 75488516 204,0,0
chr15 75482605 75482631 Error_Kmer 100 . 75482605 75482631 0,0,0
chr15 79680511 79680541 Error_Kmer 100 . 79680511 79680541 0,0,0
chr15 100336069 100336098 Error_Kmer 100 . 100336069 100336098 0,0,0
chr15 100338138 100338198 Error_Kmer 100 . 100338138 100338198 0,0,0
chr15 100338275 100338308 Error_Kmer 100 . 100338275 100338308 0,0,0
chr16 16331577 16338393 Low_Qual 100 . 16331577 16338393 204,0,0
chr16 16331906 16331929 Error_Kmer 100 . 16331906 16331929 0,0,0
chr16 30639383 30650070 Low 100 . 30639383 30650070 204,0,0
chr16 36735111 36775613 Low_Qual 100 . 36735111 36775613 204,0,0
chr16 36754725 36754757 Error_Kmer 100 . 36754725 36754757 0,0,0
chr16 36757200 36757229 Error_Kmer 100 . 36757200 36757229 0,0,0
chr16 84758357 84758386 Error_Kmer 100 . 84758357 84758386 0,0,0
chr16 92408881 92408912 Error_Kmer 100 . 92408881 92408912 0,0,0
chr16 96330287 96330328 Error_Kmer 100 . 96330287 96330328 0,0,0
chr16 96330405 96330457 Error_Kmer 100 . 96330405 96330457 0,0,0
chr17 250 328 Error_Kmer 100 . 250 328 0,0,0
chr17 420 444 Error_Kmer 100 . 420 444 0,0,0
chr17 1586327 1586352 Error_Kmer 100 . 1586327 1586352 0,0,0
chr17 8544893 8544921 Error_Kmer 100 . 8544893 8544921 0,0,0
chr17 76054087 76054110 Error_Kmer 100 . 76054087 76054110 0,0,0
chr17 84276890 84276912 Error_Kmer 100 . 84276890 84276912 0,0,0
chr17 84276989 84277042 Error_Kmer 100 . 84276989 84277042 0,0,0
chr17 84277051 84277090 Error_Kmer 100 . 84277051 84277090 0,0,0
chr17 84277158 84277185 Error_Kmer 100 . 84277158 84277185 0,0,0
chr18 135 171 Error_Kmer 100 . 135 171 0,0,0
chr18 4988 5026 Error_Kmer 100 . 4988 5026 0,0,0
chr18 125679 139277 Low_Qual 100 . 125679 139277 204,0,0
chr18 129991 130015 Error_Kmer 100 . 129991 130015 0,0,0
chr18 131558 131582 Error_Kmer 100 . 131558 131582 0,0,0
chr18 132730 132761 Error_Kmer 100 . 132730 132761 0,0,0
chr18 133073 133094 Error_Kmer 100 . 133073 133094 0,0,0
chr18 133419 133479 Error_Kmer 100 . 133419 133479 0,0,0
chr18 178768 205365 Low_Qual 100 . 178768 205365 204,0,0
chr18 183403 183441 Error_Kmer 100 . 183403 183441 0,0,0
chr18 186917 186954 Error_Kmer 100 . 186917 186954 0,0,0
chr18 189629 189651 Error_Kmer 100 . 189629 189651 0,0,0
chr18 196953 196986 Error_Kmer 100 . 196953 196986 0,0,0
chr18 11939068 11939091 Error_Kmer 100 . 11939068 11939091 0,0,0
chr18 25227387 25229168 Low_Qual 100 . 25227387 25229168 204,0,0
chr18 25228465 25228492 Error_Kmer 100 . 25228465 25228492 0,0,0
chr18 26047836 26047862 Error_Kmer 100 . 26047836 26047862 0,0,0
chr18 51275138 51275167 Error_Kmer 100 . 51275138 51275167 0,0,0
chr18 67629207 67629231 Error_Kmer 100 . 67629207 67629231 0,0,0
chr18 73504016 73504042 Error_Kmer 100 . 73504016 73504042 0,0,0
chr19 0 35 Error_Kmer 100 . 0 35 0,0,0
chr19 620 641 Error_Kmer 100 . 620 641 0,0,0
chr19 1008953 1017102 Low_Qual 100 . 1008953 1017102 204,0,0
chr19 1012262 1012295 Error_Kmer 100 . 1012262 1012295 0,0,0
