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<?php
session_start();
include("procs/MotifsTree.php");
include("procs/DatosMotif.php");
//$mm = unserialize($_SESSION['encoded_motifTree']);
//var_dump($mm->getMotifs());
if( isset($_POST['motif']) && !empty($_POST['motif']) ){
?>
<!DOCTYPE HTML>
<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8">
<!-- Bootstrap -->
<link href="css/bootstrap.min.css" rel="stylesheet">
<link rel="icon" href="icono.png">
<meta name="viewport" content="width=device-width, initial-scale=1">
<!-- jQuery (necessary for Bootstrap's JavaScript plugins) -->
<script src="https://ajax.googleapis.com/ajax/libs/jquery/1.11.2/jquery.min.js"></script>
<!-- Include all compiled plugins (below), or include individual files as needed -->
<script src="js/bootstrap.min.js"></script>
<!--Library form's-->
<script src="js/funciones.js"></script>
<title>Sequence's Graphic for <?php echo $_POST['motif']?> Motif</title>
<?php
$ortologos = array(
"inicio 0",
"Drosophila melanogaster",
"Drosophila simulans",
"Drosophila sechellia",
"Drosophila erecta",
"Drosophila yakuba",
"Drosophila ananassae",
"Drosophila pseudoobscura pseudoobscura",
"Drosophila persimilis",
"Drosophila willistoni",
"Drosophila virilis",
"Drosophila mojavensis",
"Drosophila grimshawi");
$motif = $_POST['motif'];
$distancia = $_POST['distancia'];
$radioPB = $_POST['radioPB'];
$secuencia = array();
$nombresSeq = array();
for($i=1; $i<=12; $i++){
if( isset($_POST['lblSeq'.$i]) ){
$secuencia[] = $_POST['lblSeq'.$i];
}
if(isset($_POST['selecSeq'.$i])){
$nombresSeq[] = $_POST['selecSeq'.$i];
//echo $i.' Nombre '.$_POST['selecSeq'.$i].'<br>';
}
}
$motifs = unserialize($_SESSION['encoded_motifTree'][$_POST['numFila']]);
//$motifs->generateMotifsPaths();
//Para ver que imprime.. el objeto.. si se observa no se pasa la cola de prioridades.
$arrayCola = $motifs->getArrayCola();
$_SESSION['mejores_motifTree'] = $_SESSION['encoded_motifTree'][$_POST['numFila']];
?>
<script type="text/javascript" src="http://ajax.googleapis.com/ajax/libs/jquery/1.8.2/jquery.min.js"></script>
<style type="text/css">
body{
padding-top: 70px;
}
${demo.css}
</style>
</head>
<body>
<!-- Navbar -->
<nav class="navbar navbar-inverse navbar-fixed-top" id="barraNav">
<div class="container">
<div class="navbar-header">
<button type="button" class="navbar-toggle" data-toggle="collapse" data-target="#navbar-collapse">
<span class="icon-bar"></span>
= <span class="icon-bar"></span>
<span class="icon-bar"></span>
<span class="icon-bar"></span>
</button>
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</div>
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<li><a href="http://didt.inictel-uni.edu.pe/didt/microgravedad/">Microgravity Lab</a></li>
<li><a href="about.html">About</a></li>
</ul>
</div>
</div>
</nav>
<div class="container" style="overflow:scroll;">
<div class="panel panel-default">
<div class="panel-heading"><h4><b>Results</b></h4></div>
<div class="panel-body">
<?php
$v = $motifs->getSlopeData();
echo '<b>Mejor Recta: </b> y = '.$v[0].'x + c<br><br>';
echo '<b>Error: </b> '.$v[1].'<br><br>';
$posX = $motifs->getColaPosiciones();
$bd = new DatosMotif($motif);
$res = $bd->obtenerResultados();
$maxlen = 0;
$nombreMotif = $res[0][0]." - ".$res[0][1];
for($i=0;$i<count($secuencia);$i++) {
if(strlen($secuencia[$i])>$maxlen) $maxlen = strlen($secuencia[$i]);
}
?>
<?php echo '<b>Motif</b> = '.$nombreMotif.'<br><br>'?>
<?php echo '<b>Consensus Sequence ('.strlen($motif).')</b> = '.$motif.'<br><br>'?>
<?php echo '<b>Sequences</b>:<br>';
echo '<table border=0>';
for($i=0;$i<count($secuencia);$i++) {
if(strcmp($_POST['optionType'], "zonapromotora") == 0) $start = strlen($secuencia[$i]) - $posX[$i];
else $start=$posX[$i];
echo '<tr><td colspan="100"><b>'.$nombresSeq[$i].' ('.strlen($secuencia[$i]).')</b> =</td></tr>';
echo '<tr>';
if(strcmp($_POST['optionType'], "zonapromotora") == 0) for($j=0;$j< ($maxlen-strlen($secuencia[$i]));$j++) echo '<td>-</td>';
