Merge remote-tracking branch 'upstream/maintable-beta' into fixdragan…

…drop

* upstream/maintable-beta:
  Update java-string-similarity from 1.0.1 -> 1.1.0
  Update log4j from 2.10.0 -> 2.11.0
  Update guava from 24.0 -> 24.1
  New Crowdin translations (#3853)
  Fetcher refactorings
  Fix ScienceDirect fetcher #3854
  Fix Google Scholar fetcher test
  Fix DBLP fetcher tests
  Move migration to top level package
  New Crowdin translations (#3851)
  Update mysql-connector from 5.1.45 -> 5.1.46
  Update mockito-core from 2.15.0 -> 2.16.0
  New translations JabRef_en.properties (Spanish)
  New translations Menu_en.properties (Spanish)
  First available entry selected after pressing ESC as well
  Pressing ESC now clears search field

build.gradle

@@ -105,7 +105,7 @@ dependencies {
     compile "org.libreoffice:unoil:5.4.2"
 
     compile 'com.github.bkromhout:java-diff-utils:2.1.1'
-    compile 'info.debatty:java-string-similarity:1.0.1'
+    compile 'info.debatty:java-string-similarity:1.1.0'
 
     antlr3 'org.antlr:antlr:3.5.2'
     compile 'org.antlr:antlr-runtime:3.5.2'
@@ -114,13 +114,13 @@ dependencies {
     compile 'org.antlr:antlr4-runtime:4.7.1'
 
     // VersionEye states that 6.0.5 is the most recent version, but http://dev.mysql.com/downloads/connector/j/ shows that as "Development Release"
-    compile 'mysql:mysql-connector-java:5.1.45'
+    compile 'mysql:mysql-connector-java:5.1.46'
 
     compile 'com.impossibl.pgjdbc-ng:pgjdbc-ng:0.7.1'
 
     compile 'net.java.dev.glazedlists:glazedlists_java15:1.9.1'
 
-    compile 'com.google.guava:guava:24.0-jre'
+    compile 'com.google.guava:guava:24.1-jre'
 
     // JavaFX stuff
     compile 'com.airhacks:afterburner.fx:1.7.0'
@@ -142,10 +142,10 @@ dependencies {
 
     // >1.8.0-beta is required for java 9 compatibility
     compile 'org.slf4j:slf4j-api:1.8.0-beta1'
-    compile 'org.apache.logging.log4j:log4j-slf4j-impl:2.10.0'
-    compile 'org.apache.logging.log4j:log4j-jcl:2.10.0'
-    compile 'org.apache.logging.log4j:log4j-api:2.10.0'
-    compile 'org.apache.logging.log4j:log4j-core:2.10.0'
+    compile 'org.apache.logging.log4j:log4j-slf4j-impl:2.11.0'
+    compile 'org.apache.logging.log4j:log4j-jcl:2.11.0'
+    compile 'org.apache.logging.log4j:log4j-api:2.11.0'
+    compile 'org.apache.logging.log4j:log4j-core:2.11.0'
 
     // need to use snapshots as the stable version is from 2013 and doesn't support v1.0.1 CitationStyles
     compile 'org.citationstyles:styles:1.0.1-SNAPSHOT'
@@ -162,9 +162,9 @@ dependencies {
     testRuntime 'org.junit.jupiter:junit-jupiter-engine:5.1.0'
     testRuntime 'org.junit.vintage:junit-vintage-engine:5.1.0'
     testCompile 'org.junit.platform:junit-platform-launcher:1.1.0'
-    testRuntime 'org.apache.logging.log4j:log4j-core:2.10.0'
-    testRuntime 'org.apache.logging.log4j:log4j-jul:2.10.0'
-    testCompile 'org.mockito:mockito-core:2.15.0'
+    testRuntime 'org.apache.logging.log4j:log4j-core:2.11.0'
+    testRuntime 'org.apache.logging.log4j:log4j-jul:2.11.0'
+    testCompile 'org.mockito:mockito-core:2.16.0'
     testCompile 'com.github.tomakehurst:wiremock:2.15.0'
     testCompile 'org.assertj:assertj-swing-junit:3.8.0'
     testCompile 'org.reflections:reflections:0.9.11'