chr19 1012312 1012345 Error_Kmer 100 . 1012312 1012345 0,0,0
chr19 1012369 1012403 Error_Kmer 100 . 1012369 1012403 0,0,0
chr19 1012522 1012556 Error_Kmer 100 . 1012522 1012556 0,0,0
chr19 1012729 1012752 Error_Kmer 100 . 1012729 1012752 0,0,0
chr19 1012797 1012819 Error_Kmer 100 . 1012797 1012819 0,0,0
chr19 1013527 1013562 Error_Kmer 100 . 1013527 1013562 0,0,0
chr19 1014044 1014077 Error_Kmer 100 . 1014044 1014077 0,0,0
chr19 2347906 2354790 Low_Qual 100 . 2347906 2354790 204,0,0
chr19 2350683 2350721 Error_Kmer 100 . 2350683 2350721 0,0,0
chr19 2351427 2351460 Error_Kmer 100 . 2351427 2351460 0,0,0
chr19 2351527 2351548 Error_Kmer 100 . 2351527 2351548 0,0,0
chr19 2351740 2351762 Error_Kmer 100 . 2351740 2351762 0,0,0
chr19 15433084 15433112 Error_Kmer 100 . 15433084 15433112 0,0,0
chr19 16733139 16733167 Error_Kmer 100 . 16733139 16733167 0,0,0
chr19 24094666 24094692 Error_Kmer 100 . 24094666 24094692 0,0,0
chr19 28509243 28519604 Chimeric_Hap 100 . 28509243 28519604 204,0,0
chr19 28527178 28538917 Chimeric_Hap 100 . 28527178 28538917 204,0,0
chr19 41394403 41394434 Error_Kmer 100 . 41394403 41394434 0,0,0
chr19 42144978 42145159 Low 100 . 42144978 42145159 204,0,0
chr19 56485446 56485474 Error_Kmer 100 . 56485446 56485474 0,0,0
chr19 58806945 58817092 Low_Qual 100 . 58806945 58817092 204,0,0
chr19 58809891 58809918 Error_Kmer 100 . 58809891 58809918 0,0,0
chr19 58810609 58810635 Error_Kmer 100 . 58810609 58810635 0,0,0
chr19 58810652 58810681 Error_Kmer 100 . 58810652 58810681 0,0,0
chr19 58810717 58810750 Error_Kmer 100 . 58810717 58810750 0,0,0
chr19 58810922 58810970 Error_Kmer 100 . 58810922 58810970 0,0,0
chr19 58811061 58811125 Error_Kmer 100 . 58811061 58811125 0,0,0
chr19 58811199 58811227 Error_Kmer 100 . 58811199 58811227 0,0,0
chr19 58811614 58811648 Error_Kmer 100 . 58811614 58811648 0,0,0
chr19 58812339 58812393 Error_Kmer 100 . 58812339 58812393 0,0,0
chr19 58812428 58812449 Error_Kmer 100 . 58812428 58812449 0,0,0
chr19 58812701 58812722 Error_Kmer 100 . 58812701 58812722 0,0,0
chr19 58812731 58812780 Error_Kmer 100 . 58812731 58812780 0,0,0
chr19 58812874 58812900 Error_Kmer 100 . 58812874 58812900 0,0,0
chr19 58812930 58812951 Error_Kmer 100 . 58812930 58812951 0,0,0
chr19 58812979 58813005 Error_Kmer 100 . 58812979 58813005 0,0,0
chr19 58813017 58813078 Error_Kmer 100 . 58813017 58813078 0,0,0
chr19 58813150 58813178 Error_Kmer 100 . 58813150 58813178 0,0,0
chr19 61707074 61707143 Error_Kmer 100 . 61707074 61707143 0,0,0
chr19 61707292 61707328 Error_Kmer 100 . 61707292 61707328 0,0,0
chr19 61707336 61707359 Error_Kmer 100 . 61707336 61707359 0,0,0
chr2 29 56 Error_Kmer 100 . 29 56 0,0,0
chr2 32955941 32955971 Error_Kmer 100 . 32955941 32955971 0,0,0
chr2 35847916 35847941 Error_Kmer 100 . 35847916 35847941 0,0,0
chr2 36922395 36922425 Error_Kmer 100 . 36922395 36922425 0,0,0
chr2 67964463 67964489 Error_Kmer 100 . 67964463 67964489 0,0,0
