-
Notifications
You must be signed in to change notification settings - Fork 0
/
Copy pathhg18.bejscHumanCNE.toDanRer5Region.txt
138 lines (138 loc) · 11.7 KB
/
hg18.bejscHumanCNE.toDanRer5Region.txt
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
chr1 3130402 3130801 cne.211.X chr1 3129819 3172605 chr8:43980728-44029724,+
chr1 3304819 3305157 cne.270.S chr1 3303023 3309204 chr8:44736099-44741830,-
chr1 8561040 8561373 cne.874.X chr1 8543899 8582219 chr23:21251662-21273012,-
chr1 18835859 18835995 cne.1802.F chr1 18835457 18838128 chr23:18781197-18782773,+
chr1 38530405 38530615 cne.3928.X chr1 38509466 38565171 chr16:39835206-39865209,-
chr1 44485632 44485899 cne.4574.X chr1 44468345 44487008 chr2:27351139-27413212,+
chr1 61689561 61689803 cne.7643.X chr1 61672779 61690910 chr22:14449415-14456858,-
chr1 63346804 63347169 cne.7923.X chr1 63338209 63362839 chr6:17402585-17430595,-
chr1 88591932 88592361 cne.12704.GAN chr1 88478014 88648661 chr23:19092579-19147566,+
chr1 88609365 88609515 cne.12708.X chr1 88478014 88648661 chr23:19092579-19147566,+
chr1 90739291 90739729 cne.13052.X chr1 90719023 90772852 chr6:49004408-49030264,-
chr1 145836070 145836297 cne.17124.GAN chr1 145698023 145841283 chr1:44362265-44391282,+
chr1 197944350 197944641 cne.21631.GN chr1 196992719 198095301 chr22:16543244-16763163,+
chr1 198191064 198191451 cne.21693.GAN chr1 198095683 198275370 chr22:16763600-16814009,+
chr1 245045168 245045237 cne.26926.FSTK chr1 245040113 245050596 chr17:9765332-9768114,+
chr10 1156643 1157202 cne.26978.X chr10 1141299 1160085 chr24:2607748-2621608,+
chr10 23548084 23548427 cne.29698.X chr10 23535706 23612912 chr2:24156528-24178685,+
chr10 23618993 23619276 cne.29705.X chr10 23613064 23619309 chr2:24178829-24184636,+
chr10 28570297 28570944 cne.30166.X chr10 28548475 28860732 chr12:21009002-21057335,+
chr10 52312444 52312587 cne.31610.X chr10 52289773 52315095 chr12:3867969-3873327,-
chr10 64314344 64314610 cne.32771.X chr10 64245803 64426539 chr12:6371376-6426554,+
chr10 76792271 76792581 cne.34064.X chr10 76725933 76808901 chr13:14992568-15039089,+
chr10 77492684 77492940 cne.34456.F chr10 77484602 77543659 chr13:15395702-15422814,+
chr10 77510278 77510674 cne.34464.GAN chr10 77484602 77543659 chr13:15395702-15422814,+
chr10 102367859 102368167 cne.37126.FSTK chr10 102365360 102371280 chr13:29076602-29095345,+
chr10 114273378 114273705 cne.38993.STK chr10 114214412 114276315 Zv7_NA53:412201-441455,+
chr10 114808956 114809513 cne.39338.GAN chr10 114790043 114867305 chr12:28728869-28776345,+
chr10 119296091 119296433 cne.40321.FSTK chr10 119295321 119297545 chr13:11813021-11814564,+
chr10 119762587 119763095 cne.40494.SK chr10 119759218 119786284 chr13:12099496-12115000,+
chr10 119995563 119995635 cne.40588.GAN chr10 119898014 120020106 chr13:12178353-12233252,+
chr10 129928064 129928480 cne.41872.X chr10 129903298 129947217 chr3:51350698-51358189,+
chr10 131457733 131457862 cne.42587.X chr10 131418242 131479301 chr12:38930688-38964479,+
