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miguelpmachado committed Jul 9, 2018
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Showing 1 changed file with 62 additions and 69 deletions.
131 changes: 62 additions & 69 deletions modules/trueCoverage_rematch/listeria_monocytogenes.fasta
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@@ -1,92 +1,85 @@
>abcZ_75_previous_200_flanking
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>bglA_30_previous_200_flanking
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ATAAATTATCACAAAAAGACCTATACCAAGCTGTCCACCACGAACTTGTGGCGAGCGCGCTGGCTACAAAAATTGGTCA
>cat_43_previous_200_flanking
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GGTGATAACCAAAATTCAATGACAGCGGGACGTAAAGGACCTACTTTGATAGAAGATTATGTGCTTATTGAGAAATTGGC
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AAGCTTCTCAAATTCAAGCAAAAGAATTTAACCATGCAAGTCGTGATTTGTACGAAGCAATTGAAAATGGAGACTATCCT
GAATGGGATTTATATGTGCAAGTGTTGGATCCGAAAGACTTAGATAGCTTTGATTTCAATCCATTAGATGCTACAAAAGA
TTGGTT
>dapE_18_previous_200_flanking
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TGATTCGACTAATGGGCATGAAGAACAAGTTGCGAACTAT
TTGCAAAAGTTGTTAGCTGAACATGGTATTGAGTCCGAAAAGGTACAATACGACGTAGACAGAGCCAGCCTAGTAAGCGA
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GCGATGATTATTGCAATGATTGAGCTTCATGAAGAAAAACAAAAACTAAATGGCAAAATTAGATTATTAGCAACTGTTGG
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AACCGAGTGGACACCGGATTGTTTATGCGCATAAAGGTTCCATTAATTATACCGTTAAATCC
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AGAAAAATTCGTGAAATCAATTGATGCTACTAACGAAATATTAGGCGATTTTATTCATAATGTCACCGTAATTGATGGTG
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TGATTCGACTAATGGGCATGAAGAACAAGTTGCGAACTATTTGCAAAAGTTGTTAGCTGAACATGGTATTGAGTCCGAAA
AGGTACAATACGACGTAGACAGAGCCAGCCTAGTAAGCGAAATTGGTTCCAGTGACGAGAAAGTTTTGGCGTTTTCAGGG
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ATACGGACGCGGCGCAACGGATATGAAGTCAGGTCTAGCGGCGATGATTATTGCAATGATTGAGCTTCATGAAGAAAAAC
AAAAACTAAATGGCAAAATTAGATTATTAGCAACTGTTGGTGAAGAAGTCGGTGAACTTGGAGCTGAACAACTAACGCAA
AAAGGTTACGCAGATGATTTAGATGGTCTGATTATCGGCGAACCGAGTGGACACCGGATTGTTTATGCGCATAAAGGTTC
CATTAATTATACCGTTAAATCCACTGGTAAAAATGCCCATAGTTCGATGCCGGAATTTGGTGTGAATGCGATTGATAACT
TGCTGCTATTTTATAATGAAGTAGAAAAATTCGTGAAATCAATTGATGCTACTAACGAAATATTAGGCGATTTTATTCAT
AATGTCACCGTAATTGATGGTGGAAATCAAGTCAATAGTATCCCTGAAAAAGCACAACTGCA
>dat_13_previous_200_flanking
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AATTAACTATGCAAGGAGAGACTCGAGATGAAAGTATTAGTAAATAACCATTTAGTTGAAAGAGAAGATGCCACAGTTGA
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GAAGTAGTTCGTCTATATAATGGAAAATTCTTTACTTATAATGAACACATTGATCGCTTATATGCTAGTGCAGCAAAAAT
TGACTTAGTTATTCCTTATTCCAAAGAAGAGCTACGTGAATTACTTGAAAAATTAGTTGCCGAAAATAATATCAATACAG
