Move citation tags in backmatter

content/citation-tags.tsv is now deprecated

content/90.back-matter.md

@@ -2,3 +2,344 @@
 
 <!-- Explicitly insert bibliography here -->
 <div id="refs"></div>
+
+<!-- Define citation tags below -->
+[@tag:Abe]: doi:10.1101/gr.634603
+[@tag:Abramoff2016_dr]: doi:10.1167/iovs.16-19964
+[@tag:Agarwal2015_targetscan]: doi:10.7554/eLife.05005
+[@tag:Aitchison2017]: url:http://papers.nips.cc/paper/6940-model-based-bayesian-inference-of-neural-activity-and-connectivity-from-all-optical-interrogation-of-a-neural-circuit
+[@tag:Alipanahi2015_predicting]: doi:10.1038/nbt.3300
+[@tag:AltaeTran2016_one_shot]: doi:10.1021/acscentsci.6b00367
+[@tag:Amit2017_breast_mri]: doi:10.1117/12.2249981
+[@tag:Asgari]: doi:10.1371/journal.pone.0141287
+[@tag:blast]: doi:10.1016/S0022-2836(05)80360-2
+[@tag:Angermueller2016_dl_review]: doi:10.15252/msb.20156651
+[@tag:Angermueller2016_single_methyl]: doi:10.1186/s13059-017-1189-z
+[@tag:Angermueller2017]: doi:10.1186/s13059-017-1189-z
+[@tag:Artemov2016_clinical]: doi:10.1101/095653
+[@tag:Arvaniti2016_rare_subsets]: doi:10.1101/046508
+[@tag:Bach2015_on]: doi:10.1371/journal.pone.0130140
+[@tag:Bahdanu2014_neural]: arxiv:1409.0473
+[@tag:Baskin2015_drug_disc]: doi:10.1080/17460441.2016.1201262
+[@tag:Bar2015_nonmed_tl]: doi:10.1117/12.2083124
+[@tag:Barash2010_splicing_code]: doi:10.1038/nature09000
+[@tag:Baxt1991_myocardial]: doi:10.7326/0003-4819-115-11-843
+[@tag:BeaulieuJones2016_ehr_encode]: doi:10.1016/j.jbi.2016.10.007
+[@tag:Bengio2015_prec]: arxiv:1412.7024
+[@tag:Berezikov2011_mirna]: doi:10.1038/nrg3079
+[@tag:Bergstra2011_hyper]: url:https://papers.nips.cc/paper/4443-algorithms-for-hyper-parameter-optimization.pdf
+[@tag:Bergstra2012_random]: url:http://www.jmlr.org/papers/v13/bergstra12a.html
+[@tag:Bracken2016_mirna]: doi:10.1038/nrg.2016.134
+[@tag:Boza]: doi:10.1371/journal.pone.0178751
+[@tag:Buggenthin2017_imaged_lineage]: doi:10.1038/nmeth.4182
+[@tag:Burlina2016_amd]: doi:10.1109/ISBI.2016.7493240
+[@tag:Chatterjee2018]: arxiv:1807.09617
+[@tag:Caruana2014_need]: arxiv:1312.6184
+[@tag:Caruana2015_intelligible]: doi:10.1145/2783258.2788613
+[@tag:Chaudhary2017_multiom_liver_cancer]: doi:10.1101/114892
+[@tag:Che2015_distill]: arxiv:1512.03542
+[@tag:Che2016_rnn]: arxiv:1606.01865
+[@tag:Chen2015_hashing]: arxiv:1504.04788
+[@tag:Chen2016_exprs_yeast]: doi:10.1186/s12859-015-0852-1
+[@tag:Chen2016_gene_expr]: doi:10.1093/bioinformatics/btw074
+[@tag:Chen2015_trans_species]: doi:10.1093/bioinformatics/btv315
+[@tag:Choi2016_retain]: arxiv:1608.05745
+[@tag:Choi2016_gram]: arxiv:1611.07012
+[@tag:Chollet2016_xception]: arxiv:1610.02357
+[@tag:Christensen2009]: doi:10.1371/journal.pgen.1000602
