增添了批处理绘制热图,请前往batch tab页。重构了rep_reduce
函数提取子dataframe。添加了默认图片的缓存。
-
采用Shiny Modules拆分重构
-
添加不同基因组id转换功能
-
尝试采用redis进行disk cache, Rstudio ref article
模块化拆分基本完成,添加了单细胞数据图像。
- 优化单细胞测序结果模块,细化绘图逻辑
添加了单细胞PCA降维图像,为单细胞模块建立了css文件,美化布局
- 为批处理提供更多功能
设置了服务器每日重启,为不同组织的表达量水平提供了热图用于批处理
- 修复批处理需要resize界面的奇怪bug,大概率是与响应式相关,暂时想不到解决方案。
新增了tool页面用于提供不同版本基因组之间的ID转换,暂时只提供G. hirsutum 中WHU v1基因组转HAU v1以及ZJU v2.1转HAU v1的功能。
- 提供更多基因组版本以供选择
- 整合不同版本基因组与拟南芥同于比对的数据
升级R4.1后出现
Warning: Error in <Anonymous>: 图形API版本不相符
129: <Anonymous>
127: startPNG
126: drawPlot
112: <reactive:plotObj>
96: drawReactive
83: renderFunc
82: output$plots-circa_plot_fine_interval
1: shiny::runApp
发现由于shiny::plotPNG
首先使用ragg
作为图形设备,install.packages('ragg')
后可正常使用。