chr10 131564559 131564781 cne.42662.X chr10 131562498 131565994 chr12:39042180-39046731,+
chr11 8344861 8345000 cne.43280.FST chr11 8340743 8430936 chr7:23418471-23459214,-
chr11 15861189 15861836 cne.44259.GAN chr11 15822156 15874373 chr7:18542986-18548129,-
chr11 16456605 16456757 cne.44634.GAN chr11 16432086 16577442 chr7:18321652-18345268,-
chr11 31618600 31619466 cne.46430.X chr11 31581209 31627829 chr25:15312146-15346623,-
chr11 32456558 32457218 cne.46723.GAN chr11 32418158 32576177 chr25:15021226-15040263,-
chr11 82176791 82176975 cne.50763.GAN chr11 82146484 82226973 chr15:13805066-13849688,-
chr11 122388716 122388873 cne.55485.GA chr11 122375739 122415806 chr10:25124781-25141484,+
chr12 1612955 1613123 cne.57981.GN chr12 1612369 1619102 chr4:5340064-5345050,+
chr12 52813429 52813790 cne.63089.A chr12 52777753 52921802 chr23:33812604-33946775,+
chr12 79338644 79338800 cne.66495.GAN chr12 79297216 79412531 chr18:3541322-3624908,+
chr12 84032648 84033149 cne.67007.X chr12 84024568 84045410 chr18:18074534-18086581,-
chr12 88267582 88268052 cne.67542.FSTK chr12 88267490 88268462 chr25:8914021-8914532,+
chr12 107609475 107609640 cne.69956.FSK chr12 107596328 107618532 chr5:15906917-15936688,-
chr12 108213769 108214110 cne.69971.FSTK chr12 108212479 108281408 chr5:14935438-14952019,+
chr12 108680776 108680968 cne.70030.TK chr12 108641045 108686916 chr5:15208153-15289527,+
chr12 109151126 109151405 cne.70060.X chr12 109141064 109203973 chr8:6513251-6519869,+
chr13 34765153 34765631 cne.72864.X chr13 34704866 34821231 chr15:24722613-24756536,+
chr13 71089910 71090212 cne.77936.ZTK chr13 71052614 71091342 chr9:24942214-24949026,-
chr13 71230270 71230407 cne.78015.SK chr13 71226381 71231012 chr9:24884149-24888716,-
chr13 99626283 99626373 cne.81824.GAN chr13 99605626 99659496 chr9:25242268-25268300,+
chr13 99798327 99798650 cne.81877.X chr13 99766696 99812929 chr9:25324344-25351948,+
chr13 99994607 99994794 cne.81957.X chr13 99974129 100055240 chr9:25434073-25437325,+
chr14 32302104 32302801 cne.85551.GAN chr14 32274843 32357798 chr17:6164759-6192242,-
chr14 36882398 36882572 cne.87029.GAN chr14 36847446 36907752 chr17:8365899-8380438,-
chr14 56489131 56489952 cne.88848.FSTK chr14 56350266 56518746 chr17:42382446-42485093,-
chr14 56496437 56496754 cne.88855.FSTK chr14 56350266 56518746 chr17:42382446-42485093,-
chr14 56498884 56499556 cne.88860.FSTK chr14 56350266 56518746 chr17:42382446-42485093,-
chr14 56501038 56501867 cne.88868.T chr14 56350266 56518746 chr17:42382446-42485093,-
chr14 73725020 73725418 cne.90909.FSTK chr14 73692109 73735357 chr17:30065333-30074443,+
chr14 75367668 75367905 cne.91132.GN chr14 75315851 75399817 chr17:52199944-52224124,+
chr14 96453622 96453887 cne.94052.GAN chr14 96424996 96500747 chr17:17291966-17319486,-
chr14 97510842 97511680 cne.94475.X chr14 97485127 97610222 chr17:17037743-17074360,-
chr14 98768406 98768577 cne.94871.X chr14 98761802 98771510 chr17:16699615-16705937,-
chr15 34805959 34806054 cne.96504.ST chr15 34789459 34828314 chr17:50437390-50447964,-