+[@tag:Chryssolouris1996_confidence]: doi:10.1109/72.478409
+[@tag:Ciresan2013_mitosis]: doi:10.1007/978-3-642-40763-5_51
+[@tag:Coates2013_cots_hpc]: url:http://www.jmlr.org/proceedings/papers/v28/coates13.html
+[@tag:Codella2016_ensemble_melanoma]: arxiv:1610.04662
+[@tag:Consortium2012_encode]: doi:10.1038/nature11247
+[@tag:CudNN]: arxiv:1410.0759
+[@tag:Dahl2014_multi_qsar]: arxiv:1406.1231
+[@tag:Darst2018]: doi:10.1186/s12863-018-0646-3
+[@tag:Dean2012_nips_downpour]: url:http://research.google.com/archive/large_deep_networks_nips2012.html
+[@tag:DeepChem]: url:https://github.com/deepchem/deepchem
+[@tag:Deming2016_genetic]: arxiv:1605.07156
+[@tag:Ding]: doi:10.1186/s12859-015-0753-3
+[@tag:Ditzler]: doi:10.1186/s12859-015-0793-8
+[@tag:Ditzler2]: doi:10.1109/TNNLS.2014.2320415
+[@tag:Ditzler3]: doi:10.1109/TNB.2015.2461219
+[@tag:Dhungel2015_struct_pred_mamm]: doi:10.1007/978-3-319-24553-9_74
+[@tag:Dhungel2016_mamm]: doi:10.1007/978-3-319-46723-8_13
+[@tag:Dhungel2017_mamm_min_interv]: doi:10.1016/j.media.2017.01.009
+[@tag:Dream_tf_binding]: url:https://www.synapse.org/#!Synapse:syn6131484/wiki/402026
+[@tag:Dragonn]: url:http://kundajelab.github.io/dragonn/
+[@tag:Duvenaud2015_graph_conv]: url:http://papers.nips.cc/paper/5954-convolutional-networks-on-graphs-for-learning-molecular-fingerprints
+[@tag:Edwards2015_growing_pains]: doi:10.1145/2771283
+[@tag:Ehran2009_visualizing]: url:http://www.iro.umontreal.ca/~lisa/publications2/index.php/publications/show/247
+[@tag:Elephas]: url:https://github.com/maxpumperla/elephas
+[@tag:Errington2014_reproducibility]: doi:10.7554/eLife.04333
+[@tag:Eser2016_fiddle]: doi:10.1101/081380
+[@tag:Esfahani2016_melanoma]: doi:10.1109/EMBC.2016.7590963
+[@tag:Essinger2010_taxonomic]: doi:10.1109/IJCNN.2010.5596644
+[@tag:Esteva2017_skin_cancer_nature]: doi:10.1038/nature21056
+[@tag:Faruqi]: url:http://alifar76.github.io/sklearn-metrics/
+[@tag:Feinberg2018]: doi:10.1056/NEJMra1402513
+[@tag:Finnegan2017_maximum]: doi:10.1101/105957
+[@tag:Fong2017_perturb]: doi:10.1109/ICCV.2017.371
+[@tag:Fraga2005]: doi:10.1073/pnas.0500398102
+[@tag:Fu2019]: doi:10.1109/TCBB.2019.2909237
+[@tag:Gal2015_dropout]: arxiv:1506.02142
+[@tag:Gaublomme2015_th17]: doi:10.1016/j.cell.2015.11.009
+[@tag:Gargeya2017_dr]: doi:10.1016/j.ophtha.2017.02.008
+[@tag:Gawad2016_singlecell]: doi:10.1038/nrg.2015.16
+[@tag:Geras2017_multiview_mamm]: doi:10.1038/nrg.2015.16
+[@tag:Gerstein2016_scaling]: doi:10.1186/s13059-016-0917-0
+[@tag:Ghandi2014_enhanced]: doi:10.1371/journal.pcbi.1003711
+[@tag:Ghosh1992_sequence]: doi:10.1117/12.140112
+[@tag:Glorot2011_domain]: url:http://citeseerx.ist.psu.edu/viewdoc/summary?doi=10.1.1.231.3442