for($j=0;$j<$start;$j++) echo '<td>'.$secuencia[$i][$j].'</td>';
for($j=$start;$j<($start+strlen($motif));$j++) echo '<td style="background-color: yellow"><b>'.$secuencia[$i][$j].'</b></td>';
for($j=$start+strlen($motif);$j<strlen($secuencia[$i]);$j++) echo '<td>'.$secuencia[$i][$j].'</td>';
if(strcmp($_POST['optionType'], "zonapromotora") != 0) for($j=0;$j< ($maxlen-strlen($secuencia[$i]));$j++) echo '<td>-</td>';
echo '</tr>';
}
echo '</table>';
?>
</div>
</div>
</div>
<div class="container" style="overflow:scroll;">
<div class="panel panel-default">
<div class="panel-heading"><h4><b>Displacement of the Motif</b></h4></div>
<div class="panel-body">
<canvas id='myCanvas' width='20000' height="<?php echo count($secuencia)*105; ?>"></canvas>
<?php
echo"
<script>
var canvas = document.getElementById('myCanvas');
var context = canvas.getContext('2d');
";
?>
<?php
$colorsCanvas = array("#ff0000","#00ff00","#0000ff","#ff00ff","#ffff00","#00ffff","#55bb55","#5555bb","#bb5555","#bbccdd","#ddccbb","#ccddbb");
$posY = array();
for($k=0;$k<count($secuencia);$k++) $posY[] = 50+100*$k;
$posX = $motifs->getColaPosiciones();
if( strcmp($_POST['optionType'], "zonapromotora") == 0){
for($tt=0;$tt<sizeof($posX);$tt++){
$posX[$tt] = strlen($secuencia[$tt])-$posX[$tt];
}
}
//echo var_dump($posX);
for($i=0;$i<count($secuencia);$i++){
//echo '<b>'.$nombresSeq[$i].'</b><br><br>';
$desplazamiento = ( $maxlen - strlen($secuencia[$i]));
if( strcmp($_POST['optionType'], "zonapromotora") != 0) $desplazamiento=0;
$iniX = $desplazamiento;
$finX = $iniX+strlen($secuencia[$i]);
$inifinY = $posY[$i];
$postextoY = $posY[$i]-10;
echo
"
context.beginPath();
context.strokeStyle = '#444040';
context.fillText('".$nombresSeq[$i]."',10,".$postextoY.");
context.moveTo(".$iniX.", ".$inifinY.");
context.lineTo(".$finX.", ".$inifinY.");
context.lineWidth = 4;
context.stroke();
";
if($i>0){
$predesplazamiento = ( $maxlen - strlen($secuencia[$i-1]));
if( strcmp($_POST['optionType'], "zonapromotora") != 0) $predesplazamiento=0;
echo "
context.beginPath();
context.strokeStyle='".$colorsCanvas[$i-1]."';
context.moveTo(".($posX[$i-1]+$predesplazamiento).", ".$posY[$i-1].");
context.lineTo(".($posX[$i]+$desplazamiento).", ".$posY[$i].");
context.stroke();
";
}
}
// Grafica la recta que mas se ajusta a los puntos y el margen error que distan los puntos de la recta aproximada.
/*$n = count($secuencia); // Longitud de la cadena. Cantidad de valores que hay en la cadena, el cual es el numero de familias evaluadas.
$sx = 0; // Valor de la sumatoria de los valores de x.
$sxx = 0; // Valor de la sumatoria de los cuadrados de x.
$sy = 0; // Valor de la sumtaroria de los valores de y.
$sxy = 0; // Valor de la sumatoria de los valores de x por y.
for ( $i = 0; $i < $n; $i++ ) {
$sx = $sx + $posX[$i];
$sy = $sy + $posY[$i];
$sxx = $sx + $posX[$i]*$posX[$i];
$sxy = $sxy + $posX[$i]*$posY[$i];
}
$ds = $sx * $sx - $n * $sxx; // Determinante del sistema.
$dm = $sy * $sx - $n * $sxy; // Determinante de la pendiente.
$dd = $sx * $sxy - $sy * $sxx; // Determinante del desfase.
$m = $dm / $ds; // Pendiente de la recta que mas se asemeja.
$df = $dd / $ds; // Desfase de la recta, es decir, y=m*x+df.
$er = 0.0; // Margen de error de la aproximacion
for ( $i = 0; $i < $n; $i++ ) {
$er = $er + abs( $posY[$i] - ( $m * $posX[$i] + $df ) );
}
// Se grafica la recta con canvas.
$primerX = ( $posY[0] - $df ) / $m;
$ultimoX = ( $posY[($n-1)] - $df ) / $m;
echo "
context.lineWidth = 6;
context.beginPath();
context.strokeStyle= '#2b886a';
context.moveTo(".$primerX.", ".$posY[0].");
context.lineTo(".$ultimoX.", ".$posY[($n-1)].");
context.stroke();
";
// Termina el dibujo.
*/
echo "context.stroke(); </script>";
?>
</div>
</div>
</div>
<br><br>
</body>
</html>
<?php
}
else{
echo "Ooops! Parece que te metiste a otro lado<br>";
echo "Te llevaremos ahi, no te preocupes :)<br>";
header("refresh:5;url=index.php");
}
?>