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問題報告
こちらの方でpyqubo>=1.0.0 とOpenJij (https://github.com/OpenJij/OpenJij) を同時にimportすると、linuxを使用した時にPythonがsegfaultでクラッシュする問題が起きる事象を確認しました。
原因
この原因はpybind11の旧バージョンに存在するバグであり、pybind11を用いた異なるバージョンのコンパイラでコンパイルされたモジュールを同時にimportするとSTLの互換性が取れないためにクラッシュするというものでした。ですので、OpenJijのみならず、pybind11を用いた他のライブラリと同時にimportしてもこの問題が発生する可能性があります。
関連するissueはこちらにあります。(pybind/pybind11#1262)
解決手法
pybind11>=2.4.0 以降であればこの問題は解決されているため、ビルドに用いるライブラリを2.5.0にすることで解決できると思います。
手元の環境でmanylinux1を用いてwheelを生成してみましたが、問題なく動作することを確認しています。
よろしくおねがいします。