+[@tag:Goldsborough2017_cytogan]: doi:10.1101/227645
+[@tag:Gomezb2016_automatic]: arxiv:1610.02415v1
+[@tag:Graphlab]: doi:10.14778/2212351.2212354
+[@tag:Groop1986_islet]: doi:10.2337/diab.35.2.237
+[@tag:Gultepe2014_sepsis]: doi:10.1136/amiajnl-2013-001815
+[@tag:Gulshan2016_dt]: doi:10.1001/jama.2016.17216
+[@tag:Gupta2015_exprs_yeast]: doi:10.1101/031906
+[@tag:Gupta2015_prec]: arxiv:1502.02551
+[@tag:Guetterman]: url:http://www.fasebj.org/content/30/1_Supplement/406.3
+[@tag:Hadjas2015_cc]: arxiv:1504.04343
+[@tag:He2015_images]: arxiv:1512.03385
+[@tag:Hinton2006_autoencoders]: doi:10.1126/science.1127647
+[@tag:Hinton2015_dark_knowledge]: arxiv:1503.02531
+[@tag:Hinton2015_dk]: arxiv:1503.02531v1
+[@tag:Hochreiter]: doi:10.1093/bioinformatics/btm247
+[@tag:Hoff]: doi:10.1093/nar/gkp327
+[@tag:Horton1992_assessment]: doi:10.1093/nar/20.16.4331
+[@tag:Horvath2013]: doi:10.1186/gb-2013-14-10-r115
+[@tag:Horvath2014]: doi:10.1073/pnas.1412759111
+[@tag:Houseman2012]: doi:10.1186/1471-2105-13-86
+[@tag:Houseman2016]: doi:10.1186/s12859-016-1140-4
+[@tag:Hubara2016_qnn]: arxiv:1609.07061
+[@tag:Huddar2016_predicting]: doi:10.1109/ACCESS.2016.2618775
+[@tag:Hughes2016_macromol_react]: doi:10.1021/acscentsci.6b00162
+[@tag:Iglovikov2017_baa]: doi:10.1101/234120
+[@tag:Islam2018]: doi:10.1186/s12919-018-0121-1
+[@tag:Ithapu2015_efficient]: doi:10.1016/j.jalz.2015.01.010
+[@tag:Jafari2016_skin_lesions]: doi:10.1007/s11548-017-1567-8
+[@tag:Jha2017_integrative_models]: doi:10.1101/104869
+[@tag:Johnson2017_integ_cell]: arxiv:1705.00092
+[@tag:JuanMateu2016_t1d]: doi:10.1530/EJE-15-0916
+[@tag:Kahng2017_activis]: arxiv:1704.01942
+[@tag:Kalinin2018_pgx]: arxiv:1801.08570
+[@tag:Karlin]: doi:10.1128/jb.179.12.3899-3913.1997
+[@tag:Karpathy2015_visualizing]: arxiv:1506.02078
+[@tag:Katzman2016_deepsurv]: arxiv:1606.00931
+[@tag:Kearnes2016_admet]: arxiv:1606.08793
+[@tag:Kearnes2016_graph_conv]: doi:10.1007/s10822-016-9938-8
+[@tag:Kelley2016_basset]: doi:10.1101/gr.200535.115
+[@tag:Keras]: url:https://github.com/fchollet/keras
+[@tag:Kizek]: doi:10.1016/j.bjid.2015.08.013
+[@tag:Kindermans2016_investigating]: arxiv:1611.07270
+[@tag:Knights]: doi:10.1111/j.1574-6976.2010.00251.x
+[@tag:Koh2016_denoising]: doi:10.1101/052118
+[@tag:Koh2017_understanding]: arxiv:1703.04730
+[@tag:Kooi2016_mamm_lesions]: doi:10.1016/j.media.2016.07.007
+[@tag:Kooi2017_mamm_tl]: doi:10.1002/mp.12110
+[@tag:Korfiatis2017]: doi:10.1007/s10278-017-0009-z
+[@tag:Kraus2017_deeploc]: doi:10.15252/msb.20177551
+[@tag:Kresovich2019]: doi:10.1093/jnci/djz020
+[@tag:Krizhevsky2013_nips_cnn]: url:https://papers.nips.cc/paper/4824-imagenet-classification-with-deep-convolutional-neural-networks.pdf