src/main/java/org/jabref/gui/importer/actions/MergeReviewIntoCommentAction.java

@@ -4,7 +4,7 @@
 
 import org.jabref.gui.BasePanel;
 import org.jabref.logic.importer.ParserResult;
-import org.jabref.logic.migrations.MergeReviewIntoCommentMigration;
+import org.jabref.migrations.MergeReviewIntoCommentMigration;
 import org.jabref.model.entry.BibEntry;
 
 public class MergeReviewIntoCommentAction implements GUIPostOpenAction {

src/main/java/org/jabref/gui/search/GlobalSearchBar.java

@@ -27,6 +27,7 @@
 import javafx.scene.control.ToolBar;
 import javafx.scene.control.Tooltip;
 import javafx.scene.control.cell.TextFieldListCell;
+import javafx.scene.input.KeyCode;
 import javafx.scene.input.KeyEvent;
 import javafx.scene.input.MouseButton;
 import javafx.scene.layout.BorderPane;
@@ -136,11 +137,17 @@ public void actionPerformed(ActionEvent e) {
         KeyBindingRepository keyBindingRepository = Globals.getKeyPrefs();
         addEventFilter(KeyEvent.KEY_PRESSED, event -> {
             Optional<KeyBinding> keyBinding = keyBindingRepository.mapToKeyBinding(event);
-            if (keyBinding.isPresent() && keyBinding.get().equals(KeyBinding.GLOBAL_SEARCH)) {
-                globalSearch.setSelected(true);
-                searchPreferences.setGlobalSearch(globalSearch.isSelected());
-                updateOpenCurrentResultsTooltip(globalSearch.isSelected());
-                focus();
+            if (keyBinding.isPresent()) {
+                if (keyBinding.get().equals(KeyBinding.GLOBAL_SEARCH)) {
+                    globalSearch.setSelected(true);
+                    searchPreferences.setGlobalSearch(globalSearch.isSelected());
+                    updateOpenCurrentResultsTooltip(globalSearch.isSelected());
+                    focus();
+                } else if (keyBinding.get().equals(KeyBinding.CLEAR_SEARCH)) {
+                    // Clear search and select first entry, if available
+                    clearSearch();
+                    frame.getCurrentBasePanel().getMainTable().getSelectionModel().selectFirst();
+                }
             }
         });
 
@@ -204,6 +211,7 @@ public void actionPerformed(ActionEvent e) {
                 searchField,
                 currentResults
         );
+
         this.setAlignment(Pos.CENTER_LEFT);
     }
 

src/main/java/org/jabref/logic/importer/fetcher/OpenAccessDoi.java

@@ -20,7 +20,7 @@
 /**
  * A fulltext fetcher that uses <a href="https://oadoi.org/">oaDOI</a>.
  *
- * @implSpec API is documented at https://oadoi.org/api/v2
+ * @implSpec API is documented at http://unpaywall.org/api/v2
  */
 public class OpenAccessDoi implements FulltextFetcher {
     private static String API_URL = "https://api.oadoi.org/v2/";

src/main/java/org/jabref/logic/importer/fetcher/ScienceDirect.java

@@ -21,6 +21,7 @@
 import org.jsoup.Jsoup;
 import org.jsoup.nodes.Document;
 import org.jsoup.nodes.Element;
+import org.jsoup.select.Elements;
 import org.slf4j.Logger;
 import org.slf4j.LoggerFactory;
 
@@ -53,7 +54,16 @@ public Optional<URL> findFullText(BibEntry entry) throws IOException {
                             .referrer("http://www.google.com")
                             .ignoreHttpErrors(true).get();
 
+                    // Retrieve PDF link from meta data (most recent)
+                    Elements metaLinks = html.getElementsByAttributeValue("name", "citation_pdf_url");
+
+                    if (!metaLinks.isEmpty()) {
+                        String link = metaLinks.first().attr("content");
+                        return Optional.of(new URL(link));
+                    }
+
                     // Retrieve PDF link (old page)
+                    // TODO: can possibly be removed
                     Element link = html.getElementById("pdfLink");
 
                     if (link != null) {
@@ -62,6 +72,7 @@ public Optional<URL> findFullText(BibEntry entry) throws IOException {
                         return pdfLink;
                     }
                     // Retrieve PDF link (new page)
+                    // TODO: can possibly be removed
                     String url = html.getElementsByClass("pdf-download-btn-link").attr("href");
 
                     if (url != null) {

src/main/java/org/jabref/logic/migrations/MergeReviewIntoCommentMigration.java → src/main/java/org/jabref/migrations/MergeReviewIntoCommentMigration.java