chr2 75124744 75124770 Error_Kmer 100 . 75124744 75124770 0,0,0
chr2 83764057 83764078 Error_Kmer 100 . 83764057 83764078 0,0,0
chr2 88190828 88200021 Low_Qual 100 . 88190828 88200021 204,0,0
chr2 88197106 88197144 Error_Kmer 100 . 88197106 88197144 0,0,0
chr2 92009345 92009374 Error_Kmer 100 . 92009345 92009374 0,0,0
chr2 173553253 173553281 Error_Kmer 100 . 173553253 173553281 0,0,0
chr2 174742800 174742831 Error_Kmer 100 . 174742800 174742831 0,0,0
chr2 234896425 234896452 Error_Kmer 100 . 234896425 234896452 0,0,0
chr2 237006459 237006486 Error_Kmer 100 . 237006459 237006486 0,0,0
chr2 242696644 242696677 Error_Kmer 100 . 242696644 242696677 0,0,0
chr2 242696718 242696746 Error_Kmer 100 . 242696718 242696746 0,0,0
chr20 140 180 Error_Kmer 100 . 140 180 0,0,0
chr20 181 273 Error_Kmer 100 . 181 273 0,0,0
chr20 862165 868076 Low_Qual 100 . 862165 868076 204,0,0
chr20 863741 863779 Error_Kmer 100 . 863741 863779 0,0,0
chr20 37336453 37336480 Error_Kmer 100 . 37336453 37336480 0,0,0
chr20 66210121 66210152 Error_Kmer 100 . 66210121 66210152 0,0,0
chr20 66210156 66210212 Error_Kmer 100 . 66210156 66210212 0,0,0
chr21 0 53 Error_Kmer 100 . 0 53 0,0,0
chr21 43083624 43083645 Error_Kmer 100 . 43083624 43083645 0,0,0
chr22 102 157 Error_Kmer 100 . 102 157 0,0,0
chr22 491 514 Error_Kmer 100 . 491 514 0,0,0
chr22 969 1003 Error_Kmer 100 . 969 1003 0,0,0
chr22 1486 1508 Error_Kmer 100 . 1486 1508 0,0,0
chr22 4809620 4809649 Error_Kmer 100 . 4809620 4809649 0,0,0
chr22 4809715 4809754 Error_Kmer 100 . 4809715 4809754 0,0,0
chr22 39136546 39145169 Collapse 100 . 39136546 39145169 204,0,0
chr22 48810585 48810610 Error_Kmer 100 . 48810585 48810610 0,0,0
chr22 51353383 51353420 Error_Kmer 100 . 51353383 51353420 0,0,0
chr22 51353422 51353456 Error_Kmer 100 . 51353422 51353456 0,0,0
chr22 51353534 51353629 Error_Kmer 100 . 51353534 51353629 0,0,0
chr22 51353694 51353735 Error_Kmer 100 . 51353694 51353735 0,0,0
chr22 51353742 51353776 Error_Kmer 100 . 51353742 51353776 0,0,0
chr22 51353795 51353816 Error_Kmer 100 . 51353795 51353816 0,0,0
chr3 0 33 Error_Kmer 100 . 0 33 0,0,0
chr3 58 87 Error_Kmer 100 . 58 87 0,0,0
chr3 1021188 1021212 Error_Kmer 100 . 1021188 1021212 0,0,0
chr3 9173890 9173913 Error_Kmer 100 . 9173890 9173913 0,0,0
chr3 18651200 18651226 Error_Kmer 100 . 18651200 18651226 0,0,0
chr3 19407956 19407986 Error_Kmer 100 . 19407956 19407986 0,0,0
chr3 32905434 32905461 Error_Kmer 100 . 32905434 32905461 0,0,0
chr3 42128650 42128675 Error_Kmer 100 . 42128650 42128675 0,0,0
chr3 124646232 124646260 Error_Kmer 100 . 124646232 124646260 0,0,0
chr3 125751238 125751264 Error_Kmer 100 . 125751238 125751264 0,0,0
chr3 129922887 129922915 Error_Kmer 100 . 129922887 129922915 0,0,0
chr3 140520064 140520089 Error_Kmer 100 . 140520064 140520089 0,0,0
chr3 156625743 156625770 Error_Kmer 100 . 156625743 156625770 0,0,0
chr3 161890940 161890973 Error_Kmer 100 . 161890940 161890973 0,0,0