chr15 34806560 34807321 cne.96507.FSTK chr15 34789459 34828314 chr17:50437390-50447964,-
chr15 53755911 53756299 cne.98989.F chr15 53755175 53756336 chr18:577025-580221,+
chr15 55299785 55300089 cne.99185.STK chr15 55299091 55300347 chr7:49289522-49294120,+
chr15 65686875 65687451 cne.100899.FST chr15 65665415 65811962 chr18:14240546-14268058,-
chr15 93583958 93584401 cne.103699.GAN chr15 93479099 93631520 chr18:23229388-23272104,+
chr15 94246726 94247575 cne.104078.X chr15 94228650 94275328 chr18:23490997-23506457,+
chr15 94255838 94256063 cne.104088.X chr15 94228650 94275328 chr18:23490997-23506457,+
chr15 94544179 94544645 cne.104267.GAN chr15 94532353 94609193 chr18:23593786-23615603,+
chr16 49530522 49530853 cne.108623.F chr16 49502835 49535036 chr7:25985481-25999916,+
chr16 49614338 49614823 cne.108664.FSTK chr16 49568843 49663946 chr7:26014218-26045639,+
chr16 52993653 52993926 cne.109865.GAN chr16 52908986 53051088 chr7:27519579-27595744,+
chr16 53854583 53854755 cne.110231.X chr16 53806589 53912316 chr7:27949803-27974690,+
chr16 53958422 53958677 cne.110263.GN chr16 53924423 53975750 chr7:27983159-28001240,+
chr16 71409251 71409481 cne.112780.FST chr16 71406480 71426611 chr7:62130360-62163775,-
chr17 55218683 55218954 cne.121818.ZFSK chr17 55206030 55240650 chr15:7979694-7980806,+
chr19 19461087 19461365 cne.135424.FSTK chr19 19437429 19464091 chr22:21249694-21266925,+
chr19 36347593 36347667 cne.136252.X chr19 36340415 36347913 chr7:42515192-42519121,-
chr19 36500302 36500384 cne.136330.X chr19 36499325 36519705 chr7:42435024-42452885,-
chr19 36574590 36575443 cne.136402.X chr19 36553509 36585902 chr7:42377616-42412982,-
chr19 37130572 37130876 cne.136604.X chr19 37126950 37142223 chr7:42177780-42187834,-
chr2 44515662 44516171 cne.142769.GAN chr2 44473362 44652341 chr13:6244714-6332457,-
chr2 58757537 58758147 cne.144777.GN chr2 58745676 58801676 chr13:22471007-22492561,+
chr2 59035562 59036108 cne.144974.X chr2 59017382 59052544 chr13:22596715-22624344,+
chr2 60041845 60042285 cne.145490.GAN chr2 60028111 60104066 chr13:22935581-22986222,+
chr2 67245799 67246340 cne.147247.GAN chr2 67176170 67289710 chr13:4327429-4345703,-
chr2 172625268 172625636 cne.159136.SK chr2 172561174 172639420 chr9:3044044-3091173,-
chr2 174366665 174367335 cne.159505.FSTK chr2 174226872 174481379 chr9:3567809-3618600,+
chr2 236354495 236354912 cne.168777.X chr2 236323877 236371113 chr6:15433984-15458991,-
chr20 20377564 20377916 cne.171711.X chr20 20342845 20394159 chr17:43477628-43520258,-
chr20 20813570 20813717 cne.171774.FSK chr20 20641138 20816085 chr17:43141520-43226812,-
chr20 62263023 62263371 cne.175936.GAN chr20 62208551 62300635 chr23:29550115-29596345,-
chr22 16692820 16692999 cne.178533.L chr22 16690551 16694569 chr18:9267496-9272773,-
chr3 23962298 23962532 cne.183329.X chr3 23936050 23970883 chr19:9115392-9124056,-
chr3 62518827 62519286 cne.188191.X chr3 62518240 62545892 chr11:15882153-15896782,-
chr3 77722249 77722397 cne.191641.FTK chr3 77720777 77723022 chr15:36450985-36461130,+
chr3 148559755 148560048 cne.199835.X chr3 148533818 148561256 chr24:4326813-4334405,-