@@ -1,4 +1,4 @@
-package org.jabref.logic.migrations;
+package org.jabref.migrations;
 
 import java.util.List;
 import java.util.Objects;

src/main/resources/l10n/JabRef_el.properties

@@ -14,10 +14,13 @@
 %0\ matches\ the\ term\ <b>%1</b>=%0 ταιριάζει τον όρο <b>%1</b>
 
 <field\ name>=<όνομα πεδίου>
+<HTML>Could\ not\ find\ file\ '%0'<BR>linked\ from\ entry\ '%1'</HTML>=<HTML>δεν μπορούσε να βρει το αρχείο «%0«<BR> που συνδέεται με την εισαγωγή »%1»</HTML>
 
 <select>=<επιλογή>
 
 <select\ word>=<επιλογή λέξης>
+Abbreviate\ journal\ names\ of\ the\ selected\ entries\ (ISO\ abbreviation)=Συμπτύξτε τα ονόματα περιοδικών για τις επιλεγμένες καταχωρήσεις (ISO σύντμηση)
+Abbreviate\ journal\ names\ of\ the\ selected\ entries\ (MEDLINE\ abbreviation)=Συμπτύξτε τα ονόματα περιοδικών για τις επιλεγμένες καταχωρήσεις (MEDLINE σύντμηση)
 
 Abbreviate\ names=Ονόματα συντομογραφιών
 Abbreviated\ %0\ journal\ names.=Ονόματα συντομογραφιών %0 περιοδικών.
@@ -32,13 +35,21 @@ Accept=Αποδοχή
 
 Accept\ change=Αποδοχή αλλαγής
 
+Action=Ενέργεια
 
+What\ is\ Mr.\ DLib?=Τι είναι ο κ. DLib;
 
 Add=Προσθήκη
 
+Add\ a\ (compiled)\ custom\ Importer\ class\ from\ a\ class\ path.=Προσθέστε μια compiled, custom κλάση importer από ένα class path.
+The\ path\ need\ not\ be\ on\ the\ classpath\ of\ JabRef.=Το μονοπάτι δεν χρειάζεται να είναι στο classpath του JabRef.
 
+Add\ a\ (compiled)\ custom\ Importer\ class\ from\ a\ ZIP-archive.=Προσθέστε μια compiled, custom κλάση importer από ένα ZIP αρχείο.
+The\ ZIP-archive\ need\ not\ be\ on\ the\ classpath\ of\ JabRef.=Το αρχείο ZIP-δεν χρειάζεται να είναι στο classpath του JabRef.
 
+Add\ a\ regular\ expression\ for\ the\ key\ pattern.=Προσθέσετε μια κανονική έκφραση (regular expression) για το βασικό μοτίβο (key pattern).
 
+Add\ selected\ entries\ to\ this\ group=Προσθήκη επιλεγμένων καταχωρήσεων σε αυτήν την ομάδα
 
 Add\ from\ folder=Προσθήκη από φάκελο
 
@@ -61,85 +72,138 @@ Added\ string=Προστέθηκε string
 
 Advanced=Για προχωρημένους
 All\ entries=Όλες entries
+All\ entries\ of\ this\ type\ will\ be\ declared\ typeless.\ Continue?=Όλες οι καταχωρήσεις αυτού του τύπου θα δηλωθούν χωρίς τύπο. Συνέχεια;
 
 All\ fields=Όλα τα πεδία
 
+Always\ reformat\ BIB\ file\ on\ save\ and\ export=Πάντα να διαμορφώνεται το BIB αρχείο κατά την αποθήκευση και εξαγωγή
 
+A\ SAX\ exception\ occurred\ while\ parsing\ '%0'\:=Μια εξαίρεση SAX παρουσιάστηκε κατά την ανάλυση των «%0»\:
 
 and=και
+and\ the\ class\ must\ be\ available\ in\ your\ classpath\ next\ time\ you\ start\ JabRef.=και η κλάση θα πρέπει να είναι διαθέσιμη στο classpath την επόμενη φορά που θα ξεκινήσετε το JabRef
 
