Taller: Uso de modelos de transmisión para simular la propagación de enfermedades en animales de producción 
¡Bienvenido! 👋
Durante este taller prenderás a usar modelos matemáticos para simular la propagación y control de enfermedades en animales de producción. Nuestro objetivo es ayudarte a comprender cómo estos modelos pueden apoyar la toma de decisiones antes, durante y después de una emergencia sanitaria animal.
El taller está enfocado en la aplicación práctica de modelos epidemiológicos, utilizando datos reales para simular brotes de fiebre aftosa (FMD).
🔍 Usaremos MHASpread: un modelo estocástico multinivel para la diseminación entre múltiples especies (versión 3.0). Este paquete de R permite definir parámetros de transmisión específicos por especie y simular dinámicas complejas, como movimientos entre granjas, traslados a mataderos, nacimientos y muertes.
Aprenderás paso a paso cómo usar MHASpread para simular la introducción y diseminación de la FMD, explorando herramientas epidemiológicas y computacionales dentro de un flujo de trabajo fácil de seguir.
Al finalizar este taller, podrás:
- 🧩 Comprender los principios básicos detrás del paquete MHASpread v3.0.
- 📈 Interpretar los resultados y salidas del modelo.
- 💉 Simular estrategias de control como despoblación, vacunación y trazabilidad.
- 🔄 Conocer otros modelos de transmisión aplicables a la salud animal.
| Tema | Actividad y asignación | Fecha |
|---|---|---|
| Presentaciones de talleres | Videollamada instalando R & RStudio. Introducción del taller y configuración de RStudio en tu computadora. | Octubre 28, 2025 |
| Comprobar los datos y el formato del modelo (NCSU y PANAFTOSA) | Videollamada para revisar los datos requeridos en el formato correcto para el modelado de enfermedades. | Noviembre 4, 2025 |
| Lectura: Una introducción práctica al modelado mecanicista de la transmisión de enfermedades en la ciencia veterinaria | Este documento asegura que todos los participantes tengan experiencia en modelado antes del taller. La publicación académica se puede encontrar aquí. | Noviembre 19, 2025 |
| Lectura: Simulación de la dinámica y el control de la fiebre aftosa en Bolivia | Este documento presenta un ejemplo de caso real del uso de MHASpread. La publicación académica se puede encontrar aquí. | Noviembre 26, 2025 |
Details
Trabajaremos con datos multiespecie (bovinos, porcinos y pequeños rumiantes) para explorar la aplicación real de los modelos. Los conjuntos de datos requeridos incluyen:
- Lista de granjas con ID único, ubicación geográfica (latitud y longitud) y número de animales por especie.
- Registros de natalidad y mortalidad por granja y especie.
- Movimientos entre granjas y hacia mataderos, incluyendo:
- Identificación única de origen y destino.
- Fecha del movimiento.
- Número de animales transportados por especie.
Cualquier computadora moderna (de los últimos 5 años) puede ejecutar R y RStudio sin problema. Sin embargo, recomendamos lo siguiente:
- 🖥️ Procesador: Intel Core i5 (6ª generación o superior) o AMD X8 @ 4GHz.
- 💾 Memoria RAM: mínimo 8 GB.
- 📂 Espacio libre en disco: 65 GB.
Nicolas Cardenas
Gustavo Machado
💻 Nicolas Cardenas 
- 📚 Modeling foot-and-mouth disease dissemination in Brazil and evaluating the effectiveness of control measures
- 📚 Foot-and-Mouth Disease in Bolivia: Simulation-Based Assessment of Control Strategies and Vaccination Requirements
- 📚 Integrating epidemiological and economic models to estimate the cost of simulated foot-and-mouth disease outbreaks in Brazil
Visita el sitio oficial del laboratorio para más recursos e investigaciones:
🔗 Machado-lab
