Структура проекта

common - модуль с общими классами, используемыми и на стороне сервера, и на стороне бота
server - модуль с кодом сервера. Дорабатывается исключительно администраторами.
starter-bot - модуль-заготовка для бота. Он же - простейший пример. Можно брать за основу для работы над ботом.

Сборка и запуск проекта

Сборка проекта осуществляется с помощью Maven. Шаги сборки:

Клонирование репозитория
Установка IDE и Maven
Выполнение команды Maven (Execute maven goal): mvn clean package
Результатом сборки будут следующие артефакты:
- server - ./server/target/server.jar
- starter-bot - ./starter-bot/target/starter-bot.jar

Для запуска:

Сервера:
- Скопировать артефакт сборки server.jar и файл конфигурации hypernull.properties (файл конфигурации опционален - при его отсутствии будут использоваться значения по умолчанию) в одну папку
- Открыть командную строку (cmd) в папке из предыдущего пункта
- Выполнить в командной строке: java -jar server.jar
- Сервер запустится и станет доступным для ботов по указанным в конфигурации параметрам (порту, в частности)
Бота:
- Скопировать артефакт сборки starter-bot.jar и файл конфигурации bot.properties в одну папку
- Открыть командную строку (cmd) в папке из предыдущего пункта
- Выполнить в командной строке: java -jar starter-bot.jar
- Бот автоматически попробует подключиться к серверу по адресу и порту, указанным в конфигурационном файле

NOTE: И сервер, и бота можно запустить из IDE, задав нужные параметры в .properties-файлах и запустив соответствующие main-классы.