+any\ field\ that\ matches\ the\ regular\ expression\ <b>%0</b>=οποιοδήποτε πεδίο που ταιριάζει με την κανονική έκφραση (regular expression) <b>%0</b>
 
 Appearance=Εμφάνιση
 
+Append=Προσθήκη
+Append\ contents\ from\ a\ BibTeX\ library\ into\ the\ currently\ viewed\ library=Προσθέστε το περιεχόμενο από μια βιβλιοθήκη BibTeX στη βιβλιοθήκη που προβάλλεται
 
+Append\ library=Προσθήκη βιβλιοθήκης
 
+Append\ the\ selected\ text\ to\ BibTeX\ field=Προσθήκη του επιλεγμένου κειμένου σε πεδίο BibTeX
 Application=Εφαρμογή
 
+Apply=Εφαρμογή
 
+Arguments\ passed\ on\ to\ running\ JabRef\ instance.\ Shutting\ down.=Οι παράμετροι περάστηκαν στην τρέχουσα εκτέλεση JabRef. Γίνεται τερματισμός.
 
+Assign\ new\ file=Ανάθεση νέου αρχείου
 
+Assign\ the\ original\ group's\ entries\ to\ this\ group?=Αντιστοίχιση των αρχικών καταχωρήσεων σε αυτή την ομάδα;
 
+Assigned\ %0\ entries\ to\ group\ "%1".=Αντιχτοιχήθηκαν %0 καταχωρήσεις στην ομάδα "%1".
 
+Assigned\ 1\ entry\ to\ group\ "%0".=Αντιχτοιχήθηκε 1 καταχώρηση στην ομάδα "%0".
 
+Attach\ URL=Επισυνάψετε URL
 
 
+Autodetect\ format=Αυτόματος εντοπισμός μορφής (format)
 
+Autogenerate\ BibTeX\ keys=Αυτόματη παραγωγή BibTeX
 
+Autolink\ files\ with\ names\ starting\ with\ the\ BibTeX\ key=Αυτόματος σύνδεσμος αρχείων με ονόματα που ξεκινούν με το κλειδί BibTeX
 
+Autolink\ only\ files\ that\ match\ the\ BibTeX\ key=Αυτόματος σύνδεσμος μόνο των αρχείων που ταιριάζουν με το κλειδί BibTeX
 
+Automatically\ create\ groups=Αυτόματη δημιουργία ομάδων
 
+Automatically\ remove\ exact\ duplicates=Αφαιρέστε αυτόματα ακριβή αντίγραφα
 
+Allow\ overwriting\ existing\ links.=Να επιτρέπεται η αντικατάσταση υπαρχόντων συνδέσεων.
 
+Do\ not\ overwrite\ existing\ links.=Να μην επιτρέπεται η αντικατάσταση υπαρχόντων συνδέσεων.
 
+AUX\ file\ import=AUX εισαγωγή αρχείου
 
+Available\ export\ formats=Διαθέσιμες μορφές (format) εξαγωγής
 
+Available\ BibTeX\ fields=Διαθέσιμα πεδία BibTeX
 
+Available\ import\ formats=Διαθέσιμες μορφές (format) εισαγωγής
 
+Background\ color\ for\ optional\ fields=Χρώμα φόντου για τα προαιρετικά πεδία
 
+Background\ color\ for\ required\ fields=Χρώμα φόντου για τα απαιτούμενα πεδία
 
+Backup\ old\ file\ when\ saving=Δημιουργία αντιγράφων ασφαλείας παλιού αρχείου κατά την αποθήκευση
 
+%0\ source=%0 προέλευση
 
+Broken\ link=Κατεστραμμένος σύνδεσμος
 
 Browse=Περιήγηση
 
 by=από
+The\ conflicting\ fields\ of\ these\ entries\ will\ be\ merged\ into\ the\ 'Comment'\ field.=Τα διφορούμενα πεδία από αυτές τις καταχωρήσεις θα συγχωνευθούν στο πεδίο 'Σχόλιο'.
 