chr3 159386165 159387265 cne.200927.STK chr3 159365956 159410689 chr15:1613026-1636065,+
chr3 170396015 170396584 cne.201997.FSTK chr3 170353076 170442886 chr15:32152094-32198964,+
chr3 195287162 195287225 cne.205563.X chr3 195144727 195331690 chr6:22349009-22417764,+
chr4 80293101 80293318 cne.213111.X chr4 80224227 80305222 chr5:29173084-29186158,-
chr4 80541558 80541717 cne.213180.GN chr4 80418542 80553413 chr5:29074829-29133135,-
chr4 80756338 80756568 cne.213234.X chr4 80635936 80826984 chr5:29037812-29066189,-
chr4 85372637 85372929 cne.213872.X chr4 85210867 85452664 chr21:13240975-13281934,+
chr4 112591440 112591831 cne.216902.FSTK chr4 112546775 112635417 chr14:40878515-40894114,-
chr4 144543920 144544080 cne.220097.GAN chr4 144361126 144556050 chr1:34409109-34483252,+
chr4 147413141 147413426 cne.220536.FS chr4 147409768 147434836 chr1:35181882-35215398,+
chr4 147488219 147488450 cne.220556.GAN chr4 147439353 147508459 chr1:35222080-35259172,+
chr4 151768579 151769340 cne.221366.X chr4 151741898 151798501 chr1:20922391-20928550,+
chr5 2222963 2223329 cne.226031.FSK chr5 2194307 2246678 Zv7_NA3070:5026-16302,+
chr5 2275722 2276117 cne.226049.SK chr5 2260011 2306138 Zv7_NA3070:24288-28938,+
chr5 6549951 6550020 cne.226747.ST chr5 6544469 6653087 chr19:18623293-18679126,-
chr5 51329483 51330010 cne.230045.S chr5 51320423 51349015 chr5:39687013-39696832,+
chr5 51375243 51376174 cne.230059.X chr5 51349615 51410016 chr5:39697420-39708397,+
chr5 75089778 75090030 cne.232822.X chr5 75034253 75463296 chr5:34260664-34299267,-
chr5 92660914 92661846 cne.235869.FSTK chr5 92642558 92763345 chr5:46882555-46917484,-
chr5 93245855 93246080 cne.236133.Z chr5 93244328 93247755 chr5:46582900-46594997,-
chr5 94088381 94088794 cne.236410.X chr5 94076353 94137712 chr5:45982195-46007239,-
chr5 158342862 158343155 cne.245323.GAN chr5 158339226 158419321 chr14:39225765-39269638,+
chr6 41607594 41607820 cne.253545.GAN chr6 41600161 41631347 chr11:19773493-19811460,-
chr6 41647282 41647397 cne.253563.GN chr6 41641706 41660482 chr11:19685297-19733113,-
chr6 41758691 41758759 cne.253584.GA chr6 41755858 41759076 chr11:19418848-19428090,-
chr6 157550091 157550308 cne.268027.X chr6 157547265 157552430 chr20:2941372-2948889,+
chr7 1387428 1387650 cne.269016.X chr7 1318391 1401653 chr3:41074309-41199482,-
chr7 27167886 27167998 cne.273330.X chr7 27158927 27169741 chr19:10512347-10517088,-
chr7 69299049 69299320 cne.276864.FSK chr7 69274817 69313793 chr10:21516222-21522725,-
chr7 69777211 69777408 cne.277100.SK chr7 69748867 69865764 chr10:21232754-21295230,-
chr8 65701957 65702060 cne.292389.STK chr8 65695890 65773297 chr24:23078701-23098944,+
chr9 16753996 16754347 cne.305671.X chr9 16723504 16793468 chr1:24630622-24675417,+
chr9 78584359 78584710 cne.309350.X chr9 78543463 78606747 chr23:44476919-44488622,-
chr9 118176575 118176800 cne.313525.X chr9 118164843 118179619 chr5:56717757-56731040,+
chrX 85277508 85278035 cne.322968.X chrX 85175632 85288094 chr21:27196738-27224174,+