lefse分析模块出现问题

[zjx12-bot]

老师，您好
感谢您们提供了菌群下游分析的代码。
我在学习的过程中发现了个问题，在版本是4.3.1运行4.The.best.practice.Rmd的lefse分析模块中，在4067-4099行的代码中出现以下报错：
Error in h(simpleError(msg, call)) :
在为'as.data.frame'函数选择方法时评估'x'参数出了错: 在为'tax_table'函数选择方法时评估'object'参数出了错: 在为'taxa_are_rows'函数选择方法时评估'physeq'参数出了错: 函数‘tax_table’标签‘"phyloseq"’找不到继承方法。

我怀疑是phyloseq文件读取过程出现问题，但是没有找到解决的办法，希望能收到老师您的回复，十分感谢！！