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Feat gbif parser #1

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Feat gbif parser #1

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+330 −5

Conversation

pierre56
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@pierre56 pierre56 commented Jul 4, 2024 •
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GBIF Parser

Suite a la rencontre geonature, j'ai creusé le sujet et j'ai réussi a avoir un POC fonctionnel pour l'intégration d'une donnée provenant de Inaturalist via l'api du GBIF.

Pour le moment je pars d'une observation et je récupère toutes les infos disponibles dont les métadonnées.
j'insère le strict minimum, tout le mapping est a faire.

Résultat

image

image

image

image

Pb

je n'arrive pas a :

  • trouver l'uuid de l'occurence
  • trouver les effectifs de l'occurence
  • Avoir la correspondance cd_nom, différent champs mais aucun qui correspond a taxref

donnée ex : https://api.gbif.org/v1/occurrence/4407389321

Améliorations

  • Ajouter un système de sélection des id via dataset, organisme ou territoire (si possible combiner)
  • Mapping a faire (de nombreux champs variables selon les obs avec complétion variable )
  • Insertion des organismes si non présent en bdd
  • gestion des médias multiples

Je vous laisse tester et si possible aider pour le mapping et trouver les infos manquantes 😄

pierre56 added 6 commits July 3, 2024 10:46
@pierre56
init v0
fbc363b 
gbif parser
@pierre56
V0.1
ff0a76f
@pierre56
V0.2
fd7391f
@pierre56
V1
d249d14 
Intégration d'une donnée Inaturalist issue du gbif.
Fonctionne avec l'id d'occurence et récupére les métadonnées associées.
A améliorer pour boucler sur une liste d'id issue d'une recherche, JDD ou/et territoire
Mapping entièrement a faire et ajouter l'équivalent d'un coalesce sur les champs
@pierre56
Update README.md
af2e871 
aide install
a modifier en version x.x.x quand il y aura plus le rc1
@pierre56
Update README.md
cad23e6
@TheoLechemia
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Member

Salut,
Merci pour la PR !
J'ai plein de questions ;)
Si tu veux ont peut en parler sur matrix (je viens de te pinguer)

pierre56 added 2 commits July 8, 2024 12:04
@pierre56
V1.1
a9c1689 
Sélection JDD + geom ok
Need help pour intégration de la function taxref
@pierre56
V2.0
eb1e1cd 
Version fonctionnelle avec taxonomie
Il manque l'uuid de l'obs pour être utilisable en prod
Ainsi que l'effectif qui est pour le moment a 1
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