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from bs4 import BeautifulSoup
import requests
import pandas as pd
import time
import ollama
import inquirer
# from transformers import pipeline
# import torch
###################################################################################
# Função para fazer perguntas para o usuário
###################################################################################
def obter_parametros_busca():
questions = [
inquirer.Text("query",
message="Query de busca",
),
inquirer.Text("n_artigos",
message="Número de artigos que deseja extrair",
),
inquirer.List("ordenamento",
message="Escolha o critério de ordenação",
choices=["Mais novos", "Mais antigos", "Mais relevantes", "Mais citados", "Mais acessados"],
),
inquirer.Confirm("quer_recorte_temporal",
message="Deseja especificar um recorte temporal?",
)
]
answers = inquirer.prompt(questions)
query = answers["query"]
n_artigos = int(answers["n_artigos"])
ordenamento = answers["ordenamento"]
quer_recorte_temporal = answers["quer_recorte_temporal"]
if quer_recorte_temporal:
questions_anos = [
inquirer.Text("ano_inicial",
message="Ano inicial",
),
inquirer.Text("ano_final",
message="Ano final",
),
]
answers_anos = inquirer.prompt(questions_anos)
ano_inicial = answers_anos.get("ano_inicial")
ano_final = answers_anos.get("ano_final")
anos = (ano_inicial, ano_final)
else:
anos = None
return query, n_artigos, ordenamento, quer_recorte_temporal, anos
###################################################################################
# Função para obter parâmetros para resumo
###################################################################################
def obter_parametros_resumo():
questions = [
inquirer.List("tipo_resumo",
message="Escolha o tipo de resumo",
choices=["Resumir com o texto todo (rápido, mas mais superficial)", "Resumir por seção (lento, mas mais detalhado)", "Ambos"],
),
inquirer.Confirm("prompt_resumo",
message="Deseja especificar o prompt de resumo para o modelo? (Padrão é 'Resuma o seguinte texto:')",
)
]
answers = inquirer.prompt(questions)
tipo_resumo = answers["tipo_resumo"]
prompt_resumo = answers["prompt_resumo"]
if prompt_resumo:
questions_prompt = [
inquirer.Text("prompt_resumo",
message="Prompt de resumo",
),
]
answers_prompt = inquirer.prompt(questions_prompt)
prompt_resumo = answers_prompt.get("prompt_resumo")
else:
prompt_resumo = "Resuma o seguinte texto: "
questions_server = [
inquirer.Confirm("quer_server",
message="Deseja especificar algum servidor para executar o modelo remotamente?",
)
]
answers_server = inquirer.prompt(questions_server)
quer_server = answers_server.get("server")
if quer_server:
questions_server = [
inquirer.Text("server",
message="Endereço do servidor",
),
]
answers_server = inquirer.prompt(questions_server)
server = answers_server.get("server")
else:
server = None
return tipo_resumo, prompt_resumo, server
###################################################################################
# Função para buscar artigos no site da SciELO
###################################################################################
def buscar_artigos(consulta, n_artigos_pg = 15, pg = 1, sorting=None, anos = None):
"""
Função para buscar artigos no site da SciELO.
Parâmetros:
- consulta: string # termo ou termos de pesquisa
- n_artigos_pg: int # número de artigos por página
- pg: int # número da página
- sorting: string # critério de ordenação
- anos: int ou list of int # anos de publicação dos artigos
"""
url = 'https://search.scielo.org/'
# Tratamento do parâmetro sorting
if sorting == 'Mais novos':
sorting = 'YEAR_DESC'
elif sorting == 'Mais antigos':
sorting = 'YEAR_ASC'
elif sorting == 'Mais relevantes':
sorting = 'RELEVANCE'
elif sorting == 'Mais citados':
sorting = 'CITED_DESC'
elif sorting == 'Mais acessados':
sorting = 'ACCESS_DESC'
elif sorting == None:
sorting = ''
params = {
"q": consulta,
"lang": "pt",
"count": n_artigos_pg,
"output": "site",
"sort": sorting,
"format": "summary",
"page": pg
}
if anos:
if isinstance(anos, list):
params.update({f"filter[year_cluster][]": ano} for ano in anos)
else:
params[f"filter[year_cluster][]"] = anos
response = requests.get(url, params=params)
if response.status_code == 200:
return response.text
else:
print(f"Erro ao acessar a página: {response.status_code}")
return None
###################################################################################
# Função para buscar artigos no site da SciELO
###################################################################################
def extrair_artigos(html):
"""
Função para extrair os dados dos artigos da página de busca.
Parâmetros:
- html: string
"""
# Parse do HTML
soup = BeautifulSoup(html, 'html.parser')
# Encontrar os elementos (divs) que contêm os dados dos artigos
artigos = soup.find_all('div', class_='item')
resultados = []
for artigo in artigos:
try:
# Encontrar e extrair o título
titulo_elem = artigo.find('strong', class_='title')
titulo = titulo_elem.text.strip() if titulo_elem else 'Título não encontrado'
# Encontrar e extrair o link
link_elem = artigo.find('a')
link = link_elem['href'] if link_elem else 'Link não encontrado'
# Encontrar e extrair o DOI
doi_elem = artigo.find('div', class_='line metadata')
if doi_elem:
doi_link_elem = doi_elem.find('a')
doi = doi_link_elem['href'] if doi_link_elem else 'DOI não encontrado'
else:
doi = 'DOI não encontrado'
# Encontrar e extrair o resumo
abstract_elem = artigo.find('div', id=lambda x: x and x.endswith('_pt'))
abstract = abstract_elem.text.strip() if abstract_elem else 'Resumo em português não encontrado'
# Encontrar e extrair os nomes dos autores
autores_elementos = artigo.find_all('a', class_='author')
autores = [autor.text for autor in autores_elementos]
if not autores:
autores.append('Autores não encontrados')
# Adicionar os dados ao DataFrame
resultados.append({
'titulo': titulo,
'autores': autores,
'doi': doi,
'link': link,
'resumo': abstract
})
df = pd.DataFrame(resultados)
# Remover duplicatas com base no título, mantendo apenas a primeira ocorrência
df = df.drop_duplicates(subset='titulo', keep='first')
df = df.reset_index(drop=True)
except AttributeError as e:
print(f"Erro ao extrair artigo: {e}")
return df
###################################################################################
# Função para extrair o texto da seção de artigo de uma página da SciELO
###################################################################################
def extrair_secoes(link):
"""
Extrai o texto da seção de artigo de uma página da SciELO.