chr3 167406573 167406600 Error_Kmer 100 . 167406573 167406600 0,0,0
chr3 169183298 169183321 Error_Kmer 100 . 169183298 169183321 0,0,0
chr3 201105127 201105151 Error_Kmer 100 . 201105127 201105151 0,0,0
chr3 201105286 201105312 Error_Kmer 100 . 201105286 201105312 0,0,0
chr4 3 55 Error_Kmer 100 . 3 55 0,0,0
chr4 151 186 Error_Kmer 100 . 151 186 0,0,0
chr4 241 288 Error_Kmer 100 . 241 288 0,0,0
chr4 7836212 7836265 Error_Kmer 100 . 7836212 7836265 0,0,0
chr4 7838009 7838047 Error_Kmer 100 . 7838009 7838047 0,0,0
chr4 7838489 7838524 Error_Kmer 100 . 7838489 7838524 0,0,0
chr4 7838917 7838940 Error_Kmer 100 . 7838917 7838940 0,0,0
chr4 7839897 7839968 Error_Kmer 100 . 7839897 7839968 0,0,0
chr4 7840249 7840287 Error_Kmer 100 . 7840249 7840287 0,0,0
chr4 21780457 21780482 Error_Kmer 100 . 21780457 21780482 0,0,0
chr4 39784025 39784053 Error_Kmer 100 . 39784025 39784053 0,0,0
chr4 52004796 52039790 Low 100 . 52004796 52039790 204,0,0
chr4 52524846 52534635 Low 100 . 52524846 52534635 204,0,0
chr4 59926501 59926522 Error_Kmer 100 . 59926501 59926522 0,0,0
chr4 96449836 96449861 Error_Kmer 100 . 96449836 96449861 0,0,0
chr4 130121044 130121076 Error_Kmer 100 . 130121044 130121076 0,0,0
chr4 131857337 131857358 Error_Kmer 100 . 131857337 131857358 0,0,0
chr4 144007189 144007215 Error_Kmer 100 . 144007189 144007215 0,0,0
chr4 157555968 157555998 Error_Kmer 100 . 157555968 157555998 0,0,0
chr4 161913380 161913404 Error_Kmer 100 . 161913380 161913404 0,0,0
chr4 169927058 169939800 Low_Qual 100 . 169927058 169939800 204,0,0
chr4 169928111 169928149 Error_Kmer 100 . 169928111 169928149 0,0,0
chr4 186171261 186181618 Low_Qual 100 . 186171261 186181618 204,0,0
chr4 186175569 186175592 Error_Kmer 100 . 186175569 186175592 0,0,0
chr4 186177993 186178014 Error_Kmer 100 . 186177993 186178014 0,0,0
chr4 193575250 193575290 Error_Kmer 100 . 193575250 193575290 0,0,0
chr4 193575324 193575370 Error_Kmer 100 . 193575324 193575370 0,0,0
chr4 193575381 193575410 Error_Kmer 100 . 193575381 193575410 0,0,0
chr5 20 50 Error_Kmer 100 . 20 50 0,0,0
chr5 174 236 Error_Kmer 100 . 174 236 0,0,0
chr5 261 294 Error_Kmer 100 . 261 294 0,0,0
chr5 39409190 39409226 Error_Kmer 100 . 39409190 39409226 0,0,0
chr5 100565812 100565841 Error_Kmer 100 . 100565812 100565841 0,0,0
chr5 102558806 102558831 Error_Kmer 100 . 102558806 102558831 0,0,0
chr5 115533329 115533354 Error_Kmer 100 . 115533329 115533354 0,0,0
chr5 127491570 127491591 Error_Kmer 100 . 127491570 127491591 0,0,0
chr5 156624820 156624843 Error_Kmer 100 . 156624820 156624843 0,0,0
chr5 181651681 181664611 Low_Qual 100 . 181651681 181664611 204,0,0
chr5 181656039 181656073 Error_Kmer 100 . 181656039 181656073 0,0,0
chr5 181658127 181658152 Error_Kmer 100 . 181658127 181658152 0,0,0
chr5 181658352 181658411 Error_Kmer 100 . 181658352 181658411 0,0,0
chr5 181660557 181660578 Error_Kmer 100 . 181660557 181660578 0,0,0
chr5 181660651 181660677 Error_Kmer 100 . 181660651 181660677 0,0,0
