O projeto Vis_Zoo propõe visualizações de bases de dados de coleções de biodiversidade, originalmente desenhadas para bases do PPGZoo-Museu Nacional-UFRJ. Neste repositório encontram-se os códigos referentes às versões atualizadas das visualizações propostas inicialmente na Fase 1 do projeto e incorporadas em um aplicativo web. As tecnologias utilizadas para o desenvolvimento são, principalmente: Altair, Pandas, Python e Streamlit.
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Coordenação:
- Asla Medeiros e Sá, FGV EMAp;
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Desenvolvimento:
- 2023: Este repositório: Atualizações das visualizações desenvolvidas como trabalho de Iniciação Científica da FGV EMAp por Carlos Cesar O. Fonseca;
- 2022: Aplicativo web desenvolvido por Pierre Haslee, por ocasião de visita de pesquisa à Universidade de Brighton, UK;
- 2021: VisZoo - Fase 1: trabalho de Mestrado da FGV EMAp do aluno Franklin Alves de Oliveira, documentado na dissertação Visualização de coleções científicas digitais de biodiversidade: um framework em Altair, Python, defendida em março de 2021, orientado por Asla Medeiros e Sá. Um exemplo de gráfico proposto pode ser acessado aqui.
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Colaboradores:
- Karina Rodriguez Echavarria, University of Brighton, UK;
- Bruno Schneider.
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Curadores e técnicos de coleções zoológicas do PPGZoo - Museu Nacional - UFRJ.
- Cristiana Silveira Serejo - Carcinologia;
- Paulo Passos, Manoela Woitovicz Cardoso e Pedro Pinna - Herpetologia;
- Joana Zanol e Camila Messias - Polychaeta.
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2022 - Camila Simões M. A. Messias, Franklin Alves de Oliveira, Monique Cristina dos Santos, Asla Medeiros e Sá and Joana Zanol - New perspectives of Polychaeta collection database from National Museum/UFRJ using information visualization techniques to analyze and manage biological collection presented in SILPOLY 2022, Puerto Varas, Chile, on 22-25 November 2022.
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2022 - Asla Medeiros e Sá, Franklin Alves de Oliveira and Bruno Schneider, Karina Rodriguez Echavarria, Cristiana Silveira Serejo: Visually Overviewing Biodiversity Open Data Digital Collections, ODAK 2022: Symposium on Open Data and Knowledge for a Post-Pandemic Era, Brighton, UK.
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2021 - Asla Medeiros e Sá, Franklin Alves de Oliveira e Cristiana Silveira Serejo: Visualização de Informação como Ferramenta de Apoio à Curadoria de Dados em Coleções Biológicas, Revista Museologia & Interdiciplinariedade, v10, n. especial 2021.
Neste Repositório se encontra o código com o Server "VizZoo"
Para criar um ambiente que suporte o server:
- Ter instalado python na máquina
- Instalar as bibliotecas necessárias (a lista delas se encontra em
requeriments.txt
)
Para a execução:
- Abra o prompt do ambiente python que já suporta o server
- Caminhe até o a pasta com o arquivo
- Execute
streamlit run streamlit_app.py