+[@tag:Krizhevsky2014_weird_trick]: arxiv:1404.5997
+[@tag:Kwabi-Addo2007]: doi:10.1158/1078-0432.CCR-07-0085
+[@tag:Khwaja2017]: doi:10.1109/BIOCAS.2017.8325078
+[@tag:Khwaja2018]: arxiv:1810.01243
+[@tag:Lacey2016_dl_fpga]: arxiv:1602.04283
+[@tag:Laird2010]: doi:10.1038/nrg2732
+[@tag:Lakhani2017_radiography]: doi:10.1148/radiol.2017162326
+[@tag:Lanchantin2016_motif]: arxiv:1608.03644
+[@tag:Lee2016_deeptarget]: arxiv:1603.09123v2
+[@tag:Lee2016_emr_oct_amd]: doi:10.1101/094276
+[@tag:Lei2016_rationalizing]: arxiv:1606.04155
+[@tag:Leibig2016_dr]: doi:10.1101/084210
+[@tag:Levy2019]: doi:10.1101/692665
+[@tag:Levy-Jurgenson2018]: doi:10.1101/491357
+[@tag:Li2014_minibatch]: doi:10.1145/2623330.2623612
+[@tag:Li2016_variation]: doi:10.1126/science.aad9417
+[@tag:Liang2015_exprs_cancer]: doi:10.1109/TCBB.2014.2377729
+[@tag:Lin2017_why_dl_works]: arxiv:1608.08225v3
+[@tag:Lipton2016_missing]: arxiv:1606.04130
+[@tag:Lipton2015_lstm]: arxiv:1510.07641
+[@tag:Litjens2016_histopath_survey]: doi:10.1038/srep26286
+[@tag:Litjens2017_medimage_survey]: doi:10.1016/j.media.2017.07.005
+[@tag:Lisboa2006_review]: doi:10.1016/j.neunet.2005.10.007
+[@tag:Liu2013]: doi:10.1038/nbt.2487
+[@tag:Liu]: doi:10.1371/journal.pone.0053253
+[@tag:Liu2016_towards]: arxiv:1604.07043
+[@tag:Liu2016_sc_transcriptome]: doi:10.12688/f1000research.7223.1
+[@tag:Lodato2015_neurons]: doi:10.1126/science.aab1785
+[@tag:Lowe2012_kaggle]: url:http://blogs.sciencemag.org/pipeline/archives/2012/12/11/did_kaggle_predict_drug_candidate_activities_or_not
+[@tag:lmat]: doi:10.1093/bioinformatics/btt389
+[@tag:Lundberg2016_an]: arxiv:1611.07478
+[@tag:Lusci2015_irv]: doi:10.1186/s13321-015-0110-6
+[@tag:Lusci2013_rnn]: doi:10.1021/ci400187y
+[@tag:Ma2015_qsar_merck]: doi:10.1021/ci500747n
+[@tag:Maaten2008_tsne]: url:http://www.jmlr.org/papers/v9/vandermaaten08a.html
+[@tag:Mahendran2014_understanding]: arxiv:1412.0035
+[@tag:Mahendran2016_salient]: doi:10.1007/978-3-319-46466-4_8
+[@tag:Mahendran2016_visualizing]: doi:10.1007/s11263-016-0911-8
+[@tag:Mahmood]: doi:10.1016/S0140-6736(13)61752-3
+[@tag:Mapreduce]: doi:10.1145/1327452.1327492
+[@tag:Mayr2016_deep_tox]: doi:10.3389/fenvs.2015.00080
+[@tag:McHardy]: doi:10.1038/nmeth976
+[@tag:McHardy2]: doi:10.7717/peerj.1603
+[@tag:Meissner2008]: doi:10.1038/nature07107
+[@tag:Metaphlan]: doi:10.1038/nmeth.2066
+[@tag:Meng2016_mllib]: arxiv:1505.06807
+[@tag:Min2016_deepenhancer]: doi:10.1109/BIBM.2016.7822593
+[@tag:Momeni2018]: doi:10.1101/438341
+[@tag:Moritz2015_sparknet]: arxiv:1511.06051
+[@tag:Mordvintsev2015_inceptionism]: url:http://googleresearch.blogspot.co.uk/2015/06/inceptionism-going-deeper-into-neural.html