GGAATGTCTATTTACAAGTGACTCGTGGTGTTCAAAACCCACGTAATCATGTAATCCCTGATGATTTCCCTCTAGAAGGC
GTTTTAACAGCAGCAGCTCGTGAAGTACCTAGAAACGAGCGTCAATTCGTTGAAGGTGGAACGGCGATTACAGAAGAAGA
TGTGCGCTGGTTACGCTGTGATATTAAGAGCTTAAACCTTTTAGGAAATATTCTAGCAAAAAATAAAGCACATCAACAAA
ATGCTTTGGAAGCTATTTTACATCGCGGGGAACAAGTAACGGAATGTTCCGCTTCAAACGTTTCTATTATT
AAAGATGGTGTATTATGGACGCATGCGGCAGATAACTTAATCTTAAATGGTATCACTCGTCAAGTTATCATTGATGTTGC
GAAAAAGAATGGCATTCCTGTTAAAGAAGCGGATTTCACTTTAACAGACCTTCGTGAAGCGGATGAAGTGTTCATTTCAA
GTACAACTATTGAAATTACACCTATTACGCATATTGACGG
CATTGAAGACCGCGGATATCAGTTTGGTGATGGTGTATATGAAGTAGTTCGTCTATATAATGGAAAATTCTTTACTTATA
ATGAACACATTGATCGCTTATATGCTAGTGCAGCAAAAATTGACTTAGTTATTCCTTATTCCAAAGAAGAGCTACGTGAA
TTACTTGAAAAATTAGTTGCCGAAAATAATATCAATACAGGGAATGTCTATTTACAAGTGACTCGTGGTGTTCAAAACCC
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TTAGGAAATATTCTAGCAAAAAATAAAGCACATCAACAAAATGCTTTGGAAGCTATTTTACATCGCGGGGAACAAGTAAC
GGAATGTTCCGCTTCAAACGTTTCTATTATTAAAGATGGTGTATTATGGACGCATGCGGCAGATAACTTAATCTTAAATG
GTATCACTCGTCAAGTTATCATTGATGTTGCGAAAAAGAATGGCATTCCTGTTAAAGAAGCGGATTTCACTTTAACAGAC
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>ldh_369_previous_200_flanking
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AGTAAACCGCAATATCAAAATCATGAAAGGCATTGTGGATGAAGTTATGGCAAGTGGGTTTGACGGTATTTTCCTAATCG
CGTCTAACCCAGTAGACATCTTAACTTACGCTACATGGAAATTCTCAGGTCTTCCAAAAGAACGCGTTATCGGTTCTGGA
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CAAAAGCAATTCTAAATAACGAAAATGCGATTTTGCCACTTTCTGTTTATTTAGATGGCCATTACGGTATGAACGATATT
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>lhkA_20_previous_200_flanking
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TTGTCGGTTCTATCGTGCTGAATTCACCTATTAGCGGGACCGAGCAAGTAATTGGTACGATTAATCGTTACATGTTCTAT
ACTATTTTACTTTCCATAACAGTAGCACTTATTCTTAGTGCGATTTTGTCCAAACTACAAGTGAACCGAATCAACAAACT
ACGAGCAGCGACGAAAGATGTTATTCAAGGTAACTACAAAGCCAGACTAAAAGAAAATAACTTTGATGAAATTGGCGCGC
TTGCGATTGATTTCAATAAGATGACTCAAACACTGGAGATTTCTCAAGAAGAAATTGAAAGACAAGAAAAACGGCGCCGT
CAGTTTATTGCTGATGTTTCTCATGAAATGCGTACCCCGC
AATTCATTATACAATCAAGAATGCCAACGACGAAACCATTTATCCAACACAAATGGACCAGCCTCTACCTAAAGACTTTT
CGATTTCTTCGGAAGATAAGAAAAAACTGGAAAGCGGCGAAACGGTTAGCAAGAAAATAGATAATCGATTCAATAGAGAA
ATGACGATTGTTTATGTGCCGATAATGGATGGTGATAAATTTGTCGGTTCTATCGTGCTGAATTCACCTATTAGCGGGAC
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CGATTTTGTCCAAACTACAAGTGAACCGAATCAACAAACTACGAGCAGCGACGAAAGATGTTATTCAAGGTAACTACAAA
GCCAGACTAAAAGAAAATAACTTTGATGAAATTGGCGCGCTTGCGATTGATTTCAATAAGATGACTCAAACACTGGAGAT
TTCTCAAGAAGAAATTGAAAGACAAGAAAAACGGCGCCGTCAGTTTATTGCTGATGTTTCTCATGAAATGCGTACCCCGC
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ATTGATACAGAAGCTAGACGTTTAACGAAACTAGTCAATGAAAATTTAGATTATGAAAAAATACGCAGTAACAAAATCAA

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