Parâmetros:
- link: string
"""
try:
# Requisição
response = requests.get(link)
# Aguardar 15 segundos antes de fazer a requisição
time.sleep(15)
if response.status_code == 200:
soup = BeautifulSoup(response.content, 'html.parser')
secao_artigo = soup.find('div', class_='articleSection', attrs={'data-anchor': 'Text'})
if secao_artigo:
elementos = secao_artigo.find_all(['h1', 'h2', 'h3', 'h4', 'h5', 'h6', 'p'])
# List to store the results
resultado = []
header = None
content = ''
for elemento in elementos:
# Handle <p><b></b></p> as headers
if elemento.name == 'p' and elemento.find('b'):
if header:
resultado.append({'header': header, 'content': content.strip()})
header = elemento.text.strip()
content = ''
# Handle headers
elif elemento.name.startswith('h'):
if header:
resultado.append({'header': header, 'content': content.strip()})
header = elemento.text.strip()
content = ''
else:
# Normal paragraph
# Remover os spans com class "ref"
for span in elemento.find_all('span', class_='ref'):
span.decompose()
content += elemento.text.strip() + ' '
# Append the last header-content pair
if header:
resultado.append({'header': header, 'content': content.strip()})
return resultado if resultado else 'Títulos e parágrafos não encontrados na seção de artigo'
else:
return 'Seção de artigo não encontrada'
else:
return 'Erro ao acessar a página'
except requests.exceptions.RequestException as e:
return f'Erro de requisição: {str(e)}'
except Exception as e:
return f'Erro: {str(e)}'
###################################################################################
# Função para extrair texto completo
###################################################################################
def extrair_texto_completo(secoes):
"""
Extrai o texto completo dos artigos.
Parâmetros:
- df: DataFrame
"""
# Adicionar uma coluna ao DataFrame para armazenar o texto completo
texto_completo = ''
for secao in secoes:
texto_completo += f"{secao['header']}\n{secao['content']}\n\n"
return texto_completo
###################################################################################
# Funções para resumir artigo (texto completo ou por seções)
###################################################################################
def resumir_artigo_texto_completo(texto_completo, prompt_resumo="Resuma o seguinte texto: ", server=None):
"""
Resumir o texto completo do artigo. Usa o modelo llama3 a partir do ollama.
Parâmetros:
- texto_completo: string
"""
prompt = prompt_resumo + texto_completo
if server:
client = ollama.Client(host=server)
response = client.chat(
model = 'llama3',
messages = [{'role': 'user', 'content': prompt}]
)
else:
response = ollama.chat(
model = 'llama3',
messages = [{'role': 'user', 'content': prompt}]
)
return response['message']['content']
def resumir_artigo_secoes(secoes, prompt_resumo="Resuma o seguinte texto: ", server=None):
"""
Resumir o texto completo do artigo. Usa o modelo llama3 a partir do ollama.
Parâmetros:
- secoes: list
"""
if server:
client = ollama.Client(host=server)
resumo = ''
for secao in secoes:
prompt = prompt_resumo + secao['content']
response = client.chat(
model = 'llama3',
messages = [{'role': 'user', 'content': prompt}]
)
resumo_mais_heading = f"{secao['heading']}\n{response['message']['content']}\n\n"
resumo += resumo_mais_heading
else:
resumo = ''
for secao in secoes:
prompt = prompt_resumo + secao['content']
response = ollama.chat(
model = 'llama3',
messages = [{'role': 'user', 'content': prompt}]
)
resumo_mais_heading = f"{secao['heading']}\n{response['message']['content']}\n\n"
resumo += resumo_mais_heading
return resumo
# def resumir_artigo(secoes, summarization_model):
# for secao in secoes:
# content = secao['content']
# if len(content) > 2000:
# chunks = [content[i:i+2000] for i in range(0, len(content), 2000)]
# summaries = [summarization_model(chunk, max_length=30, min_length = 10)[0]['summary_text'] for chunk in chunks]
# secao['resumo'] = " ".join(summaries)
# else:
# secao['resumo'] = summarization_model(content, max_length=30, min_length = 10)[0]['summary_text']
# resumo_completo = " ".join(secao['resumo'] for secao in secoes)
# return resumo_completo
# def resumir_artigo(secoes, summarization_model):
# for secao in secoes:
# content = secao['content']
# if len(content) > 2000:
# chunks = [content[i:i+2000] for i in range(0, len(content), 2000)]
# summaries = [summarization_model(chunk, max_length=int(len(chunk)//3), min_length = 10)[0]['summary_text'] for chunk in chunks]
# secao['resumo'] = " ".join(summaries)
# else:
# secao['resumo'] = summarization_model(content, max_length=int(len(content)//3), min_length = 10)[0]['summary_text']
# #resumo_completo = " ".join(secao['resumo'] for secao in secoes)
# return secoes