+[@tag:Mrzelj]: url:https://repozitorij.uni-lj.si/IzpisGradiva.php?id=85515
+[@tag:matis]: doi:10.1016/S0097-8485(96)80015-5
+[@tag:nbc]: doi:10.1093/bioinformatics/btq619
+[@tag:Murdoch2017_automatic]: arxiv:1702.02540
+[@tag:Nazor2012]: doi:10.1016/j.stem.2012.02.013
+[@tag:Nemati2016_rl]: doi:10.1109/EMBC.2016.7591355
+[@tag:Ni2018]: doi:10.1101/385849
+[@tag:Nguyen2014_adversarial]: arxiv:1412.1897v4
+[@tag:Ngiam2011]: url:https://ai.stanford.edu/~ang/papers/icml11-MultimodalDeepLearning.pdf
+[@tag:Nie2016_3d_survival]: doi:10.1007/978-3-319-46723-8_25
+[@tag:NIH2016_genome_cost]: url:https://www.genome.gov/27565109/the-cost-of-sequencing-a-human-genome/
+[@tag:Nih_curiosity]: url:https://www.nigms.nih.gov/Education/Documents/curiosity.pdf
+[@tag:Olivecrona2017_drug_design]: arxiv:1704.07555
+[@tag:Osokin2017_biogan]: arxiv:1708.04692
+[@tag:onecodex]: url:https://www.onecodex.com/
+[@tag:Papernot2017_pate]: url:https://openreview.net/forum?id=HkwoSDPgg
+[@tag:Park2016_deepmirgene]: arxiv:1605.00017
+[@tag:Parnamaa2017]: doi:10.1534/g3.116.033654
+[@tag:Pan2018]: doi:10.1101/438218
+[@tag:Pawlowski2016]: doi:10.1101/085118
+[@tag:Peng2019]: doi:10.1101/527044
+[@tag:Pereira2016_docking]: doi:10.1021/acs.jcim.6b00355
+[@tag:PerezSianes2016_screening]: doi:10.1007/978-3-319-40126-3_2
+[@tag:Phymm]: doi:10.1038/nmeth.1358
+[@tag:Poplin2016_deepvariant]: doi:10.1101/092890
+[@tag:Pratt2016_dr]: doi:10.1016/j.procs.2016.07.014
+[@tag:Quach2017]: doi:10.18632/aging.101168
+[@tag:Quang2017_factor]: doi:10.1101/151274
+[@tag:Qin2017_onehot]: doi:10.1371/journal.pcbi.1005403
+[@tag:Qiu2017_graph_embedding]: doi:10.1101/110668
+[@tag:Qiu2018]: doi:10.1101/406066
+[@tag:Ragoza2016_protein]: arxiv:1612.02751
+[@tag:RAD2010_view_cc]: doi:10.1145/1721654.1721672
+[@tag:Radford_dcgan]: arxiv:1511.06434v2
+[@tag:Rajkomar2017_radiographs]: doi:10.1007/s10278-016-9914-9
+[@tag:Rakhlin2018_histology]: doi:10.1101/259911
+[@tag:Ramsundar2015_multitask_drug]: arxiv:1502.02072
+[@tag:Ranganath2016_deep]: arxiv:1608.02158
+[@tag:Raina2009_gpu]: doi:10.1145/1553374.1553486
+[@tag:Relton2010]: doi:10.1371/journal.pmed.1000356
+[@tag:Ribeiro2016_lime]: arxiv:1602.04938
+[@tag:Robertson2005]: doi:10.1038/nrg1655
+[@tag:Rogers2010_fingerprints]: doi:10.1021/ci100050t
+[@tag:Roth2015_view_agg_cad]: doi:10.1109/TMI.2015.2482920
+[@tag:Romero2017_diet]: url:https://openreview.net/pdf?id=Sk-oDY9ge
+[@tag:Rosenberg2015_synthetic_seqs]: doi:10.1016/j.cell.2015.09.054
+[@tag:Russakovsky2015_imagenet]: doi:10.1007/s11263-015-0816-y
+[@tag:Sa2015_buckwild]: pmcid:PMC4907892
+[@tag:Salas2018_GR]: doi:10.1101/gr.233213.117
+[@tag:Salas2018]: doi:10.1186/s13059-018-1448-7
+[@tag:Salzberg]: doi:10.1186/1471-2105-11-544