chr5 181662235 181662273 Error_Kmer 100 . 181662235 181662273 0,0,0
chr5 181662496 181662534 Error_Kmer 100 . 181662496 181662534 0,0,0
chr5 181662657 181662695 Error_Kmer 100 . 181662657 181662695 0,0,0
chr5 182045374 182045398 Error_Kmer 100 . 182045374 182045398 0,0,0
chr6 0 30 Error_Kmer 100 . 0 30 0,0,0
chr6 50 77 Error_Kmer 100 . 50 77 0,0,0
chr6 24897156 24897183 Error_Kmer 100 . 24897156 24897183 0,0,0
chr6 40984197 40984227 Error_Kmer 100 . 40984197 40984227 0,0,0
chr6 75720528 75720556 Error_Kmer 100 . 75720528 75720556 0,0,0
chr6 93329559 93329589 Error_Kmer 100 . 93329559 93329589 0,0,0
chr6 118120554 118120576 Error_Kmer 100 . 118120554 118120576 0,0,0
chr6 159017162 159020622 Low_Qual 100 . 159017162 159020622 204,0,0
chr6 159017965 159017986 Error_Kmer 100 . 159017965 159017986 0,0,0
chr6 159019954 159019987 Error_Kmer 100 . 159019954 159019987 0,0,0
chr6 172126608 172126637 Error_Kmer 100 . 172126608 172126637 0,0,0
chr6 172126703 172126727 Error_Kmer 100 . 172126703 172126727 0,0,0
chr7 16 65 Error_Kmer 100 . 16 65 0,0,0
chr7 73 113 Error_Kmer 100 . 73 113 0,0,0
chr7 28913043 28913071 Error_Kmer 100 . 28913043 28913071 0,0,0
chr7 35732940 35732970 Error_Kmer 100 . 35732940 35732970 0,0,0
chr7 66195666 66195691 Error_Kmer 100 . 66195666 66195691 0,0,0
chr7 76595900 76614196 Low_Qual 100 . 76595900 76614196 204,0,0
chr7 76597346 76597383 Error_Kmer 100 . 76597346 76597383 0,0,0
chr7 76598436 76598474 Error_Kmer 100 . 76598436 76598474 0,0,0
chr7 76600078 76600099 Error_Kmer 100 . 76600078 76600099 0,0,0
chr7 76600633 76600671 Error_Kmer 100 . 76600633 76600671 0,0,0
chr7 76601632 76601662 Error_Kmer 100 . 76601632 76601662 0,0,0
chr7 76603095 76603134 Error_Kmer 100 . 76603095 76603134 0,0,0
chr7 76606064 76606101 Error_Kmer 100 . 76606064 76606101 0,0,0
chr7 76606194 76606215 Error_Kmer 100 . 76606194 76606215 0,0,0
chr7 76606642 76606681 Error_Kmer 100 . 76606642 76606681 0,0,0
chr7 109039062 109039091 Error_Kmer 100 . 109039062 109039091 0,0,0
chr7 110865325 110865353 Error_Kmer 100 . 110865325 110865353 0,0,0
chr7 119133096 119133125 Error_Kmer 100 . 119133096 119133125 0,0,0
chr7 137214837 137214865 Error_Kmer 100 . 137214837 137214865 0,0,0
chr7 141042662 141042692 Error_Kmer 100 . 141042662 141042692 0,0,0
chr7 146712094 146712124 Error_Kmer 100 . 146712094 146712124 0,0,0
chr7 154391042 154391073 Error_Kmer 100 . 154391042 154391073 0,0,0
chr7 158963002 158967402 Low_Qual 100 . 158963002 158967402 204,0,0
chr7 158965861 158965887 Error_Kmer 100 . 158965861 158965887 0,0,0
chr7 160567360 160567381 Error_Kmer 100 . 160567360 160567381 0,0,0
chr8 213 237 Error_Kmer 100 . 213 237 0,0,0
chr8 2936788 2936815 Error_Kmer 100 . 2936788 2936815 0,0,0
chr8 17905911 17905932 Error_Kmer 100 . 17905911 17905932 0,0,0
chr8 22670368 22670400 Error_Kmer 100 . 22670368 22670400 0,0,0
chr8 29208093 29208115 Error_Kmer 100 . 29208093 29208115 0,0,0
