GoBi WinterSemester 2016-17

#Beschreibung Die High-throughput Sequenzierung (next generation sequencing, NGS) Technik und die darauf basierende Messung der Genexpression (RNS-seq) verdrängt in biologischen Experimenten mehr und mehr die Messungen mit Microarray und DNA-chips. Die durch NGS und speziell durch RNA-seq gewonnenen Daten erlauben neben klassischen Analysen (differentielle Genexpression) auch speziellere Analysen wie z.B. zum (differentielles) alternatives Splicing, zur Detektion von Mutationen/Deletionen und zum Auffinden von bisher unbekannte transkripierten genomischen Bereiche. Entsprechend gehört das Know-how mit solchen Daten umzugehen, sie zu analysieren und daraus neue Erkentnisse zu gewinnen zu den Grundkenntnissen bzw. Anforderungen für Bioinformatikerinnen. Im Praktikum werden Grundlagen der zugrundeliegenden Experimente besprochen und Methoden zur Analyse von gemessenen Sequenzierungsdaten eingeführt und implementiert. Das Ziel des Praktikums ist, dass jeder Teilnehmer am Ende des Praktikums sowohl Know-how alsauch eine Toolbox zur Analyse von RNA-seq zur Verfügung hat, um einen beliebiges RNA-seq Datensatz praktisch zu analysieren und daraus wissenschaftliche Erkentnisse zu gewinnen.