+[@tag:Schatz2010_dna_cloud]: doi:10.1038/nbt0710-691
+[@tag:Schmidhuber2014_dnn_overview]: doi:10.1016/j.neunet.2014.09.003
+[@tag:Scotti2016_missplicing]: doi:10.1038/nrg.2015.3
+[@tag:Segata]: doi:10.1371/journal.pcbi.1004977
+[@tag:Segler2017_drug_design]: arxiv:1701.01329
+[@tag:Seide2014_parallel]: doi:10.1109/ICASSP.2014.6853593
+[@tag:Setty2015_seqgl]: doi:10.1371/journal.pcbi.1004271
+[@tag:Selvaraju2016_grad]: arxiv:1610.02391
+[@tag:Serden]: doi:10.1016/S0168-8510(02)00208-7
+[@tag:Shaham2016_batch_effects]: doi:10.1093/bioinformatics/btx196
+[@tag:Shapely]: doi:10.1515/9781400881970-018
+[@tag:Shen2017_medimg_review]: doi:10.1146/annurev-bioeng-071516-044442
+[@tag:Shin2016_cad_tl]: doi:10.1109/TMI.2016.2528162
+[@tag:Shrikumar2017_learning]: arxiv:1704.02685
+[@tag:Shrikumar2017_reversecomplement]: doi:10.1101/103663
+[@tag:Simonyan2013_deep]: arxiv:1312.6034
+[@tag:Singh2017_attentivechrome]: arxiv:1708.00339
+[@tag:Singh2016_deepchrome]: arxiv:1607.02078
+[@tag:Singh2016_tsk]: doi:10.1109/TCBB.2016.2609918
+[@tag:Silver2016_alphago]: doi:10.1038/nature16961
+[@tag:Sonderby]: doi:10.1007/978-3-319-21233-3_6
+[@tag:Soueidan]: doi:10.1515/metgen-2016-0001
+[@tag:Spark]: doi:10.1145/2934664
+[@tag:Speech_recognition]: url:http://www.businessinsider.com/ibm-edges-closer-to-human-speech-recognition-2017-3
+[@tag:Springenberg2014_striving]: arxiv:1412.6806
+[@tag:Stein2010_cloud]: doi:10.1186/gb-2010-11-5-207
+[@tag:Stenstrom2005_latent]: doi:10.2337/diabetes.54.suppl_2.S68
+[@tag:Stormo2000_dna]: doi:10.1093/bioinformatics/16.1.16
+[@tag:Stratnikov]: doi:10.1186/2049-2618-1-11
+[@tag:Strobelt2016_visual]: arxiv:1606.07461
+[@tag:Su2015_gpu]: arxiv:1507.01239
+[@tag:Subramanian2016_bace1]: doi:10.1021/acs.jcim.6b00290
+[@tag:Sun2016_ensemble]: arxiv:1606.00575
+[@tag:Sundararajan2017_axiomatic]: arxiv:1703.01365
+[@tag:Sutskever]: arxiv:1409.3215
+[@tag:Swamidass2009_irv]: doi:10.1021/ci8004379
+[@tag:Tan2014_psb]: doi:10.1142/9789814644730_0014
+[@tag:Tan2015_adage]: doi:10.1128/mSystems.00025-15
+[@tag:Tan2016_eadage]: doi:10.1101/078659
+[@tag:TAC-ELM]: doi:10.1142/S0219720012500151
+[@tag:TensorFlow]: arxiv:1603.04467
+[@tag:Teschendorff2017]: doi:10.2217/epi-2016-0153
+[@tag:Tian2019]: doi:10.1186/s12864-019-5488-5
+[@tag:Titus2017]: doi:10.1093/hmg/ddx275
+[@tag:Torracinta2016_deep_snp]: doi:10.1101/097469
+[@tag:Torracinta2016_sim]: doi:10.1101/079087
+[@tag:Tu1996_anns]: doi:10.1016/S0895-4356(96)00002-9
+[@tag:Unterthiner2014_screening]: url:http://www.bioinf.at/publications/2014/NIPS2014a.pdf
+[@tag:Vanhoucke2011_cpu]: url:https://research.google.com/pubs/pub37631.html
+[@tag:Vera2016_sc_analysis]: doi:10.1146/annurev-genet-120215-034854