 Cancel=Ακύρωση
 
+Cannot\ add\ entries\ to\ group\ without\ generating\ keys.\ Generate\ keys\ now?=Δεν είναι δυνατό να προσθέσετε καταχωρήσεις σε ομάδα χωρίς τη δημιουργία κλειδιών. Δημιουργία κλειδιών τώρα;
 
+Cannot\ merge\ this\ change=Δεν είναι δυνατό να συγχωνευτεί αυτή η αλλαγή
 
+case\ insensitive=Χωρίς διάκριση πεζών - κεφαλαίων γραμμάτων 
 
+case\ sensitive=διαφοροποίηση πεζών-κεφαλαίων
 
+Case\ sensitive=Διαφοροποίηση πεζών-κεφαλαίων
 
+change\ assignment\ of\ entries=αλλαγή εκχώρησης των καταχωρήσεων
 
+Change\ case=Αλλαγή πεζών-κεφαλαίων
 
+Change\ entry\ type=Αλλάξτε τύπου εγγραφής
+Change\ file\ type=Αλλαγή τύπου αρχείου
 
 
+Change\ of\ Grouping\ Method=Αλλαγή μεθόδου ομαδοποίησης
 
+change\ preamble=αλλαγή εισαγωγής
 
+Change\ table\ column\ and\ General\ fields\ settings\ to\ use\ the\ new\ feature=Αλλαγή στήλης πίνακα και Γενικά πεδία ρυθμίσεων για χρήση της νέας λειτουργίας
 
 Changed\ language\ settings=Αλλαγή ρυθμίσεων γλώσσας
 
+Changed\ preamble=Η αλλαγή εισαγωγής ολοκληρώθηκε
 
 Check\ existing\ file\ links=Έλεγχος συνδέσμων υπάρχοντων αρχείων
 
 Check\ links=Έλεγχος συνδέσμων
 
+Cite\ command=Εντολή αναφοράς
 
+Class\ name=Όνομα κλάσης
 
 Clear=Καθαρισμός
 
 Clear\ fields=Καθαρισμός πεδίων
 
 Close=Κλείσιμο
+Close\ others=Κλείισιμο άλλων
 Close\ all=Κλείσιμο όλων
 
 Close\ dialog=Κλείσμο διαλόγου
 
+Close\ the\ current\ library=Κλείσιμο της τρέχουσας βιβλιοθήκης
 
 Close\ window=Κλείσιμο παραθύρου
 
+Closed\ library=Κλειστή βιβλιοθήκη
 
+Color\ codes\ for\ required\ and\ optional\ fields=Κώδικες χρωμάτων για απαιτούμενα και προεραιτικά πεδία
 
 
 Column\ width=Μήκος στήλης
@@ -462,7 +526,9 @@ Manage\ external\ file\ types=Διαχείριση εξωτερικού τυπο
 Open\ file=Άνοιγμα αρχείου
 
 
+Connect\ to\ shared\ database=Σύνδεση σε κοινόχρηστη Βάση Δεδομένων
 
+Open\ terminal\ here=Άνοιγμα τερματικού εδώ
 
 
 
@@ -502,6 +568,7 @@ Open\ file=Άνοιγμα αρχείου
 
 
 
+Pull\ changes\ from\ shared\ database=Τραβήξτε αλλαγές από την κοινόχρηστη βάση δεδομένων
 
 
 
@@ -740,6 +807,8 @@ Copy\ BibTeX\ key\ and\ title=Αντιγραφή BibTeX και τίτλου
 
 
 Focus\ entry\ table=Επικεντρωμένη εισαγωγή πίνακα
+Import\ into\ current\ library=Εισαγωγή στη τρέχουσα βιβλιοθήκη
+Import\ into\ new\ library=Εισαγωγή σε νέα βιβλιοθήκη
 Resolve\ duplicate\ BibTeX\ keys=Resolve διπλότυπων BibTeX keys
 Save\ all=Αποθήκευση όλων
 
@@ -780,11 +849,13 @@ Connect=Σύνδεση
 
 
 
+Look\ up\ full\ text\ documents=Αναζητήστε πλήρη έγγραφα κειμένου
 
 
 
 
 
+Copy\ BibTeX\ key\ and\ link=Αντιγραφή BibTeX και συνδέσμου (link)
 
 
 
@@ -795,6 +866,8 @@ Connect=Σύνδεση
 
 
 
+Default\ table\ font\ size=Προεπιλεγμένη γραμματοσειρά πίνακα
+Show\ document\ viewer=Εμφάνιση προβολέα εγγράφου