chr8 33053427 33053457 Error_Kmer 100 . 33053427 33053457 0,0,0
chr8 35495046 35495069 Error_Kmer 100 . 35495046 35495069 0,0,0
chr8 63518387 63518420 Error_Kmer 100 . 63518387 63518420 0,0,0
chr8 89290123 89290146 Error_Kmer 100 . 89290123 89290146 0,0,0
chr8 107000396 107000425 Error_Kmer 100 . 107000396 107000425 0,0,0
chr8 128936548 128936569 Error_Kmer 100 . 128936548 128936569 0,0,0
chr8 142319226 142331419 Low_Qual 100 . 142319226 142331419 204,0,0
chr8 142324437 142324481 Error_Kmer 100 . 142324437 142324481 0,0,0
chr8 143875584 143875612 Error_Kmer 100 . 143875584 143875612 0,0,0
chr9 28418228 28418258 Error_Kmer 100 . 28418228 28418258 0,0,0
chr9 67950861 67953956 Low 100 . 67950861 67953956 204,0,0
chr9 68471999 68472034 Error_Kmer 100 . 68471999 68472034 0,0,0
chr9 68613940 68617427 Low 100 . 68613940 68617427 204,0,0
chr9 78635185 78635214 Error_Kmer 100 . 78635185 78635214 0,0,0
chr9 149602675 149609918 Low_Qual 100 . 149602675 149609918 204,0,0
chr9 149604666 149604687 Error_Kmer 100 . 149604666 149604687 0,0,0
chr9 150616862 150616885 Error_Kmer 100 . 150616862 150616885 0,0,0
chr9 150617222 150617274 Error_Kmer 100 . 150617222 150617274 0,0,0
chrX 1921077 1933412 Low_Qual 100 . 1921077 1933412 204,0,0
chrX 1929198 1929219 Error_Kmer 100 . 1929198 1929219 0,0,0
chrX 4221751 4221775 Error_Kmer 100 . 4221751 4221775 0,0,0
chrX 7723014 7734575 Low_Qual 100 . 7723014 7734575 204,0,0
chrX 7724147 7724181 Error_Kmer 100 . 7724147 7724181 0,0,0
chrX 7724213 7724240 Error_Kmer 100 . 7724213 7724240 0,0,0
chrX 7724731 7724759 Error_Kmer 100 . 7724731 7724759 0,0,0
chrX 7724832 7724856 Error_Kmer 100 . 7724832 7724856 0,0,0
chrX 7730350 7730375 Error_Kmer 100 . 7730350 7730375 0,0,0
chrX 7730654 7730684 Error_Kmer 100 . 7730654 7730684 0,0,0
chrX 7731982 7732004 Error_Kmer 100 . 7731982 7732004 0,0,0
chrX 7732146 7732167 Error_Kmer 100 . 7732146 7732167 0,0,0
chrX 7732486 7732512 Error_Kmer 100 . 7732486 7732512 0,0,0
chrX 7733175 7733197 Error_Kmer 100 . 7733175 7733197 0,0,0
chrX 7733466 7733488 Error_Kmer 100 . 7733466 7733488 0,0,0
chrX 7734206 7734233 Error_Kmer 100 . 7734206 7734233 0,0,0
chrX 8053743 8053774 Error_Kmer 100 . 8053743 8053774 0,0,0
chrX 8444004 8444032 Error_Kmer 100 . 8444004 8444032 0,0,0
chrX 8656697 8656729 Error_Kmer 100 . 8656697 8656729 0,0,0
chrX 9248147 9248177 Error_Kmer 100 . 9248147 9248177 0,0,0
chrX 16675827 16675849 Error_Kmer 100 . 16675827 16675849 0,0,0
chrX 23408358 23408385 Error_Kmer 100 . 23408358 23408385 0,0,0
chrX 46767603 46767627 Error_Kmer 100 . 46767603 46767627 0,0,0
chrX 56016343 56016376 Error_Kmer 100 . 56016343 56016376 0,0,0
chrX 59218363 59237144 Low 100 . 59218363 59237144 204,0,0
chrX 90397173 90397200 Error_Kmer 100 . 90397173 90397200 0,0,0
chrX 92957973 92958004 Error_Kmer 100 . 92957973 92958004 0,0,0
chrX 123541156 123541183 Error_Kmer 100 . 123541156 123541183 0,0,0
chrX 144228792 144228820 Error_Kmer 100 . 144228792 144228820 0,0,0