+[@tag:Vervier]: doi:10.1093/bioinformatics/btv683
+[@tag:Wallach2015_atom_net]: arxiv:1510.02855
+[@tag:Wang2016_breast_cancer]: arxiv:1606.05718
+[@tag:Wang2016_methyl]: doi:10.1038/srep19598
+[@tag:Wang2016_protein_contact]: doi:10.1371/journal.pcbi.1005324
+[@tag:Wasson1985_clinical]: doi:10.1056/NEJM198509263131306
+[@tag:WayGreene2017_eval]: arxiv:1711.04828
+[@tag:WayGreene2017_tybalt]: doi:10.1101/174474
+[@tag:Wilhelm-Benartzi2013]: doi:10.1038/bjc.2013.496
+[@tag:Word2Vec]: arxiv:1301.3781
+[@tag:wgsquikr]: doi:10.1371/journal.pone.0091784
+[@tag:Wu2017_molecule_net]: doi:10.1039/C7SC02664A
+[@tag:Xiang]: doi:10.1016/S0167-9473(99)00098-5
+[@tag:Xiong2011_bayesian]: doi:10.1093/bioinformatics/btr444
+[@tag:Xiong2015_splicing_code]: doi:10.1126/science.1254806
+[@tag:Xu2015_show]: arxiv:1502.03044
+[@tag:Yasushi2016_cgbvs_dnn]: doi:10.1002/minf.201600045
+[@tag:yok]: doi:10.1186/1471-2105-12-20
+[@tag:Yoon2016_cancer_reports]: doi:10.1007/978-3-319-47898-2_21
+[@tag:Yosinski2014]: url:https://papers.nips.cc/paper/5347-how-transferable-are-features-in-deep-neural-networks
+[@tag:Yosinksi2015_understanding]: arxiv:1506.06579
+[@tag:Yu2016_melanoma_resnet]: doi:10.1109/TMI.2016.2642839
+[@tag:Zeiler2013_visualizing]: arxiv:1311.2901
+[@tag:Zeng2015]: doi:10.1186/s12859-015-0553-9
+[@tag:Zeng2016_convolutional]: doi:10.1093/bioinformatics/btw255
+[@tag:Zhang2015_multitask_tl]: doi:10.1145/2783258.2783304
+[@tag:Zhang2017_generalization]: arxiv:1611.03530v2
+[@tag:Zhang2019]: doi:10.1186/s12885-019-5932-6
+[@tag:Zhou2015_deep_sea]: doi:10.1038/nmeth.3547
+[@tag:Zhu2016_advers_mamm]: doi:10.1101/095786
+[@tag:Zhu2016_mult_inst_mamm]: doi:10.1101/095794
+[@tag:Zintgraf2017_visualizing]: arxiv:1702.04595
+[@tag:goodfellow2016deep]: url:http://www.deeplearningbook.org/
+[@tag:li2016joint]: url:https://dl.acm.org/citation.cfm?id=3061018
+[@tag:world2004international]: url:http://www.who.int/classifications/icd/en/
+[@tag:ghahramani_protect]: arxiv:1707.02476
+[@tag:uncertainty_types]: arxiv:1703.04977
+[@tag:uncertainty_multi_task]: arxiv:1705.07115
+[@tag:guo_calibration]: arxiv:1706.04599
+[@tag:platt_scaling]: url:http://citeseer.ist.psu.edu/viewdoc/summary?doi=10.1.1.41.1639
+[@tag:out_dist_baseline]: arxiv:1610.02136
+[@tag:temp_out_dist]: arxiv:1706.02690
+[@tag:ai_safety]: arxiv:1606.06565
+[@tag:strong_adversary]: arxiv:1705.07263
+[@tag:retinopathy_uncertainty]: doi:10.1038/s41598-017-17876-z
+[@tag:bayesian_hypernets]: arxiv:1710.04759
+[@tag:mcclure_bayesian]: arxiv:1611.01639
+[@tag:uncertainty_ensembles]: arxiv:1612.01474
+[@tag:domain_adapt_uncertainty]: arxiv:1505.07818
+[@tag:gal_thesis]: url:http://www.cs.ox.ac.uk/people/yarin.gal/website/thesis/thesis.pdf